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圆柏SSR分子标记引物组合及其应用
本发明公开了圆柏SSR分子标记引物组合及其应用。本发明属于生物技术领域,具体涉及圆柏SSR分子标记引物组合及其应用。本发明开发的圆柏属的SSR分子标记引物组包括SSR‑G34、SSR‑G46、SSR‑G102、SSR‑G...
刘国彬郭丽琴廖婷王烨张亚楠
苹果属植物的SSR分子标记及其应用
本发明涉及植物育种技术领域,尤其涉及苹果属植物的SSR分子标记及其应用。所述分子标记包括:苹果第1‑17号染色体上共17个SSR标记位点。本发明从已发表的七个苹果属植物全基因组序列中筛选了17个多态性高、可靠性高、重复性...
董雷鸣王瑞珍贺然魏钰权键郭翎张辉刘东焕刘东燕陈春玲曹颖孙宜刘浡洋刘恒星
基于转录组数据的连翘SSR分子标记开发
2025年
为开发连翘简单重复序列(Simple sequencerepeats,SSR)分子标记,并应用SSR分子标记进行连翘种质的亲缘关系分析,本研究利用MISA软件分析连翘转录组数据,随机筛选设计SSR引物,利用聚丙烯酰胺凝胶电泳开发连翘SSR分子标记。研究分析显示,共获得217959条Unigene序列,平均序列长度为1169bp,N50达到1754bp;对Unigene序列进行分析,发现了54809个SSR位点,位点发生频率13.44%,平均分布距离8.69 kb;连翘转录组SSR信息中,单碱基重复比例最高(49.18%),其次为双碱基重复(29.67%);连翘转录组中单个SSR位点信息中共包含561种重复基原,A/T(48.61%)、AG/TC(30.61%)分别为优势重复基原类型;序列长度在10~27bp之间的SSR位点占SSR位点总数的96.30%。聚丙烯凝胶电泳筛选获得10对条带清晰、稳定性强且多态性明显的引物。利用10对引物对6份连翘种质进行遗传多样性分析,扩增得到25个等位基因,有效等位基因数平均值为1.86。本研究通过聚丙烯凝胶电泳开发出10对连翘SSR分子标记,能有效区分不同连翘种质资源,同时验证了SSR分子标记是连翘遗传多样性分析的一种高效、稳定的技术手段。
马致静刘灵娣温春秀赵敏李晓东姜涛
关键词:连翘转录组SSR分析分子标记种质资源
基于SSR分子标记构建盘锦大米DNA指纹图谱
2025年
建立了一种基于简单重复序列(Simple sequence repeat,SSR)标记技术和微芯片电泳技术鉴别方法,对辽宁省盘锦地区主要耕种的水稻进行检测,并建立盘锦大米DNA指纹图谱库,构建11个品种盘锦大米二维码和条形码。结果表明,48对引物在11个品种盘锦大米中共检测到438个等位基因,每对引物检测到的等位基因数平均为9个。筛选获得能完全区分11个品种盘锦大米的4对核心引物RM551、RM1195、RM1、RM7102,根据微芯片电泳检测的结果,构建了盘锦大米的DNA指纹图谱库。本项研究为盘锦大米品种质量真伪检测、水稻种子质量溯源评价和保护起到重要作用。
章沙沙
关键词:盘锦大米DNA指纹图谱微芯片电泳
姜荷花SSR分子标记的开发及遗传多样性分析
2025年
以前期转录组测序结果为基础,利用SSR分子标记技术对姜荷花SSR引物进行开发,并验证所开发引物的通用性及有效性,分析其多态性。用Primer 6.0软件设计的97对引物在姜荷花资源中进行验证,确定了32对具有多态性的SSR引物。32对引物多态信息含量(polymorphism information content,PIC)平均值为0.5047,期望杂合度(expected heterozygosity,He)平均值为0.284。Shannon遗传多样性指数(Shannon's information index,I)平均值为0.435;平均遗传分化系数(genetic differentiation,Fst)为0.642。通过N-J聚类图分析,得出此32对引物可有效理清10份姜荷花资源之间的亲缘关系。为姜荷花各品种的重要性状基因遗传定位和遗传多样性的研究提供了重要基础数据,有利于姜荷花的鉴定及遗传研究。
江素华王晓娟柯玲俊林金水陆銮眉余惠文
关键词:姜荷花SSR
基于SSR分子标记的油棕种质资源遗传多样性分析
2025年
为分析10个新引进油棕种质资源的遗传多样性,本研究利用已开发的18对SSR分子标记对其进行遗传结构及多样性分析。结果表明,共获得87个等位基因(Na),平均Na为4.8。各SSR之间的有效等位基因数(Ne)和期望杂合度(He)存在较大差异,其中SSR14的Ne值(4.4374)和He值(1.0548)最大,SSR18的Ne值(1.2539)和He值(0.3298)最小。平均Ne值为3.0638,平均He值为0.7121,该结果表明本次引进的油棕种质遗传多样性较好。He值>0.50的共有16个SSR(SSR5和SSR18除外),18个SSR引物的固定指数(Fis)均为正值,该结果说明本次新引入的油棕种质的变异度较大。F_(st)变化范围为0.1635~0.7346,F_(st)平均值为0.4356,10个油棕种质的观测杂合度(Ho)和He分别为0.1597~1.0103和0.2559~0.6051,平均有效等位基因数(Ne)和期望杂合度(He)分别为0.6248和0.5902。此外,YN07和YN09的遗传距离最近,YN07和YN06的遗传距离最远。10份油棕种质的遗传结构和遗传多样性较为丰富。本研究为培育中国优异油棕新品种提供材料基础。
周丽霞吴秋妃李睿冯美利陈玲玲曹红星
关键词:油棕SSR分子标记
一种SSR分子标记及其在刺梨品种鉴定中的应用
本发明涉及植物育种技术领域,尤其涉及一种SSR分子标记及其在刺梨品种鉴定中的应用。所述SSR分子标记包括如SEQ ID NO.1‑16所示的核苷酸序列,这些核苷酸序列依次针对8个SSR位点。本发明提供的SSR分子标记可以...
黄秦军刘粉粉莫亮团刘成功高铖铖张雪梨刘宁
利用SSR分子标记分析玉米种质资源的遗传多样性
2025年
种质资源的遗传多样性是育种工作的重要物质基础,在玉米新品种选育和品种改良中发挥着十分重要的作用。为确保种质资源的合理利用,利用40对SSR引物对342份玉米新种质进行了遗传多样性分析。结果表明:共检测出205个等位基因位点,每对引物可检测到的等位基因数在2~8个之间,平均为5.125个;有效等位基因数为1.656~7.664,平均为4.658;多态性信息含量为0.318~0.855,平均为0.722。通过邻接法聚类分析,将342份玉米种质划分为6个类群,其中来源明确的玉米种质和标杆自交系的类群归属与系谱完全吻合。该批种质材料研究结果可以为玉米育种中种质创新、组合选配提供丰富的种质资源和有用的遗传信息。
闫雪纯马昕兰进好
关键词:玉米种质资源SSR分子标记
一种用于茶树亲本鉴定的Penta SSR分子标记及其应用
本发明公开了一种用于茶树亲本鉴定的Penta SSR分子标记及其应用,涉及分子标记技术领域,该分子标记包括在铁观音基因组中25个Penta SSR分子标记中的至少一种。本发明还公开了用于茶树亲本鉴定的引物、试剂盒以及其在...
谭礼强常开玲刘莹琦唐茜陈盛相陈玮张冬川
一种鉴别卡特兰属品种的SSR分子标记引物及其应用
本发明属于分子生物学的技术领域,具体涉及一种鉴别卡特兰属品种的SSR分子标记引物及其应用。所述卡特兰属的包括近缘属蝴蝶兰属、石斛属、树兰属;所述鉴别卡特兰属品种的SSR分子标记物包括SSR1~SSR50,其核酸序列分别如...
徐振江阳茜饶得花刘洪江院罗俊波陈孟强黄展权

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曹秋芬
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供职机构:黑龙江八一农垦大学食品学院
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