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史宾格犬ASIC1基因SNPs对mRNA二级结构的影响: 2023年; 胞外pH值的下降能激活一种在体内广泛分布的特殊配体门控通道,即酸敏感离子通道(scid-sensing ion channels, ASICs)。ASICs也称作H+门控离子通道,是上皮钠离子通道/退化蛋白(ENaC/DEG)超家族一个分支。ASICs由5个功能基因编码,分别为ASIC1、ASIC2、ASIC3、ASIC4和ASIC5。迄今为止,已克隆出ASICs的7个亚单位:ASIC1a、ASIC1b、ASIC2a、ASIC2b、ASIC3、ASIC4、ASIC5,不同亚基存在分布特异性,7个亚基可以组成同聚体或异聚体酸敏感离子通道。ASIC1a是哺乳动物体内含量最为丰富的ASICs亚基,由ASIC1基因编码,广泛分布于中枢神经系统和外周感觉神经元。; 朱程程程占军万宁佘奕李来有; 关键词：酸敏感离子通道感觉神经元 MRNA二级结构

藤壶cp19k基因mRNA二级结构对其在大肠杆菌中表达的影响被引量：1: 2019年; 目的探究藤壶cp19k基因5′端mRNA二级结构对其在大肠杆菌中表达的影响。方法通过对3个藤壶物种的cp19k基因(balcp19k、mrcp19k、bicp19k)序列进行分析,并利用大肠杆菌密码子偏好性对其进行优化,将优化后的3个基因序列利用BioSun软件分析其5′端和3′端的mRNA二级结构和自由能。利用大肠杆菌原核表达系统对3个基因进行表达,并通过SDS-PAGE观察蛋白表达情况。结果3个基因的3′端mRNA二级结构和自由能差异较小;5′端mRNA二级结构相比,balcp19k结构相对简单,自由能较高,mrcp19k和bicp19k二级结构较稳定,自由能较低。SDS-PAGE及Western印迹结果显示,Balcp19k蛋白有表达,而Mrcp19k蛋白和Bicp19k蛋白无表达。结论cp19k基因5′端mRNA二级结构稳定且自由能低不利于蛋白表达。此结果为藤壶cp19k的进一步研究奠定了基础,也为其他外源基因在原核系统中表达提供了借鉴。; 徐臻臻刘青付文亮李伍举邢薇薇王园园徐东刚刘中成; 关键词：MRNA二级结构自由能仿生材料

驯化酵母mRNA二级结构在同义位点受到广泛的正选择: mRNA是一类将遗传信息从DNA传递至蛋白质的核糖核苷酸分子链。作为分子生物学中心法则的关键节点,mRNA在整个信息传递过程中起到承上启下的作用。新近研究发现,mRNA与其他单链RNA分子相似,可以通过分子内碱基互补配对...; 于明皓; 关键词：MRNA二级结构正选择驯化

同义密码子使用偏性对mRNA二级结构及其相应蛋白质折叠速率的影响: 生物学家们对同义密码子使用偏性问题的研究一贯都是非常关注的。Grantham以及其他学者在很早就发现了密码子的偏性具有物种差异性的特点,以及发现具有相同偏好的不同表达基因。随着生物科学技术的迅速成长,许多的密码子使用偏性...; 黄俏; 关键词：冠状病毒 MRNA二级结构大肠杆菌

冠状病毒同义密码子使用对mRNA二级结构的影响: 2015年; 从NCBI中获得了45种冠状病毒的mRNA序列总计416条.分别计算了每条编码序列中相对同义密码子使用度(RSCU),然后预测每条mRNA序列的RNA二级结构,计算相应mRNA茎结构含量、环结构含量、单位平均折叠自由能以及mRNA柔性.由此,建立了冠状病毒mRNA二级结构数据库.在此基础上,分析每条mRNA序列同义密码子使用度与mRNA二级结构之间的相关性.分析结果表明,有90%的氨基酸所对应的密码子使用度与mRNA茎结构含量显著相关;有75%的氨基酸所对应的密码子使用度与mRNA环结构含量显著相关;有90%的氨基酸所对应的密码子使用度与单位平均折叠自由能显著相关;有85%的氨基酸所对应的密码子使用度与mRNA柔性显著相关.进一步分析发现,同时与茎结构含量和环结构含量都显著相关的密码子,它们的使用度与两种结构含量的相关性截然相反,在所选的参量中,柔性与同义密码子使用度显示出更好的相关性.结果证实,冠状病毒同义密码子的使用对mRNA二级结构存在很大的影响.; 黄俏李瑞芳于志芬李雪; 关键词：冠状病毒 MRNA二级结构

翻译过程中mRNA二级结构的功能研究: m RNA是单链分子,倾向于通过自身碱基互补配对形成大量稳定的二级结构。这些结构是m RNA上最要的翻译调控因素之一,参与了m RNA的细胞质定位、翻译起始、蛋白质共翻译折叠等过程的调控。m RNA二级结构可通过结构稳定...; 毛圆辉; 关键词：选择压

mRNA二级结构对酿酒酵母翻译效率的影响: 翻译是基因表达的关键过程之一,其效率对于生命活动十分重要。mRNA作为翻译体系的重要组成部分,在编码蛋白质的同时,对翻译速率起一定程度的调控作用。mRNA二级结构就是调控翻译速率的一种方式。研究mRNA二级结构对翻译速率...; 马涛; 关键词：酿酒酵母 MRNA二级结构荧光强度

mRNA二级结构自由能在不同物种中的分布差异研究: RNA单链分子在细胞中会折叠形成各种各样的二级结构,这些二级结构与RNA功能的发挥密不可分。就信使RNA而言,它们的二级结构在各种生命过程中发挥着重要作用,其中包括蛋白质的折叠和转运,翻译过程的起始和延伸,并且能够影响翻...; 王琛; 关键词：MRNA二级结构自由能进化距离

稻瘟菌MgCYP51B基因稀有密码子和mRNA二级结构分析与表达优化被引量：5: 2014年; 在大肠杆菌中异源表达稻瘟菌CYP51(P450-14DM,MgCYP51B)基因,通过对MgCYP51B进行跨膜区预测和同源模建分析,并截短稻瘟菌CYP51B基因,构建了9种不同的重组表达质粒以实现蛋白表达.结果表明:只有pET28-MgB-83在3种宿主菌中实现了表达,且在BL21(DE3)pLysS中表达量最大.通过对稀有密码子和mRNA翻译起始区二级结构进行分析,发现稀有密码子和mRNA翻译起始区二级结构稳定性对MgCYP51B蛋白的表达都有影响,适用于稀有密码子表达的Rossetta(DE3)并不适用于MgCYP51B基因的最优表达.同时只有翻译起始区二级结构自由能最低的pET28-MgB-83才能实现表达.本研究实现了稻瘟菌MgCYP51B基因在大肠杆菌中的异源表达,证实密码子的偏爱性和翻译起始区二级结构稳定性影响MgCYP51B蛋白表达.; 齐婷刘婧李倩余金辉袁永泽刘德立; 关键词：翻译起始区稀有密码子

mRNA二级结构与基因功能和基因必要性的关系: RNA是最重要的生物学分子之一，不仅是生物体遗传信息的中心媒介，还在一系列生物过程中发挥重要功能，如催化RNA剪接加工，修饰前体RNA，调控翻译过程，影响RNA的降解和定位等等。RNA的种类繁多，主要包括mRNA、rRN...; 李倩; 关键词：MRNA二级结构细胞过程

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