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聚脯氨酸-精氨酸与DNA相互作用的研究: 2025年; 阳离子多肽与脱氧核糖核酸(DNA)的相互作用对生物学的基础研究以及在众多疾病的发病机理有着重要的意义。文章使用光学显微镜首先研究了聚脯氨酸-精氨酸(Poly PR)与单链鲑鱼精DNA相互作用的液液相分离(LLPS),发现多肽链长以及浓度的增加会促进LLPS;然后观察KCl浓度对Poly PR-DNA溶液LLPS的影响,发现KCl浓度的增大对其LLPS起到一个抑制的作用,当KCl的浓度大于800 mmol/L时,液滴消失;同时盐浓度不变时,随着DNA浓度的增大会对混合物的LLPS有促进作用。其次研究KCl浓度为100 mmol/L时Poly PR与双链鱼精DNA的相互作用的LLPS,发现双链DNA较单链DNA更难发生LLPS。最后,为了定量研究DNA与Poly PR的作用机制,用单分子磁镊(MT)测量Poly PR与DNA的临界凝聚力变化情况,从单分子层面分析其作用机理,实验结果表明随着Poly PR链长以及浓度的增大使得DNA的凝聚力也增大;并且测量了加入KCl溶液之后凝聚力的大小,发现凝聚力随着盐浓度的增加而减小。可见,单分子实验凝聚力结果与显微镜观察LLPS结果一致,得出多肽链的长度及浓度可以增强Poly PR与DNA的相互作用、盐离子浓度会减弱Poly PR与DNA的相互作用。; 孙慧芳卢静钘何雪童王艳伟杨光参; 关键词：凝聚力

一种基于生物素:亲合素的二抗:转座酶复合物及其在检测蛋白质与DNA相互作用中的应用: 本发明提供一种基于生物素:亲合素的二抗:转座酶复合物及其在检测蛋白质与DNA相互作用中的应用。; 易文洋曹林聂俊伟瞿志鹏江明扬

苯乳酸与DNA相互作用及其抑菌机制研究被引量：2: 2024年; 苯乳酸作为新兴的绿色高效抑菌剂,是传统化学防腐剂的理想替代品,在食品发酵工业方面有着广泛的应用。该研究聚焦于苯乳酸与DNA的相互作用以及在苯乳酸胁迫下的关键基因表达变化。发现苯乳酸能够通过氢键作用与范德华力并以插嵌的方式与DNA相互结合。结合分子对接构建了苯乳酸-ctDNA结合模型,结果表明苯乳酸更倾向于插入DNA的CG碱基对之间。最后通过转录组测序分析了苯乳酸胁迫乳酸片球菌DY15后基因表达变化,发现差异基因富集于细胞壁成分与核酸合成修复方面,说明细胞壁与基因组DNA可能是苯乳酸的主要攻击靶点。乳酸菌酸胁迫应答机制的改变说明精氨酸代谢途径也可能是苯乳酸抑菌过程中的关键靶点,通过抑制基因表达从而降低细菌酸耐受性,进而抑制细菌生长。总而言之,该研究解析了苯乳酸的抑菌机制,为后续苯乳酸作为生物抑菌剂的应用提供了理论支撑。; 贾以泽舒泉先丛瑞涛毛银周胜虎邓禹; 关键词：苯乳酸 CTDNA 光谱法分子对接转录组

Synthesis,crystal structure,and DNA‑binding of binuclear lanthanide complexes based on a multidentate Schiff base ligand: 2024年; Two new dinuclear lanthanidecomplexes,namely[Ln_(2)(dbm)_(2)(HL)_(2)(CH_(3)OH)_(2)]·4CH_(3)OH[Ln=Tb(1)and Dy(2),Hdbm=dibenzoylmethane]have been synthesized using prepared multidentate Schiff base ligand H_(3)L(hydroxy‑acetic acid(4‑diethylamino‑2‑hydroxy‑benzylidene)‑hydrazide)with good biological activity.Structure characterizations show that the complex comprises two Ln3+ions,two dbm-ions,two HL^(2-)ligands,two CH_(3)OH molecules,and four free methanol molecules.Each Ln^(3+)ion is eight‑coordinated.The two central Lnions are bridged by twoμ_(2)‑O atoms leading to a parallelogram[Ln2O2]core.The interaction between the compounds(H_(3)L,1,and 2)and the calf thymus DNA(CT‑DNA)has been further confirmed by UV‑Vis spectrometry,fluorescence titration,and cyclic voltammetry.The results showed that both 1 and 2 could undergo insertion with CT‑DNA.CCDC:2343005,1;2343006,2.; GUAN XiaofenLIU YatingLI JiaHU YiwenDING HaiyuanSHI YuanjingWANG ZhiqiangWANG Wenmin; 关键词：DNA INSERTION

一种中药活性成分与DNA相互作用的研究方法: 本发明提供一种中药活性成分与DNA相互作用的研究方法，涉及中药活性研究领域。该基于一种中药活性成分与DNA相互作用的研究方法，包括，S1、选取具有潜在生物活性的中药材，利用超声波辅助萃取装置，以提高提取效率和活性成分的得...; 张新勇王海波李欣宇郭振超鲁佳雯路彤窦金凤周丽丽

三种糖基化中间产物与小牛胸腺DNA相互作用的多光谱和分子动力学模拟: 2023年; 三种α-二羰基化合物:丙酮醛(MGO)、丁二酮(DA)和乙二醛(GO)作为常见的高反应活性的糖基化中间体,会对体内的生物大分子(如DNA)造成损伤。MGO、DA和GO与小牛胸腺DNA(ctDNA)的相互作用特性通过多光谱方法结合计算机模拟技术进行测定。紫外光谱分析表明,范德华力和氢键驱动MGO、DA和GO与ctDNA发生自发结合,分子动力学模拟中的各能量分布佐证了这一结论。在25℃下,MGO、DA和GO与ctDNA的结合常数接近经典的凹槽结合剂,其值分别为2.99×103、1.96×103和1.05×103L·mol-1。NaCl、单双链DNA、热变性、粘度和园二色谱实验证明了MGO、DA和GO与ctDNA均通过凹槽方式结合。分子对接直观显示了MGO、DA和GO是结合在DNA富含AT的小沟区,其中DT7和DA18是结合的活性位点。分子动力学模拟显示MGO-ctDNA复合物较游离ctDNA有更高的均方根偏差(RMSD)、回旋半径(Rg)和均方根波动(RMSF)值,说明MGO的结合使DNA结构部分松散,稳定性减弱。凝胶电泳实验表明,在赖氨酸和Cu2+存在下,MGO、DA和GO均能损伤质粒DNA,MGO和GO甚至会完全破坏DNA的超螺旋形态。; 吴健妹张国文; 关键词：小牛胸腺DNA 相互作用分子动力学模拟

镝离子与DNA相互作用的研究: 2023年; 镝(Dy)离子具有独特的特性,可以与DNA相互作用形成金属—DNA复合物。这在医学、生物和纳米技术领域具有重要的意义。然而到目前为止,对于镝离子与DNA之间的相互作用的机制动力学过程等问题并没有完全解决。本文通过磁镊、原子力显微镜、动态光散射技术在单分子水平上研究了镝离子与DNA相互作用的动力学以及Dy3+—DNA的形貌图。动力学结果表明,镝离子可以以浓度和力依赖的方式导致DNA凝聚。形态学表征验证了低浓度镝离子不会诱导DNA凝聚,而高浓度的镝离子可以诱导DNA凝聚成团状。并且随着镝离子浓度的增加,DNA的尺寸和电泳迁移率也会减小,直至趋近于0。; 杨紫阳; 关键词：DNA 镝离子

苯并噻唑类过渡金属配合物的合成、晶体结构及其与DNA相互作用的研究: 金属配合物是由中心金属原子或离子与有机配体配位而组成的具有不同空间构型的化合物,兼具有机化合物和无机金属离子的特征,在发光材料,催化,气体吸附等方面都具有良好的发展前景。其中,含氮杂环金属配合物因具有良好的生物活性而被广...; 宋晓彤; 关键词：苯并噻唑过渡金属配合物 DNA结合

MNDA--HIN与双链DNA相互作用的结构基础: PYHIN(PyrinandHINdomaincontainingprotein)基因家族是Ⅰ型和Ⅱ型干扰素诱导基因，在包括细胞周期控制、肿瘤抑制、转录调控、分化和细胞凋亡等细胞过程中起关键作用。PYHIN蛋白的HIN(...; 李越龙; 关键词：双链DNA 相互作用分子机制

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