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中美新发和再发传染病合作项目(1U2GGH000018-01)
中美新发和再发传染病合作项目(1U2GGH000018-01) 作品数:24 被引量:295 H指数:11 相关作者: 柯昌文 何冬梅 柯碧霞 许学斌 李柏生 更多>> 相关机构: 广东省疾病预防控制中心 中国疾病预防控制中心 上海市疾病预防控制中心 更多>> 发文基金: 中美新发和再发传染病合作项目 广东省科技计划工业攻关项目 艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项 更多>> 相关领域: 医药卫生 农业科学 更多>>
2009~2014年珠海市腹泻儿童沙门菌感染的流行病学特征 被引量:24 2015年 目的了解2009~2014年珠海市腹泻儿童感染沙门菌的流行病学特征。方法对2009~2014年珠海市妇幼保健院4 395例门诊和住院感染性腹泻患儿送检的粪便标本进行沙门菌分离、培养、生化鉴定和血清学分型,并进行统计学分析。结果共检出30种血清型沙门菌546株,分离率为12.42%,小于3岁的婴幼儿沙门菌阳性病例占93.22%,男女患儿分离率差异无统计学意义(χ2=0.572,P〉0.05)。6、7月是沙门菌感染的高峰时期,分离率分别为16.40%和16.09%。鼠伤寒沙门菌(50.92%)、肠炎沙门菌(13.55%)和斯坦利沙门菌(10.26%)为沙门菌优势血清型。结论沙门菌是珠海地区儿童感染性腹泻的主要病原菌,血清型以鼠伤寒沙门菌为主,其感染与年龄和气候密切相关。 李桦 汪伟山 周玉球关键词:感染性腹泻 儿童 沙门菌属 流行病学特征 上海市鼠伤寒沙门菌流行特征及分子分型研究 被引量:16 2010年 [目的]研究上海市2006—2007年鼠伤寒沙门菌腹泻病例株的分子流行病学特征。[方法]追溯2002—2007年食品中分离的鼠伤寒沙门菌来源,比较鼠伤寒沙门菌食源株与腹泻株的抗生素耐药性;对全球沙门菌监测(GSS)病例和食品中分离的鼠伤寒沙门菌进行血清、耐药表型和脉冲凝胶电泳(PFGE)分子分型。[结果]经培养确认的鼠伤寒沙门菌腹泻病例数,在2006—2007年本市非伤寒沙门菌型病例构成中仅次于肠炎沙门菌,食品菌株多源于禽(64.4%)和畜肉制品(17.8%),其多重耐药菌株显著高于腹泻株(P<0.05)。PFGE将7株食品株和44株腹泻株分为23种带型,优势型为1型(8株)、2型(6株)、29型(4株)、49型(8株)和6型(4株),与食源菌株完全匹配的仅有49型、6型共7个病例(15.9%,7/44)。PFGE-1型腹泻株在2006和2007年分别为2例和6例,2型分别为4例和2例。[结论]上海市鼠伤寒沙门菌腹泻病例存在高度散发和分散爆发的流行特征,没有与本地食品菌株相匹配的优势克隆型分别是PFGE 2型和1型,与市售生鲜类肉食品污染株之间的遗传同源性低。推测传染源可能由输入性传染源对食品等媒介形成二次污染所致。建议加强流行病学调查,以揭示潜在的传染源和传播途径。 许学斌 金汇明 肖文佳 陈敏 冉陆 刁保卫 崔志刚 阚飚关键词:鼠伤寒沙门菌 多重耐药 脉冲凝胶电泳 分子分型 传染源 一类罕见硫化氢阴性山夫登堡沙门菌腹泻株的分子溯源 被引量:1 2010年 [目的]研究一类罕见硫化氢阴性山夫登堡沙门菌腹泻菌株遗传克隆特征。[方法]收集、分析本地区参加全球沙门菌监测(GSS)腹泻病例中分离的山夫登堡沙门菌生化、编码SPI-1毒力岛基因(hilA、invA)和耐药特征;应用Riboprinter(r)(RP)DNA指纹图谱系统比较表型典型与不典型菌株的核糖体分型;通过Pluse Net China数据库中同型菌株的脉冲凝胶电泳(PFGE)图谱聚类比较分子型谱。[结果]2006年长宁区GSS监测病例分离出19株山夫登堡沙门菌,其中10株属于硫化氢阴性和SPI-1毒力岛缺失的表型变异菌株。RP分型证实发生变异的山夫登堡沙门菌与典型菌株间分属2个不同的克隆。Pluse Net China数据库将包括长宁区19株山夫登堡沙门菌在内的36株山夫登堡腹泻株共分18种PFGE带型。长宁区的表型变异株优势型分属4型(2株)和6型(6株),典型菌株的优势型分属11型(1株)、17型(4株)和23型(2株)。聚类分析显示,表型变异株的克隆在遗传相似度上高于典型株。[结论]分子溯源证实,SPI-1毒力岛缺失的山夫登堡沙门菌变异菌株与典型菌株同样具有引发局部爆发的致病性。2006年长宁区分离的硫化氢阴性山夫登堡沙门菌变种腹泻株与2002年深圳市的1例食物中毒案例分离的2株SPI-1毒力岛缺失株存在同源性。 黄峥 许学斌 金汇明 陈敏 冉陆 阚飙关键词:山夫登堡沙门菌 变种 脉冲凝胶电泳 上海市C群沙门菌暴发菌株鉴别诊断研究 被引量:6 2010年 目的:C群沙门菌血清型的鉴别诊断研究。方法:对2007年上海市黄浦区的C群食源性暴发沙门菌鉴定中存在与泰国产沙门菌分型血清H相因子有交叉凝集的菌株使用丹麦(SSI)血清参比;分析菌株的抗生素耐药性和脉冲凝胶电泳(PFGE)图谱,选择部分猪霍乱和汤卜逊沙门菌腹泻株进行多位点基因序列分析(MLST)分子分型;通过PluseNetChina非伤寒沙门菌数据库图谱比对上海的汤卜逊暴发菌株与重庆市C群沙门菌暴发菌株的分子型。结果:2007年黄浦区报告8株猪霍乱暴发菌株经丹麦血清分型鉴定为汤卜逊沙门菌;2007年的4株猪霍乱和5株汤卜逊沙门菌经丹麦SSI血清复核鉴定均为汤卜逊沙门菌ST26型;汤卜逊沙门菌暴发菌株对6种抗生素的耐药率均为100%,耐药谱与散发株显著不同;2007年重庆市的多起食源性暴发案例中的C群沙门菌经复核鉴定亦为汤卜逊沙门菌ST26型,并与上海的暴发菌株在遗传学上存在高度同源。结论:泰国血清的H相因子间存在交叉凝集现象。推测2007年上海市发生的食源性暴发病例可能由输入性汤卜逊沙门菌ST26型多重耐药克隆株引起。 许学斌 崔玲 王红霞 冉陆 金汇明 陈敏 刁保卫 阚飙关键词:交叉凝集 分子分型 多重耐药 沙门菌和志贺菌实验室能力比对验证的模拟粪便标本的研制和评估 被引量:1 2016年 目的:研制适用于临床沙门菌和志贺菌实验室能力比对验证( proficiency testing, PT)项目的模拟粪便标本,建立有效的标本制备与评估流程。方法分别把沙门菌、志贺菌和大肠埃希菌加标至基质扁豆中制成单一目标菌的模拟粪便标本;把不同比例的大肠埃希菌与沙门菌加标至基质扁豆中,制成混合菌的模拟粪便标本;用Cary-Blair运送培养基沾取混合物,制成PT标本。通过鉴定评估PT标本的准确性和稳定性。通过参与实验室反馈的鉴定结果评估外部质控考核结果。结果按100∶1~106∶1比例制备大肠埃希菌与沙门菌混合的PT标本,能在鉴定培养基有效分离两种菌落,按104∶1~106∶1的比例制备大肠埃希菌与沙门菌混合的PT标本,需增菌后才能有效分离沙门菌;16家参与实验室中有14家医院质控考核获得“满意”结果,占87.5%(14/16),2家医院获得“基本满意”结果,占12.5%(2/16)。结论本研究制备的模拟粪便PT标本及实验质控流程适用于临床沙门菌、志贺菌及类似的微生物鉴定能力验证项目。 何冬梅 柯碧霞 谭海玲 李柏生 曾洪辉 杨彤 柯昌文 梁宇恒 刘美真关键词:沙门菌 志贺菌 大肠埃希菌 安徽地区家畜嗜吞噬细胞无形体16S rRNA基因检测和序列分析 被引量:5 2013年 目的了解安徽农村地区散养家畜自然感染嗜吞噬细胞无形体状况和基因特征。方法应用巢式PCR对怀远、明光和广德县采集的148份家畜全血样本进行嗜吞噬无形体16S rRNA基因检测,并对扩增产物测序,应用生物软件MEGA4.0进行序列分析。结果 148份家畜全血样本中检测出山羊、牛和犬嗜吞噬细胞无形体16S rRNA基因阳性率分别22.1%、25.0%和40.0%。26份PCR阳性扩增产物测序成功,序列分析结果表明:检出序列可归为4群,I群优势株占分析序列的66.7%,与北京、浙江和湖北等地检测序列同属一个分支。目的基因测定序列与参考序列同源性达97.0~99.0%。结论安徽调查地区农村家畜动物存在嗜吞噬细胞无形体感染,山羊是该地区嗜吞噬细胞无形体的重要宿主动物之一。 史永林 王誓闻 胡万富 张永根 刘红 曹明华 张丽娟关键词:RRNA 巢式PCR 安徽省不同地区人群和家畜巴尔通体病血清流行病学调查 被引量:3 2010年 为探索安徽省农村地区人群和家畜巴尔通体病感染状况和分布特点,2009年4-5月在安徽省广德、明光和怀远县进行了人群和家畜汉赛巴尔通体及五日热巴尔通体血清流行病学调查,现将结果汇报如下. 曹明华 刘红 胡万富 张永根 史永林 王俊 李荣民 禹惠兰 张丽娟关键词:血清流行病学调查 汉赛巴尔通体 家畜 上海市罕见沙门菌型腹泻的溯源研究 被引量:11 2009年 [目的]初步了解本市罕见沙门菌血清型菌株的分子流行病学特征。[方法]对分离自不同来源标本的22株7种不同血清型沙门菌进行脉冲凝胶电泳(PFGE)分析,脉冲凝胶电泳选用XbaⅠ限制性内切酶。[结果]2株列克星敦、2株非丁伏斯沙门菌的电泳图谱显示有较大差异,2株蒙得维的亚、2株朗根萨尔查、2株乌普萨拉、5株胥戈成格隆、4株波摩那的图谱显示存在同源性。[结论]本市沙门菌罕见血清型的流行菌株和食品菌株之间既存在分子水平的同源性也存在非同源性,加强沙门菌综合监测和即时分子分型可预警罕见沙门菌血清型流行。 许学斌 顾宝柯 冉陆 刁保卫 陈敏 金汇明 肖文佳 袁政安关键词:沙门菌 脉冲凝胶电泳 分子分型 安徽省不同地区人群和家畜蜱源立克次体病血清流行病学调查 目的了解安徽省农村地区人群和家畜蜱源立克次体病感染状况和分布特点,为科学防治蜱源立克次体病提供依据。方法 2009年4~5月在安徽省广德、明光和怀远县采集农村人群血清613份,家畜血清150份,使用试剂盒,采用间接免疫荧... 曹明华 刘红 胡万富 张永根 史永林 王俊 李荣民 张丽娟关键词:立克次体病 斑点热 人粒细胞无形体病 血清流行病学 广东省2008-2009年沙门菌监测 被引量:18 2011年 目的了解广东省腹泻患者中沙门菌的感染及沙门菌暴发的情况以及沙门菌株的血清型别、耐药性和分子特征。方法对纳入研究的腹泻病患者进行沙门菌的检测,对日常监测中分离到的菌株和暴发监测收集到的菌株进行血清分型、药物敏感试验和脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型。结果2008年共检测1922份粪便标本,分离到71株沙门菌,阳性率为3.7%;2009年检测2110份粪便标本,分离到85株沙门菌,阳性检出率为4.0%;156株菌共分37种血清型,鼠伤寒和肠炎沙门菌居多;监测到10起由沙门菌污染引起的食物中毒事件,其中有4起由肠炎沙门菌引起,有3起由鼠伤寒沙门菌引起;发现1起疑似肠炎沙门菌暴发,并开展流行病学调查,结果提示4名病例中有2名病例是感染同一来源的肠炎沙门菌;229株沙门菌对头孢类和喹诺酮类抗菌药物敏感率达80%以上,59.3%是多重耐药沙门菌。结论在广东省引起感染性腹泻和食物中毒的沙门菌主要为肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌。 柯碧霞 邓小玲 李柏生 谭海玲 何冬梅 刘美真 陈经雕 柯昌文关键词:沙门菌