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近年湖南省猪圆环病毒2型感染状况的调查及遗传演化分析
2025年
本研究旨在掌握近期湖南省各地区猪圆环病毒2型(PCV2)最新的感染和遗传演化情况。本研究运用qPCR方法对2021-2023年采集自湖南省长沙市、岳阳市、怀化市、常德市、株洲市等14个地级市的1244份肥猪的淋巴结、拭子、脑组织及血样通过qPCR进行了病毒核酸检测,筛选出PCV2阳性样品,再通过PCR扩增及测序对PCV2的ORF2基因序列进行分析。结果显示,1244份样品中有778份为PCV2阳性,总阳性率达62.54%,其中邵阳市的PCV2阳性率最高,达92.55%(87/94),郴州市最低,为18.28%(17/93);57株PCV2 ORF2基因测序结果表明,PCV2a、PCV2b和PCV2d占比分别为12.28%、7.02%和80.70%;测序毒株间的ORF2基因核苷酸、氨基酸序列相似性分别为88.5%~100.0%和86.3%~100.0%,存在45个氨基酸差异位点,PCV2d间存在15个差异氨基酸位点,选择压力分析表明,PCV2存在3个阳性选择位点。研究表明:目前,PCV2的突变速率较快,各毒株之间存在较多的氨基酸位点差异,与既往报道相同,本研究中PCV2d已成为绝对优势的流行毒株,PCV2的这些变异可能使现有疫苗保护效果减弱,应予以重视。
范杰邰易润朱艳丽陈志雄胡巧云陈智刘甜甜李欣范仲鑫葛猛
关键词:猪圆环病毒2型分子流行病学调查ORF2基因
一株鸭源血清4型禽腺病毒主要结构蛋白的遗传演化分析及致病性研究
2025年
为确定2020年浙江地区某养殖场以肝脏白色点状坏死为特征的麻鸭发病原因,试验采集病鸭组织进行病原检测和分离鉴定,并对分离病原进行麻鸭致病性试验。结果显示:病原确定为血清4型禽腺病毒(Fowl adenovirus serotype 4,FAdV-4),命名为QZ20株;QZ20分离株与我国近年流行的FAdV-4毒株处于同一分支,核苷酸序列相似性高达98%~100%;QZ20分离株感染鸡肝癌细胞(Chicken liver hepatocellular carcinoma cell line,LMH)能够产生细胞病变效应(Cytopathic effect,CPE),能在LMH细胞中复制,病毒TCID50为105.5/0.1 mL;QZ20分离株接种鸡胚胚体潮红、全身弥漫性出血,并能致死鸡胚;QZ20分离株感染1日龄麻鸭可导致十二指肠、肝脏和肾脏均发生病理变化。研究表明,从患病麻鸭成功分离一株FAdV-4,其与我国鸡群中流行的FAdV-4差异较小,结果为FAdV-4的流行病学调查和防控提供依据。
黄聪李嘉黄远玲韩靖宜魏常青刘静宜陈鸿军陈宗艳
关键词:麻鸭
猪圆环病毒3型的鉴定和遗传演化分析
2024年
为了解宜宾市养殖场猪圆环病毒(PCV)3型的基因组特征和遗传变异规律。本试验利用PCR方法从流产母猪血液中鉴定出1株PCV3,命名为SC-YB2203。经过PCR方法扩增部分基因组序列,对测序结果拼接并进行系统进化树分析。结果显示:遗传进化树分析发现SCYB2203与广州株MK142771和美国株MK496279属于同一分支3f,与西班牙株MH579746和美国株MK496280亲缘关系较近,与四川株MZ449244和重庆株KY075990亲缘关系较远。序列分析发现SC-YB2203与参考序列之间的同源性最高的为重庆株KY075990(98.5%),与湖南株MG372488的同源性为87.7%,与其他国内株同源性较高(97.6%-98.5%)。
陈燕凌王颖旺杨潞杨漫漫李雪梅张月田志革胡晓亮
关键词:遗传变异规律遗传演化分析PCR方法
鸭甲型肝炎病毒3型信阳株的分离鉴定及遗传演化分析
2024年
为了解信阳地区鸭甲型肝炎病毒3型的遗传变异特性,对信阳市发生疑似肝炎的金定雏鸭进行9种常见病毒PCR/RT-PCR检测,同时采集病鸭肝脏组织无菌处理后,尿囊腔接种10日龄SPF鸭胚进行病毒分离,并对分离毒株进行全基因组和VP1基因序列分析。结果:成功分离到1株鸭甲型肝炎病毒3型(DHAV3),命名为HNXY23;接种病毒的鸭胚发育不良,死亡胚体全身呈出血水肿;序列比对和系统发育树表明,分离株HNXY23属于DHAV3 GⅠ基因型,与2022年分离株HB-1、HZ-1、HZ-2和HZ-3亲缘关系较近;利用DNAMAN软件比对31株DHAV3 VP1氨基酸位点变异情况,发现在184、187、195、206和209位这5个氨基酸位点有较为明显的变化差异。本研究结果丰富了信阳地区DHAV3的分子流行病学资料,为进一步研究DHAV3的致病机制奠定了基础。
焦凤超李鑫鑫李迎晓雷震董建国赵瑜何书海赵聘曲哲会黄立
关键词:VP1基因遗传进化分析
一株马冠状病毒的分离鉴定及遗传演化分析
2024年
马冠状病毒病是由马冠状病毒(equine coronavirus,ECoV)引起的一种马新发胃肠道病毒病,成年马感染后主要出现发烧、腹痛和腹泻等症状。1975年,马冠状病毒感染首次在美国出现,此后在多个国家和地区均有流行,此前我国仅从山东腹泻驴的小肠样品中分离得到了一株重组马冠状病毒。【目的】了解ECoV中国毒株的基因组成、亲缘关系以及生物学特性,可以为我国ECoV流行现状和遗传演化趋势提供依据,为ECoV防控产品的研发提供材料。【方法】对湖北省武汉市黄陂区腹泻马匹的粪便样品进行RT-PCR检测,对检测阳性样品进行病毒分离,并利用靶向ECoV S1蛋白的单克隆抗体通过间接免疫荧光试验(indirect immunofluorescence assay,IFA)对分离的病毒进行验证。根据ECoV-JL株全基因组测序结果,对全基因组、N基因和NS2基因进行了基因组系统发育分析和同源性比较。【结果】成功分离到一株ECoV,并命名为ECoV-JL。透射电镜(transmission electron microscopy,TEM)观察分离到的病毒颗粒呈球状,且具有囊膜和冠状病毒典型的纤突结构。该分离株感染HRT-18细胞72 h后病毒滴度可到达峰值,半数组织培养感染剂量(tissue culture infectious dose 50%,TCID50)约为106.16TCID50/mL。ECoV-JL毒株可以在人回盲肠癌(human ileocecal cancer-18,HRT-18)细胞、人结直肠腺癌(human colorectal adenocarcinoma-2,Caco-2)细胞和人肝癌(human liver cancer cells,Huh7)细胞上稳定传代。ECoV-JL株与GenBank中现有的ECoV全基因组序列相似性为97.9%-99.0%,系统发育分析发现ECoV-JL株属于单独的演化分支,与其他毒株的亲缘关系较远,说明ECoV-JL株可能是重组变异而来,其中NS2基因突变较多,NS2基因编码的差异是造成ECoV-JL株与其他毒株同源性较差的主要原因。【结论】本研究从腹泻马的粪便样品中成功分离并鉴定了一株ECoV,将其命名为ECoV-JL株,对该毒株生物学特性和亲缘关系的研�
景然张梦佳张梦迪朱文龙赵珊李文涛
关键词:遗传演化分析
河南省部分猪场猪嵴病毒检测及遗传演化分析
2024年
对河南地区猪群中猪峭病毒的分布情况进行分子流行病学调查,从河南省20个猪场中采集共35份腹泻仔猪小肠样品,采用RT-PCR方法对采集的样品进行PKV的检测。结果显示猪嵴病毒阳性检出率为48.57%(17/35),猪场感染率多达70%(14/20);将扩增出来的样品选取6株进行VP1基因测序、同源性对比和遗传进化分析,同源性对比结果表明,分离株的VP1基因核苷酸同源性在81.7%~100%,氨基酸同源性在88.2%~100%,遗传演化分析结果显示,6株分离株均位于已知的全部PKV株构成的4个分支中的Aichi virus C这一个大的分支上。
叶海潮李小康
关键词:RT-PCRVP1基因遗传演化分析
2003-2021年野鸟源H3亚型禽流感病毒监测与遗传演化分析
野生鸟类,特别是水禽,被视为禽流感病毒的自然宿主。H3亚型禽流感病毒作为广泛传播的流感病毒之一,感染野鸟后常表现低致病性,并不会引发严重的病症。然而,值得注意的是,H3亚型流感病毒不仅侵袭鸟类,还跨越物种界限,感染猪、狗...
赵振良
关键词:禽流感病毒H3亚型流行病学调查遗传演化分析
常见猪腹泻病毒四重荧光定量PCR方法的建立及其基因组遗传演化分析
猪病毒性腹泻疾病给全球养猪业造成了巨大的经济损失,尤其是仔猪死亡率可高达100%。其中猪流行性腹泻病毒(PEDV)、传染性胃肠炎病毒(TGEV)、猪德尔塔冠状病毒(PDCoV)及猪轮状病毒A型(PRVA)是与猪病毒性腹泻...
丰丙晖
关键词:猪流行性腹泻病毒猪轮状病毒遗传演化分析
新疆等边境四省区流行性乙型脑炎病毒分子流行病学监测及遗传演化分析
流行性乙型脑炎(epidemic encephalitis B)简称乙脑,是由日本乙型脑炎病毒(Japanese encephalitis virus,JEV)引起的人兽共患传染病,是一种可经带毒蚊叮咬传播的单股正链RN...
李冰
关键词:流行性乙型脑炎病毒病毒分离遗传演化分析
2023年中国部分地区猫主要病毒病的流行病学调查及猫白血病病毒的遗传演化分析
随着生活方式的不断转变,宠物猫逐渐融入了人类的日常,成为家庭的重要一员。猫需求量的增加直接带动了养殖业的快速扩张,而集约化养殖是实现目标的有效方式。但快速、高密度的养殖模式容易导致病毒病的高发,严重危害着养猫业的健康发展...
郭梦帅
关键词:流行病学调查猫白血病病毒遗传演化分析

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陈化兰
作品数:600被引量:1,624H指数:20
供职机构:中国农业科学院哈尔滨兽医研究所
研究主题:禽流感病毒 禽流感 猪流感病毒 流感病毒 DNA疫苗
邓国华
作品数:235被引量:738H指数:14
供职机构:中国农业科学院哈尔滨兽医研究所
研究主题:禽流感病毒 禽流感 感染性 H5亚型禽流感 鸭源
崔鹏飞
作品数:57被引量:106H指数:6
供职机构:中国农业科学院哈尔滨兽医研究所
研究主题:禽流感病毒 感染性 小鼠 全基因组序列分析 生物学特性
顾贵波
作品数:64被引量:400H指数:7
供职机构:辽宁省动物疫病预防控制中心
研究主题:大肠埃希菌 猪源 遗传演化分析 PCR 兽医实验室
葛菲菲
作品数:167被引量:311H指数:8
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研究主题:试剂盒 引物 禽流感病毒 伪狂犬病 H9N2亚型禽流感病毒