陈锐
- 作品数:33 被引量:81H指数:5
- 供职机构:天津市农业科学院更多>>
- 发文基金:转基因生物新品种培育专项天津市科技计划国家现代农业产业技术体系建设项目更多>>
- 相关领域:农业科学轻工技术与工程生物学文化科学更多>>
- 应用微滴数字PCR技术快速检测食用菌中沙门氏菌被引量:32
- 2017年
- 定量风险评估是整个风险评估体系的发展趋势和终极体现形式,而快速、准确、简便的定量技术则是保障整个体系顺利、有效完成的核心支撑。作者根据沙门氏菌inv A毒力基因序列,在前人对引物研究结果基础上,合成特异性引物和探针。以沙门氏菌标准菌株为研究对象,建立沙门氏菌微滴数字PCR的快速定量检测方法,并对其特异性、灵敏度、样品实测等关键指标与传统培养法进行对照验证。结果表明,所建立的微滴数字PCR方法具有较好的特异性,检测灵敏度可达到10~2CFU/m L,样品实测与传统国标法对比,二者符合率100%。所建立的沙门氏菌微滴数字PCR定量检测方法,可以快速、准确、直接地分析沙门氏菌的含量,无需构建质粒和标准曲线,避免了因标准曲线量值偏差而影响样品定值的准确性,所建立的方法为食源性沙门氏菌污染的快速定量检测提供了技术支撑,为微生物风险评估体系的完善奠定了基础。
- 赵新兰青阔陈锐朱珠刘娜王永
- 关键词:沙门氏菌
- 一种花椰菜品种鉴定的方法
- 本申请涉及一种花椰菜品种鉴定的方法,其基于820份花椰菜高代自交系重测序的结果,通过试验最终筛选出41个SNP位点和对应的KASP引物组可以实现花椰菜种质资源及品种的基因型检测,建立了首个花椰菜DNA指纹图谱,使得基因分...
- 姚星伟陈锐孙德岭杨迎霞吕明杰
- 利用DNA池技术提高基于InDel标记的种子纯度鉴定效率
- 2012年
- 为提高基于InDel-Pyrosequencing的黄瓜杂交种纯度检测通量,降低检测成本,本研究模拟10种DNA Pooling进行PCR、Pyrosequencing及等位基因频率分析。通过TTest分析不同Pooling间等位基因频率的差异性,确定3 Pooling为种子纯度检测最适Pooling数;建立3 Pooling-InDel-Pyrosequencing标准曲线,其R2达0.999 1;根据该标准曲线,检测黄瓜杂交品种"园中王"30粒杂交种种子纯度,结果为96.67%。本研究丰富了基于InDel-Pyrosequencing的黄瓜杂交种纯度检测技术体系。
- 兰青阔余景会赵新王永张桂华朱珠陈锐李欧静郭永泽程奕
- 关键词:INDEL标记黄瓜种子纯度鉴定
- 用于花椰菜品种津品81真实性或种子纯度鉴定的InDel标记引物及其鉴定方法
- 本发明公开了用于花椰菜品种津品81真实性或种子纯度鉴定的InDel标记引物及其鉴定方法。本发明通过对花椰菜品种‘津品81’的父母本重测序数据进行全基因组范围内分析,筛选并设计了特异性InDel位点并从中选出5对InDel...
- 程文娟郭俞彤杨迎霞孙德岭姚星伟陈锐
- 焦磷酸测序技术在4种食源性致病菌快速检测中的应用被引量:7
- 2013年
- 为建立一种利用焦磷酸测序技术检测和鉴定沙门氏菌(Salmonellla)、单核细胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes)、金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)和志贺氏菌(Shigella)的方法,通过对4种菌毒力靶基因特异性序列的同源性分析,设计出适合焦磷酸测序特异性扩增和测序的引物,摸索出最佳的焦磷酸测序反应体系和反应程序,并建立了4种食源性致病菌焦磷酸测序快速检测方法。此方法以传统国标法的前增菌为前提,而省去了后期生化验证的繁琐过程,大大缩短了检测时间,并且其准确性与传统生化验证完全一致,灵敏度可达10 CFU/mL。结果表明,作者建立的焦磷酸测序检测方法具有高效、快速、精准及操作简便等特点,为食源性致病菌的快速鉴定开辟了广阔的前景。
- 赵新王永兰青阔陈锐朱珠余景会李欧静郭永泽
- 关键词:食源性致病菌
- InDel标记引物组及其在花椰菜‘DX-108’品种或种子纯度鉴定中的应用
- 本发明公开了InDel标记引物组及其在花椰菜品种‘DX‑108’或种子纯度鉴定中的应用。本发明利用花椰菜品种‘DX‑108’的父母本重测序数据在全基因组范围内筛选差异InDel位点并设计特异性引物筛选得到12对InDel...
- 孙德岭姚星伟杨迎霞陈锐牛国保刘莉莉单晓政张小丽文正华江汉民
- 基于焦磷酸测序技术建立基因编辑水稻检测方法被引量:6
- 2020年
- 基因编辑技术发展迅速,但对应的检测方法较少。为寻找创建基因编辑作物适用的检测方法,以PL 3基因编辑水稻编辑位点为靶标,有效设计了焦磷酸测序的扩增引物及测序引物,并进行有效性检测,分别利用Sequence to Analyze等程序以及SNP和AQ两种模式完成了对PL 3基因的定性和定量检测试验,建立了PL 3基因编辑水稻编辑位点焦磷酸测序检测方法。结果表明,基于焦磷酸测序技术可以通过检测编辑位点从而将基因编辑型水稻与野生型水稻进行区分。与常规的转基因检测方法相比,该检测方法具有较好的准确性、高效性及高灵敏度等优点,在基因编辑型水稻编辑位点定性和定量检测分析方面具有很好的应用前景。
- 解美霞王燕赵新高越刘双陈锐兰青阔徐晓辉曹际娟王永
- 关键词:焦磷酸测序水稻
- 一种基于高分辨率熔解曲线的基因编辑水稻的鉴别方法
- 本发明公开了一种基于高分辨率熔解曲线的基因编辑水稻的鉴别方法,它是利用高分辨率熔解曲线技术对基因编辑水稻的突变碱基位点进行分析。该技术不需要荧光标记引物及电泳检测就可对已知短序列进行测序分析。本发明的检测方法具有较好的准...
- 于海涛赵新王燕王璐平陈锐兰青阔王永
- 花椰菜花球中花青素合成相关基因RT-qPCR内参基因的筛选被引量:1
- 2024年
- 花椰菜收获过程中花球变紫的现象与花青素含量密切相关,目前针对花椰菜花球里花青素合成途径中相关基因表达分析的内参基因尚未报道。本研究以花椰菜始终不变紫色的白色花球组织和变紫花球中的未变紫、浅紫和深紫花球组织为研究材料,采用RT-qPCR技术测定了6个候选内参基因在不同颜色花椰菜花球组织中的表达水平,用ΔCt法以及GeNorm、NormFinder、BestKeeper和RefFinder软件分析候选内参基因的稳定性。结果表明:花椰菜不同颜色花球组织中,6个候选内参基因的稳定性综合排名为SKIP16>ACT>PP2A>TUB>UBQ>EF1α。SKIP16基因综合稳定性排名第一,其次是ACT基因,均适合作为花椰菜花球组织中花青素合成途径相关基因研究的理想内参基因;geNorm软件通过计算配对变异值分析最适内参基因组合的数量为2个,综合选用SKIP16和ACT基因。本研究结果可作为分析花椰菜花球花青素合成途径中相关基因准确测定的参考依据。
- 张冠杨迎霞陆国清陈锐王倩王梦梦李荣姚星伟
- 关键词:花椰菜花青素内参基因RT-QPCR
- 基于Special-Base模型检测转基因作物nos/plamid构建特异性被引量:2
- 2012年
- 以转基因作物中常见的nos/plamid构建特异性序列为研究对象,通过同源性比较和焦磷酸测序dispensation order设计,建立Special-Base焦磷酸测序检测模型;利用转基因大豆Roundup Ready Soybean和转基因玉米Bt11、GA21、NK603等4种转基因作物为试验材料,针对nos/plamid构建特异性序列设计引物,经复合PCR扩增及焦磷酸测序,验证Special-Base焦磷酸测序检测模型有效性。结果表明:本研究建立的Special-Base焦磷酸测序模型能检测出样品中单一或多种转基因作物成分,提高了转基因作物检测的精确性、检测通量和自动化程度。
- 兰青阔王永赵新陈锐朱珠李欧静余景会郭永泽程奕
- 关键词:复合PCR焦磷酸测序