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十字花科植物调控硫苷合成MYB转录因子的生物信息学分析
2025年
【目的】本研究聚焦于十字花科植物中调控硫苷(Glucosinolate,GSL)合成的MYB转录因子,旨在系统分析其进化动态、基因在染色体上的分布、共线性关系及基因表达模式,以揭示硫苷合成途径的进化机制及其在植物适应性中的作用。【方法】对29个染色体水平的十字花科物种构建物种树,分析全基因组加倍事件对MYB转录因子数量的影响。在29个物种中鉴定与硫苷合成相关的MYB转录因子,并对芸薹族中的相关转录因子进行系统发育和结构域分析。进行染色体定位分析,研究这些转录因子在染色体上的分布特征。开展共线性分析,揭示这些基因在不同物种间的进化保守性与分化特征。分析基因表达模式,研究它们在不同组织中的表达特异性。【结果】全基因组加倍事件显著增加了MYB转录因子的数量,尤其是在芸薹族中。在29个物种中共鉴定出322个与硫苷合成相关的MYB转录因子,其中芸薹族植物中鉴定到176个。芸薹族中与硫苷合成相关的MYB转录因子在进化树上呈现显著的聚类特征,表明其在进化过程中保留了相似的结构与功能。染色体定位分析显示,这些转录因子主要分布在染色体末端,可能与其表达调控的灵活性相关。共线性分析揭示了这些基因在不同物种间的进化保守性与分化特征。基因表达模式分析发现它们在不同组织中表现出显著的特异性表达。【结论】本研究为理解芸薹族植物硫苷合成途径的进化机制及其在植物适应性中的作用提供了重要的分子基础,并为后续功能验证和应用研究提供了新视角。
李春金何靖华张欣瑶曹睿宋小明
关键词:十字花科硫苷MYB转录因子进化机制
绿豆R2R3-MYB转录因子家族鉴定及其类黄酮合成调控基因的筛选
2025年
R2R3-MYB转录因子家族在植物次生代谢物合成、胁迫应答和生长发育等生命过程起着重要的调控作用。本研究基于生物信息学鉴定了绿豆(Vigna radiata L.)全基因组水平的R2R3-MYB转录因子,并对其理化性质、系统进化、染色体定位、启动子顺式作用元件及基因结构做了预测分析;此外,转录组数据和实时荧光定量PCR(QuantitativeReal-timePCR,RT-PCR)分析该转录因子在不同组织、逆境胁迫下的表达模式;并基于相关分析及蛋白互作网络,筛选到可能参与调控绿豆类黄酮生物合成的R2R3-MYB成员。结果表明,共鉴定到168个R2R3-MYB成员,其中145个分布于11条染色体, 23个成员染色体信息未知;大多数R2R3-MYB含有3个外显子,编码99~1645个氨基酸,均为亲水性蛋白;系统进化将绿豆R2R3-MYB基因家族分为30个亚组(V1~V30),不同亚组成员的基因结构存在差异;共线性分析表明,片段复制事件均进行了纯化选择;启动子顺式作用元件分析表明,绿豆R2R3-MYB基因启动子区含有大量激素响应、胁迫响应及少量的类黄酮合成响应等元件;基因表达分析表明,在叶片、叶柄、下胚轴和籽粒种皮中表达量较高的成员分别占15.5%、16.1%、16.1%和10.7%。RT-PCR分析发现,几乎所有的R2R3-MYB家族成员在低温胁迫下的相对表达量显著下调,不同成员对逆境胁迫有不同的响应模式。蛋白互作与相关性分析可知,VrMYB6、VrMYB77、VrMYB93这3个基因可能参与了绿豆类黄酮生物合成的调控。
郭飞翔李春霞周爽郭彬彬张均马超
关键词:绿豆
参与胡薄荷酮生物合成调控的两个MYB转录因子及其应用
本发明以荆芥柠檬烯合酶(StLS)基因启动子为诱饵,利用生物筛选方法筛选出两个参与荆芥胡薄荷酮生物合成调控的MYB转录因子即StMYB76和StMYB13。这两种基因具有的核苷酸序列如SEQ:NO.1和SEQ:NO.2所...
刘潺潺王雪党静洁吴啟南
一种新型MYB转录因子用于提高植物中花青素的含量
本发明属于转基因生物合成技术领域,具体涉及一种新型MYB转录因子用于提高植物中花青素的含量。本发明从暴马丁香中分离出SrMYB1基因,该SrMYB1基因经基因工程技术,构建表达载体,利用农杆菌介导的侵染方法,得到过表达S...
郑贞贞叶广继王彬
一种改变五唇兰花色的MYB转录因子及其应用
本发明公开了一种改变五唇兰花色的MYB转录因子及其应用。所述的转录因子PpMYB1的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。本发明从五唇兰的花瓣中克隆出PpMYB1基因,通过农杆菌介导的叶盘法稳定转化至烟草中,结果发现P...
文健强曾宋君房林曾晶珏吴坤林李琳
一种同时促进分蘖和穗发育的MYB转录因子OsMYBR17基因在提高水稻产量中的应用
本发明属于植物基因工程技术领域,涉及作物育种技术领域,具体涉及一种同时促进分蘖和穗发育的MYB转录因子OsMYBR17基因在提高水稻产量中的应用,OsMYBR17基因编码的蛋白质为氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示的...
方中明金锋黄玮婷赵全志
沙地云杉MYB转录因子家族鉴定及其对盐胁迫的响应
2025年
沙地云杉(Picea mongolica)具有耐寒、耐旱及耐盐的优良特性,是“三北”地区生态建设及城市绿化的重要树种。MYB转录因子可以响应非生物胁迫及次生代谢产物合成过程,为鉴定沙地云杉MYB转录因子家族并探究其在盐胁迫过程中的响应,本研究以挪威云杉基因组及沙地云杉转录组数据为参考,共鉴定出196个MYBs家族成员。根据系统进化树,MYB转录因子家族分为7个亚类,其中,R2R3-MYB亚类基因数量最多,占84.77%,R-R和R1R2R3亚类数量最少,均占0.51%。基序、结构域、基因结构及保守性分析表明,同一亚类MYB转录因子具有高度保守性且具有相似基序和基因结构。不同盐胁迫梯度实验表明,沙地云杉最高的耐受盐胁迫浓度为1000 mmol/L。在1000 mmol/L盐胁迫浓度下设置不同处理时间(0、3、6、12、24 h)并测定转录组数据,共筛选出34个MYBs差异表达基因,表明其可能在调控盐胁迫过程中发挥着重要作用。对差异基因编码的蛋白进行理化性质分析发现,蛋白序列长度在89–731 aa,分子量约为10.19–79.73 kDa,等电点为4.80–9.91,不稳定系数41.20–70.99。亚细胞定位显示,大部分蛋白位于细胞核,3个蛋白位于叶绿体中。选取其中12个MYB基因进行实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)验证,其表达模式与RNA-seq数据一致。本研究为后续探索沙地云杉中MYB家族成员在响应盐胁迫过程的功能及作用机制提供了数据支持。
隋明明张富满田甜闫艳秋耿乐李慧白玉娥
关键词:沙地云杉盐胁迫
荆芥MYB转录因子基因StMYB71及其病毒诱导的基因沉默载体和应用
本发明涉及基因工程体,具体公开了荆芥MYB转录因子基因SMYB71及其病毒诱导的基因沉默载体和应用;这种基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,编码产物的氨基酸序列如SEQID NO.2所示,通过对荆芥MYB转录因...
刘潺潺党静洁李迪帅王雪沈家波吴啟南
一种杧果MYB转录因子、互作蛋白及其在增强抗病性中的应用
本发明提供一种杧果MYB转录因子、互作蛋白及其在增强抗病性中的应用,所述杧果MYB转录因子命名为MiMYB44转录因子,其编码基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,互作蛋白为1‑氨基环丙烷‑1‑羧酸氧化酶ACO,...
张贺刘志鑫孙宇蒲金基高爱平罗睿雄
一种受GA诱导的木薯MYB转录因子功能验证方法
本发明属于生物工程技术领域,公开了一种受GA诱导的木薯MYB转录因子功能验证方法,包括以下步骤:步骤S1.MeGAMYB基因的克隆;通过PCR方法扩增获得含有碱基序列1533bp片段的木薯MeGAMYB基因;步骤S2.M...
罗秀芹韦卓文薛晶晶蔡杰安飞飞陈松笔张贝罗秀平

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唐益雄
作品数:66被引量:774H指数:17
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杨文杰
作品数:57被引量:128H指数:7
供职机构:淮阴师范学院
研究主题:大豆 MYB转录因子 基因表达调控 根系活力 小麦
李景文
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研究主题:大豆 苦豆子 编码基因 大豆异黄酮 异黄酮
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作品数:100被引量:665H指数:15
供职机构:兰州大学草地农业科技学院
研究主题:百脉根 编码基因 逆境胁迫 转录因子 MYB转录因子
王庆钰
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研究主题:大豆 苦豆子 编码基因 异黄酮 向日葵