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一种基于深度学习的直肠癌预后模型构建方法及系统
本发明涉及生物医学技术领域,揭露了一种基于深度学习的直肠癌预后模型构建方法,方法包括:识别直肠癌患者的疾病特征,根据疾病特征的基线标准,定义直肠癌患者的预后需求;确定直肠癌患者的病灶类型和影像学特征,结合病灶类型和影像学...
杨世斌
基于24个月内疾病进展的多发性骨髓瘤患者预后模型的建立及临床应用
2025年
目的:基于24个月内疾病进展(disease progression within 24 months,POD24)建立多发性骨髓瘤(multiple myeloma,MM)的预后模型并探索其临床意义。方法:选取2007年1月至2022年6月无锡市人民医院289例初诊MM患者作为训练组进行回顾性分析,通过对总生存期(overall survival,OS)进行Cox单因素及多因素分析,构建以POD24为基础的预后模型;并收集2015年8月至2019年12月苏州大学附属第一医院184例患者作为验证队列验证该模型的预测效能。结果:POD24组患者OS更短,年龄、β2微球蛋白、血清钙以及POD24是MM的独立预后因素,高危组(≥2分)的患者较低危组(<2分),OS(25.0个月vs.60.0个月)及无进展生存期(progression-free survival,PFS)(14.0个月vs.56.0个月)更短。且在验证队列总体患者及各亚组的患者中高危组和低危组间的OS、PFS比较,差异均无统计学意义(均P<0.05)。结论:基于POD24、年龄、β2微球蛋白、血清钙构建的预后模型在真实世界中对初诊MM患者具有预后价值。
龚盈盈曹永芹夏珺王晴晴孙超
关键词:多发性骨髓瘤预后分析预后模型
HOXB9与喉癌临床病理特征相关性研究及预后模型构建
2025年
目的明确喉癌预后标志物,探讨其与喉癌临床病理特征的关系并构建预后模型,为疾病的早期诊断和预后管理提供理论支持。方法筛选在多个喉癌数据集中共同上调的基因并进行单因素回归分析,明确喉癌预后的关键基因。收集自2010年1月至2019年12月空军军医大学唐都医院耳鼻咽喉头颈外科收治的240例喉鳞状细胞癌标本,利用免疫组织化学染色探究喉癌预后相关基因的表达与喉癌临床病理特征的相关性。使用R语言划分训练集和验证集,利用单因素回归分析、LASSO回归分析及Cox多因素回归分析明确喉癌预后的关键因素并构建训练集的预后模型,使用验证集进行验证。结果17个基因在3个喉癌数据集中上调2倍以上,其中,HOXB9的风险比最大(风险比=1.014,95%可信区间1.001~1.027,P=0.026)。免疫组织化学染色表明,HOXB9表达与喉癌患者临床分期、T分期和病理分级存在相关性(P<0.05)。多因素回归分析表明,年龄、T分期、N分期、HOXB9是喉癌预后的独立危险因素(P<0.05)。根据多因素分析的结果构建列线图,训练集预测喉癌患者1、3、5年存活率的受试者工作特征曲线下面积分别为0.769、0.802和0.820,使用验证集预测1、3、5年存活率的曲线下面积分别为0.948、0.810和0.813。结论本研究筛选了喉癌预后标志物HOXB9,年龄、T分期、N分期及HOXB9是喉癌预后的独立危险因素,基于上述危险因素构建的列线图预测模型可用于喉癌患者的早期诊断和预后管理。
范鑫陈浪浪吕金鹏卞卡
关键词:喉癌预后标志物预后模型列线图
宫颈癌预后相关铁死亡基因的筛选及其预后模型的构建
2025年
目的筛选与宫颈癌预后相关的铁死亡基因并构建预后模型。方法从FerrDb数据库获取铁死亡基因,从全基因组关联研究和肿瘤基因图谱数据库获取宫颈癌相关数据,进行全转录组关联研究、共定位分析和差异表达分析,筛选出与铁死亡相关的候选基因,并对基因进行基因本体功能富集分析和京都基因与基因组百科全书通路富集分析。采用单因素Cox回归分析进一步筛选出与宫颈癌预后相关的基因;Kaplan-Meier法分析基因与患者总生存期的关系;通过TIMER数据库分析基因在泛癌中的表达水平。构建2个预后预测模型,模型1纳入年龄和肿瘤分期,模型2纳入年龄、肿瘤分期和预后相关基因,并比较2个模型的预测能力。结果共获取91个与铁死亡相关的候选基因。单因素Cox回归分析显示15个基因与宫颈癌预后相关,CA9、SCD、TFRC、QSOX1和CDO1是影响宫颈癌患者预后的危险因素(P<0.05),PTPN6、ALOXE3、HELLS、IFNG、MIOX、ALOX12B、DUOX1、ALOX15、AQP3和IDO1是保护因素(P<0.05)。15个基因的mRNA表达水平在至少7种癌症中表现出显著上升或下降,TFRC关联的癌症种类最多,为19种。Kaplan-Meier分析显示HELLS、DUOX1和ALOXE3与宫颈癌不良预后有关。模型1预测宫颈癌患者1年和3年总生存率的AUC分别为0.455和0.478,模型2的AUC分别为0.854和0.595,模型2(C-index=0.727)的预测能力优于模型1(C-index=0.502)。结论基于生物信息学筛选出的15个预后相关基因组成的预后模型对宫颈癌患者的生存结局有较好的预测性能,为宫颈癌患者的预后评估提供重要参考价值。
陈悦陈雯昕蒋溢张冬许波群
关键词:宫颈癌预后模型
基于血浆miRNA组合标志物的肺癌脑转移预后模型的构建与应用
本发明公开了一种基于血浆miRNA组合标志物的肺癌脑转移预后模型的构建与应用。本发明基于血浆miRNA组合标志物构建肺癌脑转移的预后模型,血浆miRNA组合标志物包括miR‑31‑5p、miR‑219‑5p、miR‑1‑...
郑书钰季剑雄周凤淇俞晓波严锋陈高
基于肿瘤浸润免疫细胞的甲状腺癌患者甲状腺半切术后预后模型的构建及初步评价
2025年
目的:探讨构建及初步评价甲状腺癌患者甲状腺半切术后肿瘤浸润免疫细胞的预后模型。方法:从癌症基因库(TCGA)中选取2020年11月至2022年11月的152例甲状腺癌甲状腺半切术后患者的基因表达谱与随访参数;采用ssGSEA量化肿瘤组织中免疫细胞浸润的情况;采用LASSO筛选重要预测因子以验证预后与不同浸润免疫细胞之间的关系;以合适的细胞构建预后风险评分模型,并将甲状腺癌患者分为高、低风险组,使用Kaplan-Meier生存曲线进行验证;以风险模型为基础构建列线图模型以预测甲状腺癌患者的存活率及治疗无效率;使用受试者工作特征(ROC)曲线以及AUC验证列线图准确性;采用校准曲线比较列线图模型的预测结果与观察结果;使用临床决策曲线鉴别预测模型的可靠性。结果:采用ssGSEA量化免疫细胞浸润数据得到22个浸润免疫细胞,包括活化肥大细胞、幼稚B细胞、未活化肥大细胞、浆细胞、CD8^(+)T细胞、γδT细胞、幼稚CD4^(+)T细胞、活化记忆CD4^(+)T细胞、Treg细胞、滤泡辅助性T细胞、记忆B细胞、活化NK细胞、未活化NK细胞、未活化记忆CD4^(+)T细胞、M0巨噬细胞、单核细胞、M1巨噬细胞、嗜中性粒细胞、未活化树突状细胞、活化树突状细胞、M2巨噬细胞和嗜酸性粒细胞;选取的预测因子为6个免疫细胞,分别是M0巨噬细胞、M2巨噬细胞、活化树突状细胞、未活化肥大细胞、CD8^(+)T细胞、单核细胞;根据这6个浸润的免疫细胞,计算样本的风险评分,风险评分与高风险组甲状腺癌患者和预后不良人数成正比;采用Kaplan-Meier制作生存曲线,结果为低风险组总生存时间明显长于高风险组(Log-Rankχ^(2)=4.524,P=0.024);预后列线图模型总分425分,死亡风险79.12%;治疗效果列线图模型总分406分,对应治疗无效的风险为77.97%,经过模型验证结果较可靠。结论:对肿瘤浸润的免疫细胞在甲状腺癌患者中的评分�
杨小丽张勇陈敏
关键词:预后模型甲状腺癌
一种基于肿瘤衰老基因的肾透明细胞癌分子亚型和预后模型构建方法及装置
本发明公开了一种基于肿瘤衰老基因的肾透明细胞癌分子亚型和预后模型构建方法及装置,包括数据集;从数据库中获取肿瘤衰老基因;在数据集中提取肿瘤衰老基因的表达数据框,并进行无监督层次聚类分析得到两种亚型;比较得到的两种亚型的基...
朱忠旭陈静月杨焕明董伟
一种急性髓系白血病预后模型的构建方法、系统
本发明属于生物信息学技术领域,具体涉及一种急性髓系白血病预后模型的构建方法、系统,通过进行差异表达分析,得到批次效应较小的共有差异表达基因后,经加权基因共表达网络分析,识别出与临床性状相关性高的模块来作为关键模块,依次经...
朱晓朱超群穆培政权威赵九州
基于机器学习的肺腺癌细胞焦亡预后模型构建与验证
2025年
目的基于细胞焦亡相关基因(PRGs),构建肺腺癌预后模型,并评估其与免疫调节的关联。方法从TCGA数据库中获取肺腺癌基因表达和临床数据,通过DESeq2法获得差异表达PRGs;将患者分层抽样后按7∶3的比例划分为训练集和验证集,通过Cox回归和Lasso回归筛选目标因子并构建预后模型;在训练集、验证集和3个测试集(GSE30219、GSE31210和GSE50081)中通过生存分析、ROC曲线、Cox回归分析等评估预后模型的预测能力;绘制列线图观察预后模型联合临床特征在预后评估中的作用;分析预后模型与免疫细胞浸润的相关性。结果本研究构建了由CPA3、FAT1、MST1和TFAP2A等4个PRGs组成的肺腺癌预后模型。根据预后模型计算患者的风险评分,以中位值为界将患者分为高风险组和低风险组。高风险组患者预后较差(P<0.05);预后模型风险评分对肺腺癌患者具有良好的生存预测价值,并可作为独立的不良预后因素;基于预后模型和临床特征建立的列线图可有效预测患者的生存状态。免疫浸润分析表明高风险组患者处于免疫失调状态,CD274、CD276等免疫检查点分子表达显著升高。结论基于CPA3、FAT1、MST1和TFAP2A的预后模型可有效预测肺腺癌患者的预后,并与患者的免疫状态相关,可作为患者治疗及预后评价的指标。
陈少明胡艳洪旭东郑伟胡旭钢
关键词:肺腺癌预后模型列线图
基于K-ras和TP53共突变结肠癌患者免疫基因预后模型系统
本发明涉及一种基于K‑ras和TP53共突变结肠癌患者免疫基因预后模型系统及其构建方法。本预后模型系统中包括下述7个基因:DUOX2、BST2、CCL28、APOBEC3C、CD79B、GUCA2A和TNFRSF13C,...
王文杰练炼李先敏王莹

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王春红
作品数:65被引量:51H指数:4
供职机构:山西医科大学
研究主题:胶质瘤 胶质母细胞瘤 脑膜瘤 神经胶质瘤 预后模型
何侠
作品数:345被引量:764H指数:14
供职机构:江苏省肿瘤医院
研究主题:鼻咽癌 鼻咽肿瘤 调强放疗 放射疗法 鼻咽癌调强放疗
张京伟
作品数:58被引量:170H指数:8
供职机构:武汉大学中南医院
研究主题:乳腺癌 血管扩张刺激磷蛋白 胃癌 预后模型 预后
成睿
作品数:50被引量:68H指数:5
供职机构:山西医科大学
研究主题:胶质瘤 神经导航 脑膜瘤 神经内镜 创伤性脑损伤
李浩鹏
作品数:283被引量:1,163H指数:15
供职机构:西安交通大学
研究主题:脊髓损伤 嗅鞘细胞 寰枢椎脱位 嗅鞘细胞移植 前路