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吉林省2009年-201 6年肠道病毒71 型VP 1 {1 }基因特征分析 被引量:1 2018年 目的为了解吉林省2009年-201 6年肠道病毒71 型(EV71 )流行株的基因特征。方法对吉林省2009年-201 6年手足口病来源的EV71 流行株进行VP 1 {1 }逆转录PCR反应(RT-PCR)扩增,并对扩增产物进行核苷酸序列测定,使用Mega 6.0和Bioedit 7.01 软件对扩增序列进行基因亲缘关系和氨基酸位点变异分析。结果吉林省2009年-201 6年的97株EV71 流行株与C4a基因亚型参考株位于同一簇支上,均为C4a基因亚型;97株EV71 流行株在VP 1 {1 }共有25处氨基酸位点变异,其中流行株突变数量较多的位点为22氨基酸位点和289氨基酸位点。结论吉林省2009年-201 6年的97株EV71 流行株均为C4a基因亚型,而且发生了多位点的氨基酸变异。 黄飚 魏雷雷 杨尧 周剑惠 吴东林 王爽关键词:手足口病 肠道病毒71型 吉林省201 6年手足口病患儿肠道病毒71 型VP 1 {1 }基因分析 被引量:1 2018年 目的分析吉林省201 6年肠道病毒71 型(enterovirus 71 ,EV71 )流行株基因学特征及其变异情况。方法采集201 6年吉林省9个市、州送检的临床诊断为手足口病(hand foot and mouth disease,HFMD)298份标本,分离病毒获得阳性分离物,利用逆转录-聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)扩增阳性分离物VP 1 {1 },并对扩增产物进行核苷酸序列测定,应用Mega6和Bioedit 7. 01 软件分析扩增序列基因亲缘关系和氨基酸位点变异。结果吉林省201 6年分离的38株EV71 同属于C4a基因亚型,并在VP 1 {1 }共发生7处氨基酸位点的变异。结论吉林省201 6年EV71 流行株与C4a代表株位于同一分支属于C4a基因亚型,且发生了多位点氨基酸变异。 魏雷雷 吴东林 黄飚 王岙 苟伟民 杨尧 王爽 单元春关键词:手足口病 肠道病毒71型 吉林省201 3年肠道病毒71 型VP 1 {1 }基因特征分析 被引量:4 2016年 目的为了解吉林省201 3年肠道病毒71 型(EV71 )流行株基因学特征。方法对吉林省201 3年手足口病来源的EV71 阳性分离物进行VP 1 {1 }逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增,并对扩增产物进行核苷酸序列测定,使用Mega4和Bioedit软件对扩增序列进行基因亲缘关系和氨基酸位点变异分析。结果吉林省201 3年分离到的7株EV71 同属于C4a基因亚型,并且在VP 1 {1 }第22位氨基酸位点均由谷氨酰胺(Q)突变为组氨酸(H),这一结果与2008年安徽阜阳株突变一致;有2株在VP 1 {1 }第289位点由丙氨酸(A)突变为缬氨酸(V)。结论吉林省201 3年的7株EV71 流行株与C4a代表株位于同一分支,属于C4a基因亚型,且与2008年阜阳株(EU70381 3-Fuyang-08/2-C4a)亲缘关系最近,而且发生了氨基酸位点变异。 魏雷雷 周剑惠 杨尧 沈博 单元春 黄飚关键词:手足口病 肠道病毒71型 吉林省2009-201 2年肠道病毒71 型VP 1 {1 }氨基酸位点的变异分析 被引量:4 2013年 目的分析2009--201 2年引起吉林省手足口病(handfootandmouthdisease,HFMD)流行的肠道病毒71 型(EV—A71 )的VP 1 区 氨基酸位点的特征性变异位点。方法对2009--201 2年分离于吉林省HFMD病例的70株EV—A71 分离株的VP l编码区 进行逆转录.聚合酶链反应,然后对扩增产物进行核苷酸序列测定,使用Bioedit软件和MEGA4.0软件分析VP l区 氨基酸位点的变异特征以及基因亲缘关系。结果2009--201 2年在吉林省分离到的70株EV—A71 均属于C4a基因亚型,其中69株与2008年安徽阜阳的分离株亲缘关系最近,并且这69株病毒在VP l编码区 第22位氨基酸位点均由谷氨酰胺转变为组氨酸(Q—H),与2008年安徽阜阳株一致。结论引起2009-201 2年吉林省HFMD流行的EV-A71 可能:来源于安徽阜阳流行株延续传播。 周剑惠 张勇 王爽 魏雷雷 田丽敏 陈超 吴静 曹凤瑞 常新 单元春 田鑫 程涛 林琳 付思美 吕淑梅 范明关键词:手足口病 肠道病毒属 2023年吉林省手足口病非EV-A71 、非CV-A1 6肠道病毒基因特征分析 2025年 目的 探讨2023年吉林省非肠道病毒71 型(EV-A71 )、非柯萨奇病毒A组1 6型(CV-A1 6)肠道病毒流行特征,对病毒基因特征进行进化分析,为手足口病防治工作提供科学依据。方法 收集2023年吉林省手足口病例临床标本,通过病毒分离筛选出阳性分离株,鉴定病原体基因型,并对主要病原体VP 1 {1 }基因组核苷酸序列进行测定和分析。结果 共获得206株分离株,其中7株CV-A1 6、1 69株CV-A6、8株CV-A1 0、22株未分型;CV-A6为D3基因亚型,43株CV-A6分离株与OR507503.1 -2021 HB2CA6亲缘关系较近,核苷酸同源性为93.6%~99.1 %,其编码 氨基酸同源性为98.6%~1 00.0%;CV-A1 0为C2基因型,6株CV-A1 0分离株与LC791 352.1 -YN-2022CA1 0亲缘关系最近,核苷酸同源性为95.6%~97.8%,其编码 氨基酸同源性为98.3%~99.3%。结论 CV-A6已成为引起2023年吉林省手足口病流行的优势病原体,CV-A6分离株与OR507503.1 -2021 HB2CA6亲缘关系较近,CV-A1 0分离株与LC791 352.1 -YN-2022CA1 0亲缘关系较近。 魏雷雷 王爽 黄飚 杨显达 杨尧 孙杨 李响 沈博关键词:手足口病 VP1编码区 同源性分析 2021 年吉林省手足口病的病原构成及柯萨奇病毒A组1 6型VP 1 区 基因特征分析 2024年 目的了解2021 年吉林省手足口病(HFMD)的病原构成及柯萨奇病毒A组1 6型的VP 1 区 基因特征,为手足口病科学防治提供依据。方法对2021 年吉林省手足口病流行的主要病原体构成进行分析,并对优势病原体VP 1 基因编码区 核苷酸序列进行测定和分析。结果278例HFMD患者标本中分离获得78株肠道病毒阳性毒株,阳性率为28.06%,其中CV-A1 6占35.90%,CV-A6占32.05%,CV-A4占1 1 .54%,CV-A1 0占6.41 %,未分型肠道病毒占1 4.1 0%。1 3株CV-A1 6阳性毒株中,9株属于B1 a基因亚型,4株属于B1 b基因亚型。1 3株CV-A1 6流行株之间氨基酸和核苷酸同源性分别为97.9%~1 00.0%和86.7%~1 00.0%。1 3株CV-A1 6流行株的第1 4、22、23、1 43、1 64、251 、266及279位点发生了氨基酸突变。结论2021 年吉林省HFMD CV-A1 6,CV-A6两种主要病原体共循环。1 3株CV-A1 6流行株B1 a和B1 b 2个基因亚型共同流行,以B1 a基因亚型为主;与2008年青海株相比,共发生了8处氨基酸位点变异。 王艺儒 王爽 沈博 赵庆龙 杨显达 侯程程关键词:手足口病 柯萨奇病毒A组16型 VP1编码区 2021 —2023年安徽省手足口病柯萨奇病毒A组1 6型分子分型研究 2024年 目的了解安徽省手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)发病情况、柯萨奇病毒A组1 6型(coxsackievirus A1 6,CV-A1 6)基因型别分布情况和VP 1 基因进化特征。方法通过中国疾病预防控制信息系统对2021 —2023年安徽省HFMD发病情况和病原学检测情况进行统计。收集HFMD患者咽拭子样本,分离得到CVA1 6毒株,对其VP 1 区 进行PCR扩增和基因序列测定,使用肠道病毒在线分型工具鉴定基因亚型,运用MegAlign比较核苷酸和氨基酸同源性,利用MEGA 6.0构建进化树,并分析VP 1 区 氨基酸变异位点。结果2021 —2023年安徽省累计报告HFMD病例1 55640例,年均报告发病率为84.83/1 0万。2021 —2023年安徽省1 6个地市共报告HFMD实验室确诊病例1 2643例,其中CV-A1 6占1 8.1 6%(2296/1 2643),各年度构成比分别为25.81 %(1 1 27/4366)、33.69%(782/2321 )和6.50%(387/5956)。2021 —2023年安徽省共分离到HFMD CV-A1 6毒株72株,其中B1 a和B1 b基因亚型分别为58株(占80.56%)、1 4株(占1 9.44%)。两种亚型毒株与CV-A1 6原型株G-1 0的核苷酸和氨基酸同源性分别为73.80%~76.20%和90.60%~92.30%。进化树显示B1 a基因亚型流行株在遗传进化上分为4个分支簇,B1 b基因亚型流行株形成3个分支簇。72条VP 1 区 基因序列与原型株比较发现了26个氨基酸位点发生变异。结论2021 —2023年安徽省HFMD CV-A1 6主要流行的基因亚型为B1 a和B1 b,B1 a为优势基因亚型,应加强对CV-A1 6流行毒株的分子监测。 葛盈露 杨灵康 刘以诺 马婉婉 王鹏 孙永 史永林关键词:手足口病 柯萨奇病毒A组16型 VP1编码区 进化分析 吉林省201 8—2021 年柯萨奇病毒A组1 6型病毒基因特征分析 被引量:4 2023年 目的探讨201 8年、201 9年和2021 年流行于吉林省的柯萨奇病毒A组1 6型肠道病毒流行特征、种系进化及基因变异特征。方法收集201 8年、201 9年和2021 年吉林省手足口病例临床标本,通过病毒分离筛选出60株CVA1 6的阳性毒株,并对其VP 1 {1 }全基因组核苷酸序列进行测定和分析。结果60株CVA1 6分离株中有1 5株为B1 a基因亚型,45株为B1 b基因亚型;CVA1 6分离株氨基酸序列的1 4、23、1 64、235、251 及266位点发生了氨基酸突变。结论CVA1 6为吉林省手足口病的主要病原体之一,1 5株CVA1 6分离株为B1 a基因亚型,45株CVA1 6分离株为B1 b基因亚型,与2008年青海株相比共发生了6处氨基酸位点突变。 魏雷雷 沈博 赵庆龙 杨显达 郭琪 王艺儒 刘思含关键词:手足口病 VP1编码区 201 5~201 7年吉林省柯萨奇病毒A组1 6型基因特征分析 被引量:6 2020年 目的分析201 5~201 7年吉林省流行的柯萨奇病毒A组1 6型(coxasckievirus A1 6,CVA1 6)的流行特征、种系进化及基因特征。方法收集201 5~201 7年吉林省手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)患儿的咽拭子或粪便标本,通过病毒分离筛选出CVA1 6阳性毒株,并对其VP 1 {1 }基因组核苷酸序列进行测定和分析。结果24株CVA1 6流行株均为B1 b基因亚型,与甘肃株核苷酸和氨基酸序列同源性分别为94.6%~96.1 %和99.6%~1 00%;24株CVA1 6流行株氨基酸序列的第1 1 、1 4、23、221 及266位点发生了氨基酸突变。结论CVA1 6为吉林省HFMD的主要病原体之一,24株CVA1 6流行株与2007年甘肃株亲缘关系最近,与2008年青海株相比,共发生了5处氨基酸位点突变。 魏雷雷 王岙 吴东林 沈博 杨尧 杨显达 王爽 郭琪关键词:手足口病 柯萨奇病毒A组16型 VP1编码区 201 7年吉林省手足口病肠道病毒71 型和柯萨奇病毒A组1 6型VP 1 区 基因特征分析 2019年 目的了解吉林省201 7年肠道病毒71 型和柯萨奇病毒A组1 6型(CVA1 6)流行特征、种系进化及基因分型。方法对吉林省201 7年分离获得的EV71 和CVA1 6阳性毒株的VP 1 {1 }核苷酸进行扩增及序列测定,而后使用Mega 6.0和Bioedit 7.01 软件进行序列分析。结果 8株EV71 流行株均为C4a基因亚型,流行株间核苷酸和氨基酸同源性分别为92.2%~1 00%和98.3%~1 00%;9株CVA1 6流行株均为B1 b基因亚型,流行株间核苷酸和氨基酸同源性分别为94.2%~1 00%和99.3%~1 00%。结论 EV71 的C4a基因亚型和CVA1 6的B1 b基因亚型是引起吉林省201 7年手足口病流行的主要基因亚型;相对于EV71 流行株的变异而言,CVA1 6流行株变异较少。 魏雷雷 吴东林 杨尧 王岙 王爽 单元春关键词:肠道病毒71型 柯萨奇病毒A组16型 手足口病 VP1编码区
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