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应用脉冲凝胶电泳技术对两个家庭肠炎沙门菌食物中毒的溯源分析
2021年
对广西梧州市某县两个家庭食物中毒来源追踪分析,确定传染源。方法:将食物中毒中分离得到的10株沙门菌经生化和血清鉴定为肠炎沙门菌属后,再用脉冲凝胶电泳技术进行分子分型,运用Bionumerics 软件进行聚类分析比较其同源性。结果:10株肠炎沙门菌经聚类分析同源性为100%,其中2株来源于两个家庭吃剩的手撕鸡,8株来源于两个家庭成员的肛拭子,表明该起食物中毒是两个家庭成员吃了某一摊贩的手撕鸡引起的。结论:脉冲凝胶电泳技术适用于菌株的同源性分析和传染病传染源追踪分析。
林静梅盘珍梅蔡周梅冼桂江
关键词:食物中毒肠炎沙门氏菌脉冲场凝胶电泳
脉冲凝胶电泳技术对一起聚集事件病原学回顾性分析被引量:4
2019年
目的对一起多因素引起腹痛、腹泻聚集事件调查中采集的样本进行致病菌检验,利用脉冲凝胶电泳技术(PFGE)从分子水平对该起事件的病原学进行回顾性分析。方法依据相关标准对采集的样品进行病原菌分离、鉴定,选用SmaⅠ酶切事件中分离的可疑致病菌株,对菌株进行聚类分析。结果从44件可疑样品中检出蜡样芽胞杆菌(Bacillus cereus,Bc)17株,对可疑食品中分离的10株蜡样芽胞杆菌进行PFGE分子分型检测,其中7株为相同带型。结论 PFGE图谱佐证了Bc作为本次聚集事件病原的新证据,采集的食品并非被一个单克隆蜡样芽胞杆菌污染,而是存在多种Bc克隆,PFGE可有效应用于暴发事件溯源分析及分子流行病学研究。
王鹏马红梅李颖王新田张彦春张赫
关键词:蜡样芽胞杆菌回顾性分析
应用脉冲凝胶电泳技术对肠炎沙门菌食物中毒的溯源分析被引量:20
2018年
目的对2016年莆田市某区一起细菌性食物中毒事件进行致病菌分离鉴定和溯源分析。方法将采集到的样品和标本进行细菌分离培养、生化鉴定及血清学分型,应用脉冲凝胶电泳(PFGE)技术进行同源性分析,并对分离菌株进行毒力基因检测和药敏分析。结果共检出23株肠炎沙门菌,其中8株来源于留样食物,2株来源于厨师肛拭子,13株来源于患者肛拭子;所有菌株经BioNumerics软件聚类分析同源性为100%;所有菌株均携带沙门菌毒力基因invA,且具有相同的耐药谱。结论 PFGE技术有利于细菌性食物中毒的溯源分析。该起食物中毒事件是由携带肠炎沙门菌的厨师进行冷盘制作和水果拼盘过程中污染食物所引起。
阮韦伟张勐劼黄智瑜王凤美蔡洪庆余航
关键词:食物中毒肠炎沙门菌脉冲场凝胶电泳药敏试验
脉冲凝胶电泳技术在饲料中沙门菌检测中的应用被引量:1
2018年
通过对饲料中的沙门菌进行分离和鉴定、血清型分型和脉冲凝胶电泳分型,分析其存在和分布的情况,为分析饲料中沙门菌产生的原因,建立追踪溯源方法,并为其防治提供参考。按GB/T 13091进行分离、鉴定;参考GB 4789.4进行血清型分型;PFGE参照PulseNet的标准方法。分离、鉴定得到15株沙门菌,检出率为14.3%;血清型的出现频次依次为德尔卑、阿贡纳、里森等;PFGE结果显示,15株沙门菌相似度在38.8~100%之间,相同血清型的菌株聚类后,一般都能分到同一群,表明血清型与PFGE指纹图谱有一定相关性;随着同一批次检出沙门菌份数的增加,PFGE聚类结果越趋于集中,与血清型分析结果一致。沙门菌监测应设定科学的抽样份数;血清型和PFGE聚类结果的分布随着检出份数的增加差异越来越小,可能为风险爆发,PFGE可作为沙门菌风险溯源的方法;在一个血清型内,沙门菌既有较高的基因同源性,又具有遗传多态性。
高铎刘鸿鹤韩镌竹武凤娇李欣南
关键词:沙门菌饲料血清型PFGE
脉冲凝胶电泳技术及其在细菌感染性疾病中的应用被引量:20
2017年
为研究细菌的流行特征、追踪传染源,国内外广泛采用的方法是对相关菌株进行分型,分析菌株间的同源性关系。细菌分型方法分为表型分型和基因分型两种,表型分型主要有根据菌落形态和生化特征等的生物分型、抗菌药物药敏谱分型、血清分型、噬菌体分型,基因分型包括质粒分型、核糖体分型、染色体DNA限制性内切核酸酶图谱分析(REA)、限制片段长度多态性分析(RFLP)、脉冲凝胶电泳分型(pulsedfield gel electrophoresis,PFGE)、随机引物PCR(AP-PCR)、重复片段PCR分型、多位点序列分型(MLST)等,其中PFGE是分子分型技术的“金标准”,其结果重复性好,分辨率高,易于标准化,被国内外研究者广泛接受。本文就PFGE技术及其在细菌感染性疾病中的应用进行综述。
豆清娅吴安华
关键词:脉冲场凝胶电泳PFGE基因分型
脉冲凝胶电泳技术在一起食物中毒中的应用被引量:7
2016年
目的利用沙门菌分子分型技术,分析不同来源的菌株之间的遗传相关性,通过同源性分析追溯新疆某县一起食物中毒发生的原因。方法对样品进行培养获得3株疑似沙门菌。通过脉冲凝胶电泳(PFGE)技术对菌株进行鉴定及分子溯源。结果 5份患者粪便标本中有2份分离到菌株,3份食品样品中有1份分离到菌株。3株菌株初步生化鉴定结果为TSI(K/A)、产气、H2S:+;赖氨酸脱梭酶:+;血清学分型结果相同,均为O:9:12:+;H:g:m:+;H2相:-,鉴定为肠炎沙门菌。药敏检测结果显示对四环素等8种药物100%敏感,对萘啶酸100%耐药。PFGE分子分型及同源性分析,3株肠炎沙门菌的DNA图谱完全相同。结论 3株肠炎沙门菌株的DNA图谱100%同源,确认为一起由肠炎沙门菌污染了食品而引起的食物中毒。
马鑫于烽刘艳苏静远雪梅雒婉霞
关键词:食物中毒肠炎沙门菌耐药性脉冲场凝胶电泳
脉冲凝胶电泳技术在致病菌分型技术的应用被引量:7
2015年
脉冲凝胶电泳(pulse-field gelelectrophoresis,PFGE),又称脉冲式交变电电泳,该技术是将电泳方向交替性改变,并优化脉冲时间和其他条件,可以分辨凝胶中35~10 000 kb的DNA分子。该方法应用于分子流行病学中,通过观察电泳条带的差异,为确定菌株之间的亲缘关系提供了可靠的技术手段。该技术在致病菌溯源(细菌性传染性疾病溯源、细菌性食源性疾病溯源)、医院内感染流行监测等方面都有广泛的应用。
王宇
关键词:脉冲场凝胶电泳
多位点序列分型和脉冲凝胶电泳技术在肠炎沙门菌暴发事件病原学鉴定中的应用被引量:1
2015年
目的探讨脉冲凝胶电泳(pulse-field gel electrophoresis,PFGE)和多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)技术在沙门菌鉴定中的应用价值。方法对分离自一起食物中毒事件中的27株沙门菌,用肠杆菌科鉴定系统API 20E和ATB ID 32E进行生化鉴定并血清分型,以脉冲凝胶电泳(PFGE)和多位点序列分型(MLST)进行分子分型。结果 27株沙门菌的生化鉴定结果为沙门菌属细菌,其中25株血清分型结果为肠炎沙门菌,抗原模式(9,12:g,m);其余两株菌H相抗原除g和m因子凝集阳性外,d因子也有凝集反应。PFGE结果显示27株菌株中26株的带型完全一致,另1株与其他26株仅有1条条带的差异,相似度为96.3%。27株菌的MLST型别均为ST11型,提示为肠炎沙门菌。结论分子分型技术,特别是MLST技术有助于沙门菌的辅助鉴定。
郑伟汪皓秋张蔚俞骅文艳苹郑之北潘劲草
关键词:多位点序列分型
应用脉冲凝胶电泳技术制备鲫鱼全基因组DNA
2014年
为了研究用脉冲凝胶电泳技术制备高分子质量基因组DNA时的最佳条件,试验采用鲫鱼为材料,将肌肉组织研磨过滤获得细胞悬液,包被于低熔点琼脂糖包中,用蛋白酶K消化胶块后进行脉冲电泳。结果表明:采用1%琼脂糖凝胶电泳温度为14℃,电压为4V/cm,起始和终止脉冲时间为1-40s,脉冲角度为120°,冷凝泵流量为70L/h,电泳时间为18h,能获得1000.0kb的基因组DNA,满足基因组文库构建的需要。
吉尚雷张雅斌卢玉婷陈崇洲李月红
关键词:脉冲场凝胶电泳鲫鱼基因组DNA
脉冲凝胶电泳技术的应用及其发展趋势
2014年
基因分型方法即分子分型方法,是用现代分子生物学技术分析菌株间基因组的相似程度,进而弥补表型分型在分型能力、重复性及分辨力上的欠缺。脉冲凝胶电泳(PFGE)是一种重要的分子分型技术,其工作原理是:大小不同的 DNA 分子在交替变换方向的电中作出反应所需的时间不同,一般较小的分子重新定向较快,在凝胶中移动快,大的DNA分子比小的DNA分子定向慢,在凝胶中移动比较慢,根据各DNA分子迁移距离的不同,从而可以达到分离不同大小的 DNA 分子的目的。在所有分子分型方法中,脉冲凝胶电泳以重复性好、分辨性强,被作为细菌分子分型的“金标准”。现在PFGE已被广泛应用于菌株遗传关系比较、食源性和疫源性致病菌的溯源、疫情的传染源追踪以及临床诊断治疗、药学等各个方面。本文分别介绍了PFGE技术在细菌传播污染控制、耐药菌株溯源性、耐药菌株流行趋势分析中应用及其该技术有待解决的问题及发展趋势。
董栋商军钱晓璐
关键词:脉冲场凝胶电泳现代分子生物学DNA分子分型方法耐药菌株

相关作者

俞骅
作品数:63被引量:298H指数:10
供职机构:杭州市疾病预防控制中心
研究主题:脉冲场凝胶电泳 多位点序列分型 分子分型 甲型副伤寒沙门菌 单增李斯特菌
张蔚
作品数:73被引量:351H指数:10
供职机构:杭州市疾病预防控制中心
研究主题:脉冲场凝胶电泳 分子分型 副溶血弧菌 多位点序列分型 食物中毒
崔志刚
作品数:132被引量:968H指数:16
供职机构:中国疾病预防控制中心传染病预防控制所
研究主题:脉冲场凝胶电泳 分子分型 PFGE 小肠结肠炎耶尔森菌 脉冲场凝胶电泳分析
郑伟
作品数:149被引量:736H指数:14
供职机构:杭州市疾病预防控制中心
研究主题:脉冲场凝胶电泳 多位点序列分型 子宫内膜异位症 沙门菌 分子分型
汪皓秋
作品数:84被引量:288H指数:9
供职机构:杭州市疾病预防控制中心
研究主题:脉冲场凝胶电泳 多位点序列分型 毒力基因 甲型副伤寒沙门菌 志贺菌