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一种可鉴别菠萝果实可溶性酸性转化酶基因AcoInv-1等位变异的分子标记和应用
本发明涉及农业生物技术技术领域,具体涉及一种可鉴别菠萝果实可溶性酸性转化酶基因AcoInv‑1等位变异的分子标记和应用。该分子标记用如下引物扩增而来:正向引物:5‑CTGCGAAATGAACTAGTCAACTC‑3,反向...
刘洋张秀梅付琼朱祝英高玉尧姚艳丽
一种可鉴别菠萝果实可溶性酸性转化酶基因AcoInv-2等位变异的分子标记和应用
本发明涉及农业生物技术技术领域,具体涉及一种可鉴别菠萝果实可溶性酸性转化酶基因AcoInv‑2等位变异的分子标记和应用。该分子标记用如下引物扩增而来:正向引物:5‑AGCGAGCACGCCGACATCC‑3,反向引物:5...
刘洋张秀梅付琼朱祝英高玉尧姚艳丽
菠萝酸性转化酶基因家族初步生物信息学及表达分析
2020年
酸性转化酶(acid invertase,AIN)在菠萝采后蔗糖降解过程中起着重要作用,基于菠萝全基因组数据库,预测菠萝AIN家族基因并进行生物信息学分析,解析其在采后菠萝不同贮藏温度下的表达变化情况,为阐明AIN基因在采后菠萝果实贮藏特性中的作用奠定基础。以水稻AIN家族基因为探针,在菠萝全基因组中鉴定到2个菠萝细胞壁酸性转化酶基因(cell wall acid invertase,CWIN)和2个液泡酸性转化酶基因(vacuolar acid invertase,VIN),分别命名为AcCWIN1、AcCWIN2、AcVIN1、AcVIN2,设计编码区引物进行测序验证,并进行生物信息学分析。进化分析结果表明,AcCWIN1、AcCWIN2和AcVIN1、AcVIN2蛋白分别归于细胞壁酸性转化酶和液泡酸性转化酶2个进化支上,且均属于糖基水解家族GH32,基因结构、保守域和保守基序均一致。荧光定量分析结果表明,菠萝果肉中AcVIN1和AcVIN2在果实采后贮藏过程中表达量升高,且AcVIN1在发生黑心病的部位大量表达,而AcCWIN1和AcCWIN2在采后贮藏过程中表达量逐渐降低,且随着贮藏温度的升高其表达量降低,预示AcVIN1、AcVIN2较AcCWIN1、AcCWIN2在菠萝采后蔗糖降解和黑心病的发生方面发挥着更为重要的作用。
宋康华侯晓婉贾志伟洪克前谷会张鲁斌
关键词:菠萝酸性转化酶生物信息学分析基因家族
铜胁迫对不同抗性种群海州香薷酸性转化酶基因启动子甲基化的影响被引量:4
2017年
采用亚硫酸氢盐测序技术,检测了Cu胁迫对海州香薷(Elsholtzia haichowensis Sun)Cu抗性和非抗性种群酸性转化酶基因启动子甲基化的影响。结果表明,海州香薷液泡转化酶基因(v INV)和细胞壁转化酶基因(cw INV)的启动子在CG位点分别表现出超甲基化和低甲基化的现象。酸性转化酶基因启动子CHG和CHH位点的甲基化状态受Cu胁迫影响较大。Cu胁迫下,v INV和cw INV启动子分别有1个CHG和6个CHH位点的甲基化状态在Cu抗性种群和非抗性种群之间表现出较大差异。抗Cu种群中这些甲基化差异位点对Cu胁迫不敏感,但在非抗性种群中这些位点的甲基化水平在Cu胁迫后出现大幅上升或下降。有些甲基化差异位点位于或者临近预测的启动子顺式作用元件区域,可能参与Cu胁迫下酸性转化酶基因的表达调控。
何宇宁徐仲瑞熊治廷
关键词:酸性转化酶CU胁迫海州香薷
铁皮石斛可溶性酸性转化酶基因克隆与表达分析被引量:6
2017年
【目的】克隆铁皮石斛Dendrobium officinale可溶性酸性转化酶基因SAI,分析该基因生物学信息及时空表达特异性。【方法】基于同源序列克隆铁皮石斛SAI基因c DNA全长,采用生物信息学方法进行序列分析,并采用qRTPCR进行组织特异性表达分析。【结果】铁皮石斛SAI基因全长为1 595 bp,c DNA编码区1 368 bp,Genbank登录号为KU598852。该基因编码455个氨基酸,蛋白相对分子质量为50 700。NCBI BLASTx分析表明,该基因氨基酸序列与柑橘Citrus unshiu酸性转化酶基因、甜橙C.sinensis酸性β-呋喃果糖苷基因序列相似性最高,达77%,与其他植物酸性转化酶基因的相似性均高于68%。聚类分析表明,铁皮石斛SAI基因与玉米Zea mays液泡转化酶基因、甘蔗Saccharum officinarum SAI基因亲缘关系最近。该基因编码的蛋白质属于非跨膜结构的亲水性热稳定蛋白,定位于液泡中。SAI基因在2年生铁皮石斛的茎中表达量最高,3年生的叶中表达量最低。【结论】成功克隆铁皮石斛液泡酸性转化酶基因,该基因在铁皮石斛不同组织不同生育时期的表达量差异较大。
孟衡玲张薇卢丙越苏一兰薛春丽
关键词:铁皮石斛酸性转化酶基因克隆实时荧光定量PCR
铜胁迫下海州香薷酸性转化酶基因启动子的甲基化研究
一些重金属虽然是植物必需的微量元素,过量也会对植物产生毒性,严重影响植物正常的生长代谢,但是一些金属型植物由于长期生长在富含重金属的土壤中,对高浓度的重金属产生了耐受性。海州香薷(Elsholtziahaichowens...
何宇宁
关键词:酸性转化酶启动子DNA甲基化铜胁迫海州香薷
文献传递
荔枝细胞壁酸性转化酶基因及其应用
本发明属于分子生物技术领域,首次克隆了5个荔枝细胞壁酸性转化酶(<i>CWAI</i>)基因全长,分别命名为<i>LcCWAI</i><i>?1</i&g...
王惠聪赵杰堂张洁琼吴子辰刘恋黄旭明
文献传递
高粱可溶性酸性转化酶基因(SAI-1)PCR克隆方法
2016年
可溶性酸性转化酶(SAI)是蔗糖代谢途径中的关键,对植物生长发育起着至关重要的调节作用,研究简捷快速克隆可溶性酸性转化酶基因方法,对于育种材料和品种资源的基因分型具有重要意义。本研究通过已知的高粱可溶性酸性转化酶基因序列及高粱基因组中该基因序列片段,设计引物,比较了分段克隆、基因全长克隆、巢式PCR克隆等方法克隆高粱SAI-1基因的效果,结果表明,直接扩增全长,扩增产物极其不稳定且扩增产物纯化、连接,转化后得不到阳性克隆;采用均等分段克隆,前半段扩增产物纯化、连接转化后得不到阳性克隆,但后半段克隆成功;针对高粱基因组信息中SAI-1基因上游的未知序列部分设计引物,进行单独克隆(635 bp),再单独克隆其其余序列,两段序列拼接后得到SAI-1基因全长。序列分析发现,SAI-1前段635 bp的扩增片段GC含量高达69.6%,而其后GC含量急剧下降至30%以下,所以推测全长克隆、均等片段克隆以及巢式PCR克隆失败的原因可能是SAI-1基因中GC分布不均匀,克隆高粱SAI-1基因较为适宜的方法为利用2对引物进行不均等分段扩增克隆,前段PCR退火温度较后段高1℃。该方法将为其他研究人员提供有益参考。
钟海丽聂元冬王智顿宝庆李桂英
关键词:高粱
铜胁迫下海州香薷不同抗性种群酸性转化酶基因表达差异研究研究
研究发现酸性转化酶的底物和反应产物为营养和信号分子,在植物响应环境刺激的过程中起着重要的调节作用.酸性转化酶基因的表达通常受到各种生物或非生物环境胁迫的调控,如病原菌感染、低温、低氧、水分缺失、机械损伤等.但迄今为止,酸...
蔡深文熊治廷徐仲瑞
关键词:香薷抗性种群铜胁迫酸性转化酶基因表达
毛竹酸性转化酶基因家族的鉴定及生物学功能初步分析
为研究毛竹(Phyllostachys edulis)中酸性转化酶基因家族的表达模式及其在开花和笋发育过程中的作用,本论文依据水稻中的酸性转化酶基因的序列,从毛竹基因组数据库中获得了转化酶基因家族,通过RT-PCR对其表...
陈虹君
关键词:毛竹生物学功能糖含量纤维素含量
文献传递

相关作者

于喜艳
作品数:41被引量:342H指数:11
供职机构:山东农业大学园艺科学与工程学院作物生物学国家重点实验室
研究主题:甜瓜 甜瓜果实 克隆 酸性转化酶基因 蔗糖磷酸合成酶
何启伟
作品数:225被引量:1,482H指数:22
供职机构:山东省农业科学院蔬菜花卉研究所
研究主题:大白菜 蔬菜 萝卜 甜瓜 黄瓜
刘洋
作品数:877被引量:4,176H指数:26
供职机构:新疆农垦科学院
研究主题:玉米 移栽机 山羊 马铃薯 白三叶
赵双宜
作品数:64被引量:470H指数:13
供职机构:山东大学
研究主题:萝卜 小麦 克隆 大白菜 雄性不育系
聂元冬
作品数:8被引量:22H指数:3
供职机构:中国农业科学院作物科学研究所
研究主题:甜高粱 SAI 酸性转化酶基因 基因克隆 可溶性