国家科技支撑计划(2006BAD06A06)
- 作品数:34 被引量:112H指数:6
- 相关作者:王永录张永光杜进鑫张昱潘丽更多>>
- 相关机构:中国农业科学院兰州兽医研究所甘肃农业大学更多>>
- 发文基金:国家科技支撑计划国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域:农业科学生物学医药卫生更多>>
- 口蹄疫病毒株AF/72结构蛋白VP1克隆及其T细胞表位预测被引量:6
- 2010年
- 以AF/72RNA为模板,反转录并扩增目的cDNA,然后与pGEM-T easy体连接并转化JM109菌株,提取的重组质粒用凝胶电泳、PCR和EcoRI酶切法鉴定。应用BIMAS生物学软件对AF/72株结构蛋白VP1的H-2Dd、H-2Kd、H-2Ld、A20限制性T细胞表位进行预测,并对不同限制性的T细胞表位进行对比。结果表明,口蹄疫AF/72株结构蛋白VP1长639bp,编码213个氨基酸。不同限制性的T细胞表位虽然不尽相同,但与已鉴定的T细胞表位相比较,它们之间也有一些类似的、并且可能是通用型的T细胞表位。本试验通过生物信息学方法预测AF/72结构蛋白VP1的T细胞表位,为进一步试验确定T细胞表位和口蹄疫病毒T细胞表位的研究提供了一种有效的方法。同时为口蹄疫病毒表位疫苗的设计提供有效地理论基础。
- 刘新生王永录
- 关键词:口蹄疫病毒T细胞表位VP1蛋白
- 口蹄疫病毒株AF72 VP3的结构模拟与分析被引量:3
- 2009年
- 以口蹄疫病毒株AF72RNA为模板,反转录并扩增目的基因,PCR纯化产物与pGEMT—Easy载体连接并转化JM109菌株,用凝胶电泳、PCR和SpeI/SphI双酶切法鉴定为阳性的重组质粒进行测序。比对测序结果确定AF72VP3的核苷酸序列,利用同源建模的方法建立AF72VP3结构蛋白的3D结构,在此基础上,综合亲水性、可塑性、抗原指数以及表面可能性等参数预测AF72VP3结构蛋白的B细胞抗原表位。分析表明,口蹄疫病毒VP1、VP2、VP3和VP4在核苷酸水平上的变异率是无差异的(P〉0.05);而它们在氨基酸水平上的变异率差异显著(P〈0.05)。该毒株与20株源于GenBank中的VP3氨基酸序列比对发现其保守区主要位于第1~24、24~35、36~42、45~56、65~122、124~172、177~210、211~219位。AF72VP3结构蛋白三维空间结构可分为A、B和c3个结构区域,蛋白呈现较规则的空间构象,其中18~23、30~44、60~75、113~124、130~142、193~220氨基酸区段是AF72VP3结构蛋白可能的B细胞抗原表位区域,该结果将为进一步的FMDV多表位疫苗研究提供更有价值的参考信息。
- 陈启伟王永录张永光潘丽方玉珍蒋守田吕建亮周鹏张中旺张昱张淑刚杜进鑫李正丰王刚
- 关键词:口蹄疫病毒B细胞表位
- DNA干扰研究进展
- 2009年
- DNA干扰(DNAi)即含有与体内某一基因的cDNA相同序列的DNA链,在没有启动子诱发其表达的情况下导致细胞内序列特异的基因表达被抑制。DNA干扰可参与真核生物的抗病毒侵染,阻断转座子的异常活动,调控基因表达等。随着RNA干扰技术缺陷的暴露以及人们对多种同源基因依赖性基因沉默的深入了解,DNAi有望成为最有潜力的基因干预治疗方法,并将在抵抗人类重大疾病和基因治疗方面发挥重要作用。
- 陈启伟王永录
- 关键词:基因沉默
- 免疫细胞和细胞因子在口蹄疫免疫应答中的作用
- 2009年
- 杜进鑫王永录
- 关键词:口蹄疫病毒免疫应答细胞因子免疫细胞小RNA病毒科接触性
- 口蹄疫病毒株AF72 VP1的结构构建与B细胞表位预测被引量:5
- 2008年
- 以口蹄疫病毒株AF72 RNA为模板,反转录并扩增目的基因,PCR纯化产物与pGEM-T easy载体连接并转化JM109菌株,用凝胶电泳、PCR和EcoRⅠ酶切法鉴定为阳性的重组质粒进行测序。比对测序结果确定AF72 VP1的核苷酸序列,利用同源建模的方法建立AF72 VP1结构蛋白的3D结构,在此基础上,综合亲水性、可塑性、抗原指数以及表面可能性等参数预测AF72 VP1结构蛋白的B细胞抗原表位。结果显示,VP1结构蛋白呈现较规则的空间构象,其中5-11、24-30、43-47、82-87、132-147和196-203氨基酸区段是AF72 VP1结构蛋白可能的B细胞抗原表位区域,该结果将为进一步的FMDV多表位疫苗研究提供很有价值的参考信息。
- 张昱王永录张永光潘丽方玉珍刘力宽蒋守田吕建亮张中旺张淑刚李正丰杜进鑫
- 关键词:口蹄疫病毒B细胞表位
- 生物传感器及其在兽医临床检测中的应用被引量:2
- 2009年
- 张昱王永录
- 关键词:生物传感器兽医现代生物技术环境监测传感器技术
- 噬菌体展示技术及其在抗原表位筛选中的应用被引量:6
- 2009年
- 噬菌体展示技术(Phage display technology)是以噬菌体或噬菌粒为载体,使外源肽或蛋白基因与噬菌体表面特定蛋白基因在其表面进行融合表达,进而通过亲和富集法筛选表达有特异肽或蛋白质的噬菌体,此技术现已被广泛应用于生命科学的许多领域。本文主要介绍了噬菌体展示技术的原理,并就噬菌体表面展示系统的不同类别的表达载体分别做了描述,同时阐述了该展示技术在抗原表位研究中的应用。
- 陈启伟王永录
- 关键词:噬菌体展示技术抗原表位
- 口蹄疫病毒3D聚合酶B细胞表位的筛选鉴定被引量:2
- 2009年
- 以口蹄疫病毒株AF72 RNA为模板,反转录并扩增3D聚合酶基因,PCR纯化产物与pGEM-T easy载体连接并转化JM109菌株,对经凝胶电泳、PCR和EcoRⅠ酶切法鉴定为阳性的重组质粒进行测序,通过序列比对获得AF723D聚合酶的核苷酸序列和推导氨基酸序列,综合分析3D聚合酶的亲水性、可塑性、抗原指数以及表面可能性等参数,预测其潜在B细胞抗原表位并人工合成表位肽段,利用间接ELISA对潜在表位进行筛选鉴定,结果显示,表位3D2和3D4为病毒株AF72 3D聚合酶的优势B细胞表位,该结果将为进一步的FMDV多表位疫苗研究奠定基础。
- 张昱王永录张永光潘丽方玉珍刘力宽蒋守田吕建亮张中旺张淑刚李正丰杜进鑫
- 关键词:口蹄疫病毒间接ELISAB细胞表位
- 口蹄疫A型病毒AF/72株特异性鉴定及其豚鼠标准血清的制备
- 2009年
- 用口蹄疫A型病毒AF/72株的细胞毒AF/72/MF6/BF12,经测定其TCID50为108.0/ml;经RT-PCR获得其VP1基因序列,并与GenBank中的其他7株口蹄疫A型病毒株比对,同源性均大于85%;经间接夹心ELISA测定,OD值均大于0.2,且该毒仅能被口蹄疫A型标准血清中和,具有型特异性;经紫外分光光度法测定其146S含量,均值为189 ng/ml,远大于22 ng/ml的国际标准。将此细胞毒与弗氏佐剂联合制成灭活疫苗免疫豚鼠后分离血清,经无菌检验和外源病毒检验,纯净性达到兽用生物制品标准要求;经ELISA检测此血清的抗体滴度、原血清、强阳性血清和弱阳性血清的中和效价均远小于1∶45。参照标准的要求,确定强阳性血清为口蹄疫A型病毒株AF/72的参考血清。
- 杜进鑫王永录张永光方玉珍蒋守田吕建亮潘丽刘力宽
- 关键词:FMD血清
- 口蹄疫疫苗研究新进展被引量:6
- 2009年
- 口蹄疫是世界性重大动物疫病之一。接种疫苗是预防该病的重要手段之一,而研制高质量、安全有效的疫苗,不但是决定疫苗免疫效果的关键,也是成功预防、控制直至最终消灭口蹄疫的先决条件。目前,除传统疫苗仍然在口蹄疫防控中扮演重要角色以外,国内外诸如亚单位疫苗、载体疫苗、核酸疫苗、基因缺失疫苗、合成肽疫苗、可饲疫苗和多表位疫苗等的研究和探索已全面展开,有望为口蹄疫的有效防控提供新的途径。
- 杜进鑫王永录
- 关键词:口蹄疫疫苗