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国家科技支撑计划(2012BAD17B02)
国家科技支撑计划(2012BAD17B02) 作品数:17 被引量:148 H指数:9 相关作者: 孙洪仁 刘琳 吴灶和 简纪常 吴雅娜 更多>> 相关机构: 中国农业大学 广东海洋大学 广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室 更多>> 发文基金: 国家科技支撑计划 国家现代农业产业技术体系建设项目 公益性行业(农业)科研专项 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 更多>>
牙鲆经注射和浸泡免疫鳗弧菌灭活疫苗后7种免疫相关基因表达的变化 被引量:16 2014年 制备鳗弧菌(Vibrio anguillarum)全菌灭活疫苗,采用腹腔注射和浸泡两种方式分别免疫牙鲆(Paralichthys olivaceus),于免疫后0 h、4 h、8 h、12 h、24 h、48 h、72 h、96 h、7 d、14 d分别取牙鲆脾、头肾、鳃3种组织,提取mRNA,应用实时荧光定量PCR法检测3种组织中白介素(IL)-1β、肿瘤坏死因子(TNF)α、主要组织相容性复合体(MHC)MCHⅠ、MHCⅡ、T细胞表面受体CD4、T细胞表面受体CD8、免疫球蛋白(Ig)M 7种免疫相关基因的表达。结果显示,两种方式免疫后各基因表达量均出现显著上调。注射组3种组织中, IL-1β、TNFα基因的表达高峰出现时间在12-24 h, MHCⅠ、MHCⅡ、CD4、CD8的表达高峰出现在48-72 h, IgM的表达高峰出现在免疫后7 d,各基因表达量最高值是对照组的2-70倍;浸泡组3种组织中, IL-1β、TNFα基因的表达高峰出现在免疫后12-48 h, MHCⅠ、MHCⅡ、CD8表达高峰出现在48-96 h,但CD4在头肾和鳃中表达高峰出现在72 h,在脾中表达高峰出现在7 d, IgM在鳃中表达高峰出现在96 h,在脾和头肾中表达量在14 d内逐渐上升,各基因表达最高值是对照组的2-20倍。结果表明,注射组各组织基因的转录水平均高于浸泡组,且脾、头肾中表达量最高值出现时间早于浸泡组,但鳃中各基因峰值出现时间晚于浸泡组。研究结果为疫苗的免疫途径及免疫效果评价提供了基础数据。 宋晓青 邢婧 战文斌关键词:牙鲆 注射免疫 浸泡免疫 免疫相关基因 中国北方紫花苜蓿土壤有效磷丰缺指标与适宜施磷量初步研究 被引量:25 2016年 为了初步建立我国北方紫花苜蓿土壤有效磷(Olsen-P)丰缺指标,并确定不同丰缺级别土壤的适宜施磷量,采用土壤有效养分含量与缺素处理相对产量回归方程法、土壤有效养分丰缺分级改良方案和"养分平衡—地力差减法"确定适宜施肥量新应用公式,开展了本研究。结果表明,东北平原区第1~5和6~11级土壤有效磷丰缺指标依次为>26、14~26、7~14、4~7、2~4和0~2 mg/kg;内蒙古高原区第1~11级土壤有效磷丰缺指标依次为>28、16~28、9~16、5.2~9、3.0~5.2、1.7~3.0、1.0~1.7、0.6~1.0、0.3~0.6、0.2~0.3和0~0.2 mg/kg;西北荒漠绿洲区第1~5和6~11级土壤有效磷丰缺指标依次为>20、12~20、7~12、4~7、2.4~4和0~2.4 mg/kg;黄土高原区第1~5和6~11级土壤有效磷丰缺指标依次为>29、15~29、7~15、4~7、2~4和0~2 mg/kg;黄淮海平原区第1~3和4~11级土壤有效磷丰缺指标依次为>13、4~13、1~4和0~1 mg/kg。当紫花苜蓿干草目标产量为15 t/hm^2时,第1~11级土壤的适宜施磷(P2O5)量依次为0、45、90、135、180、225、270、315、360、405和450 kg/hm^2。 孙洪仁 曹影 刘琳 吴雅娜 杨晓洁 赵雅晴关键词:测土施肥 紫花苜蓿 土壤有效磷 养分丰缺指标 施肥量 紫花苜蓿灌溉的理论与技术 被引量:11 2014年 本文系统地阐述了紫花苜蓿灌溉的理论与技术,内容包括需水量、需水强度、入渗速率、灌溉需要量、灌溉定额、灌水深度、灌水定额、灌水周期、灌水次数、灌水时期、灌水强度、灌溉方法等内容。 孙洪仁 刘琳 曹影 杨晓洁 吴雅娜 赵雅晴关键词:紫花苜蓿 溶藻弧菌二氢硫辛酰胺脱氢酶基因克隆及其生物信息学分析 被引量:9 2014年 根据溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)二氢硫辛酰胺脱氢酶(dihydrolipoamide dehydrogenase,DLD)的基因序列设计1对特异性引物。PCR扩增结果显示,DLD(GenBank登录号AGK62253)全长1 428 bp,共编码475个氨基酸残基。根据推导的氨基酸序列预测其分子质量约为50.998 ku,等电点为5.51。细胞定位、SignalP 4.0、TMHMM Server 2.0和SoftBerry-Psite预测结果显示,DLD位于细胞质中,在第29至30个氨基酸之间存在信号肽,不存在跨膜区,氨基酸序列含有1个Asn-糖基化位点、5个蛋白激酶C磷酸化位点、6个酪蛋白激酶II磷酸化位点等多个活性位点。系统进化树结果显示,溶藻弧菌DLD与副溶血弧菌(V.parahaemolyticus)聚为一簇。用Kyte-Doolittle亲水性参数、Karplus-Schulz柔韧性参数、Emini表面可及性参数和Jameson-Wolf抗原性参数分别预测,DLD可能的B细胞抗原优势表位分别是第5~10、106~110、120~125、158~163和175~180区段。利用SWISS-MODEL软件,模拟DLD亚基三维结构模型,结果显示其与大肠杆菌(Escherichia coli)DLD蛋白有相似构型。Kegg分析发现,其涉及糖酵解和糖异生等9条信号通路。从生物信息学角度验证了DLD作为弧菌共同抗原的可行性。 庞欢瑛 陈立明 蔡佳 汤菊芬 王蓓 吴灶和 简纪常关键词:溶藻弧菌 基因克隆 生物信息学分析 溶藻弧菌dtd基因的克隆及原核表达条件优化 被引量:3 2014年 根据NCBI数据库中已发表的溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)全基因组序列合成一对特异性引物,应用聚合酶链式反应(PCR技术)扩增溶藻弧菌HY9001菌株dtd基因,将其定向克隆到原核表达载体pET-32a构建重组表达质粒pET-DTD,并对其进行诱导温度、诱导时间、诱导IPTG浓度等条件的优化,最后探究其纯化时最佳咪唑洗脱浓度。结果表明:DTD蛋白成功表达,且其以包涵体的形式存在,在诱导温度37℃、IPTG浓度0.1 mmol/L条件下诱导5 h表达量最高,纯化最佳咪唑洗脱浓度为150 mmol/L。 陈立明 庞欢瑛 简纪常 吴灶和关键词:溶藻弧菌 DTD 基因克隆 原核表达 溶藻弧菌Ⅲ型分泌系统分子伴侣护航蛋白VscO的基因克隆及其生物信息学分析 被引量:12 2014年 克隆了溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)ZJ03株Ⅲ型分泌系统(T3SS)分子伴侣护航蛋白(Chaperone escort protein)vscO基因,并对其进行生物信息学分析。结果表明,vscO基因全长462 bp,编码153个氨基酸,理论分子量约为18.43 kD,pI值为9.22。细胞定位分析显示vscO基因位于外周质,不存在信号肽,无跨膜区。vscO基因具有转录起始区-35区和-10区,以及翻译识别信号SD序列(Shine-Dalgarno sequence)。该氨基酸序列含有多种活性位点,如蛋白激酶C磷酸化位点等。系统进化树发现溶藻弧菌的VscO蛋白与副溶血弧菌聚为同一亚族。VscO亚基三维结构模型显示其与副溶血弧菌T3SS的YscO蛋白有相似构型。信号通路分析推测VscO位于T3SS的针状样结构上。蛋白网络互作图谱发现VscO与10种T3SS蛋白具有相邻关系。本研究结果将为溶藻弧菌Ⅲ型分泌系统护航机制的研究奠定基础。 庞欢瑛 周泽军 丁燏 黄郁葱 吴灶和 简纪常关键词:溶藻弧菌 “养分平衡—地力差减法”确定适宜施肥量的新应用公式 被引量:72 2014年 为了获得一个与"土壤养分丰缺指标法"结合紧密、便于应用的确定适宜施肥量的新应用公式,以期使土壤养分丰缺指标体系建设减少试验工作量、简单易行,研究在对"养分平衡—地力差减法"确定适宜施肥量现有计算公式系统评析的基础上,选择实用性相对较强的应用公式进行改造:适宜施用养分量=(目标产量-基础产量)×单位经济产量作物吸收养分量÷养分当季利用率;改造方案为以"缺素处理产量"替代"基础产量",将"全肥处理产量"作为"目标产量",把"缺素处理相对产量"引入公式,用"单位经济产量作物移出养分量"替代"单位经济产量作物吸收养分量"。结果表明:经过推导得到一个新应用公式,适宜施用养分量=(1-缺素处理相对产量)×目标产量作物移出养分量÷养分当季利用率。利用新应用公式,在建立土壤养分丰缺指标之"常规5处理"田间试验基础上,无需再增加任何试验处理,即可直接计算出不同丰缺级别土壤的适宜施肥量。 孙洪仁 曹影 刘琳 吴雅娜 杨晓洁 赵雅晴关键词:测土施肥 养分平衡法 施肥量 适宜中国草都紫花苜蓿安全越冬的理论和技术 被引量:6 2015年 本文系统阐述了适宜中国草都紫花苜蓿安全越冬的理论与技术,从品种选择、平整土地、基施有机肥、播种期、播种方法、越冬肥、末次刈割、越冬水、解冻水和返青水等方面进行了阐述。 孙洪仁 刘琳 邵光武 曾红 刘江扬关键词:紫花苜蓿 越冬 春灌 红笛鲷(Lutjanus sanguineus)C型凝集素基因的克隆与组织表达分析 被引量:1 2015年 根据已知的海水鱼类C型凝集素基因的核苷酸保守区序列设计一对简并引物,先后通过RT-PCR和RACE PCR法从红笛鲷脾脏中首次克隆获得红笛鲷C型凝集素(CTL)基因的c DNA全长(登录号:AGT37609)。该序列长828 bp,开放阅读框663 bp,编码220个氨基酸。氨基酸序列分析显示,红笛鲷CTL基因氨基酸序列与其他物种CTL的相似性在30%-68%之间。系统进化分析表明,红笛鲷C型凝集素与鳉鱼、条石鲷、斜带石斑鱼CTL蛋白亲缘关系最近,聚成一支。通过荧光定量PCR分析红笛鲷基因的组织差异表达,红笛鲷CTL基因在肝、脾以及皮肤中表达水平较高,其次是头肾、肾、胃、肠及肌肉,在心脏与脑中表达量较低。 蔡佳 张雪利 吴灶和 简纪常 鲁义善 冯东岳 焦茂兴关键词:红笛鲷 C型凝集素 基因克隆 组织表达分析 红笛鲷MAPKK5基因的克隆及生物信息学分析 被引量:1 2015年 利用本实验室构建红笛鲷头肾cDNA文库中的MAPKK5基因EST序列,通过RACE PCR技术克隆红笛鲷MAPKK5基因cDNA全长(Ls-MAPKK5,登录号为KM657202)。序列分析结果显示,Ls-MAPKK5cDNA全长2632bp,其中开放阅读框1317bp,可编码438个氨基酸,预测其编码蛋白的分子量为49.29ku,理论等电点为6.12。SignalP 4.0、TMHMM Server 2.0和SoftBerry-Psite预测结果显示,Ls-MAPKK5没有信号肽和跨膜结构,含有22个磷酸化位点。氨基酸序列分析显示LsMAPKK5具有保守的PB1与S_TKc结构域。利用MEGA5.0软件,根据邻位相连法构建MAPKK5系统进化树,结果显示Ls-MAPKK5与雀鲷、吉富罗非鱼该蛋白有较近的亲缘关系。 蔡佳 黄郁葱 吴灶和 鲁义善 简纪常 冯东岳 焦茂兴关键词:红笛鲷 基因克隆 生物信息学分析