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吉林省2009年-2016年肠道病毒71VP1{1}基因特征分析被引量:1
2018年
目的为了解吉林省2009年-2016年肠道病毒71型(EV71)流行株的基因特征。方法对吉林省2009年-2016年手足口病来源的EV71流行株进行VP1{1}逆转录PCR反应(RT-PCR)扩增,并对扩增产物进行核苷酸序列测定,使用Mega 6.0和Bioedit 7.01软件对扩增序列进行基因亲缘关系和氨基酸位点变异分析。结果吉林省2009年-2016年的97株EV71流行株与C4a基因亚型参考株位于同一簇支上,均为C4a基因亚型;97株EV71流行株在VP1{1}共有25处氨基酸位点变异,其中流行株突变数量较多的位点为22氨基酸位点和289氨基酸位点。结论吉林省2009年-2016年的97株EV71流行株均为C4a基因亚型,而且发生了多位点的氨基酸变异。
黄飚魏雷雷杨尧周剑惠吴东林王爽
关键词:手足口病肠道病毒71型
吉林省2016年手足口病患儿肠道病毒71VP1{1}基因分析被引量:1
2018年
目的分析吉林省2016年肠道病毒71型(enterovirus 71,EV71)流行株基因学特征及其变异情况。方法采集2016年吉林省9个市、州送检的临床诊断为手足口病(hand foot and mouth disease,HFMD)298份标本,分离病毒获得阳性分离物,利用逆转录-聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)扩增阳性分离物VP1{1},并对扩增产物进行核苷酸序列测定,应用Mega6和Bioedit 7. 01软件分析扩增序列基因亲缘关系和氨基酸位点变异。结果吉林省2016年分离的38株EV71同属于C4a基因亚型,并在VP1{1}共发生7处氨基酸位点的变异。结论吉林省2016年EV71流行株与C4a代表株位于同一分支属于C4a基因亚型,且发生了多位点氨基酸变异。
魏雷雷吴东林黄飚王岙苟伟民杨尧王爽单元春
关键词:手足口病肠道病毒71型
吉林省2013年肠道病毒71VP1{1}基因特征分析被引量:4
2016年
目的为了解吉林省2013年肠道病毒71型(EV71)流行株基因学特征。方法对吉林省2013年手足口病来源的EV71阳性分离物进行VP1{1}逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增,并对扩增产物进行核苷酸序列测定,使用Mega4和Bioedit软件对扩增序列进行基因亲缘关系和氨基酸位点变异分析。结果吉林省2013年分离到的7株EV71同属于C4a基因亚型,并且在VP1{1}第22位氨基酸位点均由谷氨酰胺(Q)突变为组氨酸(H),这一结果与2008年安徽阜阳株突变一致;有2株在VP1{1}第289位点由丙氨酸(A)突变为缬氨酸(V)。结论吉林省2013年的7株EV71流行株与C4a代表株位于同一分支,属于C4a基因亚型,且与2008年阜阳株(EU703813-Fuyang-08/2-C4a)亲缘关系最近,而且发生了氨基酸位点变异。
魏雷雷周剑惠杨尧沈博单元春黄飚
关键词:手足口病肠道病毒71型
吉林省2009-2012年肠道病毒71VP1{1}氨基酸位点的变异分析被引量:4
2013年
目的分析2009--2012年引起吉林省手足口病(handfootandmouthdisease,HFMD)流行的肠道病毒71型(EV—A71)的VP1氨基酸位点的特征性变异位点。方法对2009--2012年分离于吉林省HFMD病例的70株EV—A71分离株的VPl编码区进行逆转录.聚合酶链反应,然后对扩增产物进行核苷酸序列测定,使用Bioedit软件和MEGA4.0软件分析VPl氨基酸位点的变异特征以及基因亲缘关系。结果2009--2012年在吉林省分离到的70株EV—A71均属于C4a基因亚型,其中69株与2008年安徽阜阳的分离株亲缘关系最近,并且这69株病毒在VPl编码区第22位氨基酸位点均由谷氨酰胺转变为组氨酸(Q—H),与2008年安徽阜阳株一致。结论引起2009-2012年吉林省HFMD流行的EV-A71可能:来源于安徽阜阳流行株延续传播。
周剑惠张勇王爽魏雷雷田丽敏陈超吴静曹凤瑞常新单元春田鑫程涛林琳付思美吕淑梅范明
关键词:手足口病肠道病毒属
2023年吉林省手足口病非EV-A71、非CV-A16肠道病毒基因特征分析
2025年
目的 探讨2023年吉林省非肠道病毒71型(EV-A71)、非柯萨奇病毒A组16型(CV-A16)肠道病毒流行特征,对病毒基因特征进行进化分析,为手足口病防治工作提供科学依据。方法 收集2023年吉林省手足口病例临床标本,通过病毒分离筛选出阳性分离株,鉴定病原体基因型,并对主要病原体VP1{1}基因组核苷酸序列进行测定和分析。结果 共获得206株分离株,其中7株CV-A16、169株CV-A6、8株CV-A10、22株未分型;CV-A6为D3基因亚型,43株CV-A6分离株与OR507503.1-2021HB2CA6亲缘关系较近,核苷酸同源性为93.6%~99.1%,其编码氨基酸同源性为98.6%~100.0%;CV-A10为C2基因型,6株CV-A10分离株与LC791352.1-YN-2022CA10亲缘关系最近,核苷酸同源性为95.6%~97.8%,其编码氨基酸同源性为98.3%~99.3%。结论 CV-A6已成为引起2023年吉林省手足口病流行的优势病原体,CV-A6分离株与OR507503.1-2021HB2CA6亲缘关系较近,CV-A10分离株与LC791352.1-YN-2022CA10亲缘关系较近。
魏雷雷王爽黄飚杨显达杨尧孙杨李响沈博
关键词:手足口病VP1编码区同源性分析
2021年吉林省手足口病的病原构成及柯萨奇病毒A组16型VP1基因特征分析
2024年
目的了解2021年吉林省手足口病(HFMD)的病原构成及柯萨奇病毒A组16型的VP1基因特征,为手足口病科学防治提供依据。方法对2021年吉林省手足口病流行的主要病原体构成进行分析,并对优势病原体VP1基因编码区核苷酸序列进行测定和分析。结果278例HFMD患者标本中分离获得78株肠道病毒阳性毒株,阳性率为28.06%,其中CV-A16占35.90%,CV-A6占32.05%,CV-A4占11.54%,CV-A10占6.41%,未分型肠道病毒占14.10%。13株CV-A16阳性毒株中,9株属于B1a基因亚型,4株属于B1b基因亚型。13株CV-A16流行株之间氨基酸和核苷酸同源性分别为97.9%~100.0%和86.7%~100.0%。13株CV-A16流行株的第14、22、23、143、164、251、266及279位点发生了氨基酸突变。结论2021年吉林省HFMD CV-A16,CV-A6两种主要病原体共循环。13株CV-A16流行株B1a和B1b 2个基因亚型共同流行,以B1a基因亚型为主;与2008年青海株相比,共发生了8处氨基酸位点变异。
王艺儒王爽沈博赵庆龙杨显达侯程程
关键词:手足口病柯萨奇病毒A组16型VP1编码区
2021—2023年安徽省手足口病柯萨奇病毒A组16型分子分型研究
2024年
目的了解安徽省手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)发病情况、柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CV-A16)基因型别分布情况和VP1基因进化特征。方法通过中国疾病预防控制信息系统对2021—2023年安徽省HFMD发病情况和病原学检测情况进行统计。收集HFMD患者咽拭子样本,分离得到CVA16毒株,对其VP1进行PCR扩增和基因序列测定,使用肠道病毒在线分型工具鉴定基因亚型,运用MegAlign比较核苷酸和氨基酸同源性,利用MEGA 6.0构建进化树,并分析VP1氨基酸变异位点。结果2021—2023年安徽省累计报告HFMD病例155640例,年均报告发病率为84.83/10万。2021—2023年安徽省16个地市共报告HFMD实验室确诊病例12643例,其中CV-A16占18.16%(2296/12643),各年度构成比分别为25.81%(1127/4366)、33.69%(782/2321)和6.50%(387/5956)。2021—2023年安徽省共分离到HFMD CV-A16毒株72株,其中B1a和B1b基因亚型分别为58株(占80.56%)、14株(占19.44%)。两种亚型毒株与CV-A16原型株G-10的核苷酸和氨基酸同源性分别为73.80%~76.20%和90.60%~92.30%。进化树显示B1a基因亚型流行株在遗传进化上分为4个分支簇,B1b基因亚型流行株形成3个分支簇。72条VP1基因序列与原型株比较发现了26个氨基酸位点发生变异。结论2021—2023年安徽省HFMD CV-A16主要流行的基因亚型为B1a和B1b,B1a为优势基因亚型,应加强对CV-A16流行毒株的分子监测。
葛盈露杨灵康刘以诺马婉婉王鹏孙永史永林
关键词:手足口病柯萨奇病毒A组16型VP1编码区进化分析
吉林省2018—2021年柯萨奇病毒A组16型病毒基因特征分析被引量:4
2023年
目的探讨2018年、2019年和2021年流行于吉林省的柯萨奇病毒A组16型肠道病毒流行特征、种系进化及基因变异特征。方法收集2018年、2019年和2021年吉林省手足口病例临床标本,通过病毒分离筛选出60株CVA16的阳性毒株,并对其VP1{1}全基因组核苷酸序列进行测定和分析。结果60株CVA16分离株中有15株为B1a基因亚型,45株为B1b基因亚型;CVA16分离株氨基酸序列的14、23、164、235、251及266位点发生了氨基酸突变。结论CVA16为吉林省手足口病的主要病原体之一,15株CVA16分离株为B1a基因亚型,45株CVA16分离株为B1b基因亚型,与2008年青海株相比共发生了6处氨基酸位点突变。
魏雷雷沈博赵庆龙杨显达郭琪王艺儒刘思含
关键词:手足口病VP1编码区
2015~2017年吉林省柯萨奇病毒A组16型基因特征分析被引量:6
2020年
目的分析2015~2017年吉林省流行的柯萨奇病毒A组16型(coxasckievirus A16,CVA16)的流行特征、种系进化及基因特征。方法收集2015~2017年吉林省手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)患儿的咽拭子或粪便标本,通过病毒分离筛选出CVA16阳性毒株,并对其VP1{1}基因组核苷酸序列进行测定和分析。结果24株CVA16流行株均为B1b基因亚型,与甘肃株核苷酸和氨基酸序列同源性分别为94.6%~96.1%和99.6%~100%;24株CVA16流行株氨基酸序列的第1114、23、221及266位点发生了氨基酸突变。结论CVA16为吉林省HFMD的主要病原体之一,24株CVA16流行株与2007年甘肃株亲缘关系最近,与2008年青海株相比,共发生了5处氨基酸位点突变。
魏雷雷王岙吴东林沈博杨尧杨显达王爽郭琪
关键词:手足口病柯萨奇病毒A组16型VP1编码区
2017年吉林省手足口病肠道病毒71型和柯萨奇病毒A组16型VP1基因特征分析
2019年
目的了解吉林省2017年肠道病毒71型和柯萨奇病毒A组16型(CVA16)流行特征、种系进化及基因分型。方法对吉林省2017年分离获得的EV71和CVA16阳性毒株的VP1{1}核苷酸进行扩增及序列测定,而后使用Mega 6.0和Bioedit 7.01软件进行序列分析。结果 8株EV71流行株均为C4a基因亚型,流行株间核苷酸和氨基酸同源性分别为92.2%~100%和98.3%~100%;9株CVA16流行株均为B1b基因亚型,流行株间核苷酸和氨基酸同源性分别为94.2%~100%和99.3%~100%。结论 EV71的C4a基因亚型和CVA16的B1b基因亚型是引起吉林省2017年手足口病流行的主要基因亚型;相对于EV71流行株的变异而言,CVA16流行株变异较少。
魏雷雷吴东林杨尧王岙王爽单元春
关键词:肠道病毒71型柯萨奇病毒A组16型手足口病VP1编码区

相关作者

魏雷雷
作品数:54被引量:203H指数:7
供职机构:吉林省疾病预防控制中心
研究主题:手足口病 肠道病毒71型 基因特征 VP1编码区 基因特征分析
王爽
作品数:98被引量:354H指数:11
供职机构:吉林省疾病预防控制中心
研究主题:麻疹病毒 手足口病 基因特征 基因特征分析 肠道病毒71型
周剑惠
作品数:106被引量:596H指数:13
供职机构:吉林省疾病预防控制中心
研究主题:麻疹病毒 麻疹 基因特征 手足口病 肠道病毒71型
严冬梅
作品数:111被引量:647H指数:16
供职机构:中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所
研究主题:脊髓灰质炎 脊髓灰质炎病毒 手足口病 疫苗衍生脊髓灰质炎病毒 基因特征
祝双利
作品数:132被引量:871H指数:19
供职机构:中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所
研究主题:脊髓灰质炎 脊髓灰质炎病毒 手足口病 疫苗衍生脊髓灰质炎病毒 基因特征