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一种快速鉴别出血性杆菌O157菌株的无标记SERS检测方法
本发明属于微生物检测领域,具体涉及一种快速鉴别出血性杆菌O157:H7菌株的SERS检测方法,主要包括以下步骤:(1)采集大杆菌不同菌株、不同批次的SERS谱;(2)使用不同菌株SERS谱作为训练集和测试集,优化...
杨金梅
一株猪源出血性杆菌O157:H7的全基因组测序及毒力和耐药基因分析
2025年
[目的]分析一株猪源出血性杆菌O157:H7菌株EO157-1的全基因组信息及其毒力和耐药基因。[方法]基于Nanopore三代测序技术平台和Illumina二代测序技术平台对猪源出血性杆菌O157:H7菌株EO157-1进行全基因组测序,利用Prokka软件预测基因组序列信息,并通过UniProt、KEGG、KEGG Pathway、GO、Pfam、COG、TIGERfams、RefSeq和NR数据库进行基因预测和注释,再利用碳水化合物酶(CAZy)、病原与宿主互作(PHI)、毒力因子(VFDB)和耐药基因(CARD)数据库进行基因功能分析。[结果]出血性杆菌O157:H7菌株EO157-1基因组大小为5404747 bp,GC含量为50.49%,该菌株含有3个质粒;共预测到5674个蛋白质编码基因,包含22个rRNA(7个23S rRNA、7个16S rRNA、8个5S rRNA)、1个tmRNA、102个tRNA基因和282个小RNA分子;预测出9个CRISPR序列、273个重复序列;KEGG、KEGG Pathway、NR、UniProt、GO、COG、Pfam、RefSeq和TIGERfams数据库分别注释到1712、1693、5265、5264、4029、4294、4688、5252和2741个基因;CAZy数据库注释筛选出100个基因,PHI数据库注释筛选出2354个基因,VFDB数据库注释筛选出的毒力基因主要包括菌毛、鞭毛、Ⅱ型分泌系统、Ⅲ型分泌系统、Ⅵ型分泌系统、紧密黏附素、铁转运系统、脂多糖、荚膜、侵袭素和外毒素;CARD数据库注释筛选出的耐药基因与多重耐药外排泵、大环内酯类抗生素、四环素、多粘菌素、杆菌肽、氨基糖苷类抗生素、肽类抗生素及甲硝唑相关。[结论]获得一株出血性杆菌O157:H7菌株EO157-1全基因组序列,序列分析表明该菌株携带大量毒力基因与耐药基因。
周艳万启旸朱树娇张辉包红朵王冉
关键词:全基因组测序基因功能注释
出血性杆菌疫苗的开发和展望
2024年
[背景]出血性杆菌(enterohemorrhagic Escherichia coli,EHEC)感染是世界范围内重要的公共卫生问题之一,目前还未有针对EHEC的有效预防控制手段.安全有效的疫苗可以提供对EHEC感染的免疫保护.[进展]本文主要介绍EHEC相关疫苗的研发进展及可用于评估各种免疫策略的动物模型.EHEC疫苗开发策略主要针对志贺毒素及黏附相关毒力因子,通过特异性抗原激活机体免疫达到预防控制效果.进而讨论EHEC外膜囊泡(outer membrane vesicles,OMVs)疫苗的制备方式及其作为多抗原疫苗平台的应用潜力.[展望]对EHEC抗原的筛选以及OMVs疫苗平台的设计,将有助于人们更充分掌握EHEC感染与免疫的分子机制,开发出针对更多血清型的EHEC疫苗.
王岱汤岩松李云鹤欧阳谭亮
关键词:肠出血性大肠杆菌志贺毒素
植物天然产物抗出血性埃希菌的研究进展
2024年
出血性埃希菌(enterohemorrhagic Escherichia coli,EHEC)作为人畜共患致病菌,暴发性感染可诱发严重的全身性溶血性尿毒症综合征(hemolytic uremic syndrome,HUS)。然而传统的抗生素治疗不仅导致耐药性的产生,还会促进志贺毒素(Shiga toxin,Stx)的释放,从而加重病情。因此亟需开发新型抗EHEC感染药物。植物天然产物因其结构和功能的多样性,在抑制细菌生长和抗毒力方面显示出巨大的潜力,成为研发新型抗EHEC感染药物的重要资源库。本文通过介绍植物天然产物,在此基础上对抑制EHEC生长和毒力因子的植物天然产物分别进行总结,为寻找预防和治疗EHEC感染提供思路和依据。
钟樱方芳朱靓薛云新王岱
关键词:肠出血性大肠埃希菌
一种出血性杆菌Tir蛋白多克隆抗体及其制备方法和应用
本发明公开一种出血性杆菌Tir蛋白多克隆抗体及其制备方法和应用,属于生物技术领域。本发明将如SEQ ID NO.3所示的编码Tir蛋白的目的基因片段重组于pET‑32a(+)载体的Nde I酶切位点和BamH I酶...
杨斌康晨博孙洪敏陈净楠刘郁涛庞羽
没食子酸对出血性杆菌O157:H7生物膜群体感应调控机制
张承慧
基于迭代进化的出血性杆菌噬菌体鸡尾酒的抗菌效果评价
2024年
分离到一株抗菌能力较差的新型噬菌体vB_EcoM_CRP22,通过模拟噬菌体与细菌在自然环境中的相互作用,开发了迭代适应性进化的方法使噬菌体感染噬菌体抗性突变菌株,显著提高了噬菌体对出血性杆菌(EHEC)的抗菌效果,由噬菌体进化株组合成的鸡尾酒制剂感染细菌后36 h内能有效控制OD_(600)低于0.4。该实验为噬菌体疗法的发展提供了新思路。
丁子韩谢宇桢曹晨昕陈泉刘慧徐蓁禾王壮王启要刘琴
关键词:肠出血性大肠杆菌适应性进化
出血性埃希菌O157:H7毒力岛及毒力因子的研究进展
2024年
出血性埃希菌(Entero-hemohaggic E.coli,EHEC)可引起人类和动物的严重传染病。EHEC包括编码细胞脱落位点致病岛或与其相关的基因,通过比较基因组分析显示,EHEC O157:H7菌株包含177个基因组岛称为O岛(OIs),包含1387个基因,编码新型的毒力因子逐渐被发现,揭示了该菌的致病新机制,成为新型疫苗研究热点,本文综述了O岛编码毒力因子新进展。
冯新源王文婷(综述)李明成(审校)
关键词:肠出血性大肠杆菌EHECO157:H7
具有特异性杀伤出血性杆菌的工程λ噬菌体及其构建方法和应用
本发明公开了一种具有特异性杀伤出血性杆菌的工程λ噬菌体及其构建方法和应用,其是一种可以在复杂微生物环境中特异性清除出血性杆菌的工程λ噬菌体,该工程λ噬菌体的裂解酶基因被敲除并搭载CRISPR‑Cas3系统,利...
金梦露陈卫华王海磊
2014—2022年北京市道门诊分离的出血性埃希菌分子分型特征分析
2024年
目的 了解北京市出血性埃希菌(enterohemorrhagic Escherichia coli,EHEC)分子特征及流行趋势。方法 收集2014—2022年北京市道门诊分离到的出血性埃希菌,通过药敏试验及全基因组测序及数据分析,以了解病原的药物敏感性及分子特征。结果 共收集到14株EHEC,其中4株为多耐药菌株;多位点序列分型(multi-locus sequence type, MLST)分析ST11型占比最高(5/14);血清分型O157:H7占比最高(6/14);全基因组单核苷酸分型(whole genome single nucleotide polymorphism, wgSNP)结果显示6株O157:H7菌株分成一簇,其他菌株分成一簇;14株北京分离到的EHEC和美国国家生物技术信息中心(NCBI)网站下载的678株中国及周边国家分离的大埃希菌全基因组数据wgSNP分型,没有形成明显的地域性聚集,均以散发分布为主。结论 EHEC仍是北京市道传染病重要的病原菌,需要进一步加强EHEC监测。
张新吕冰田祎黄瑛霍达林长缨曲梅贾蕾张代涛王全意
关键词:肠出血性大肠埃希菌全基因组测序多位点序列分型

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毛旭虎
作品数:248被引量:682H指数:13
供职机构:第三军医大学
研究主题:幽门螺杆菌 类鼻疽伯克霍尔德菌 肠出血性大肠杆菌O157:H7 肠出血性大肠杆菌 大肠杆菌
邹全明
作品数:649被引量:1,843H指数:18
供职机构:第三军医大学
研究主题:幽门螺杆菌 疫苗 大肠杆菌 幽门螺杆菌感染 表位
徐建国
作品数:383被引量:2,273H指数:25
供职机构:中国疾病预防控制中心
研究主题:大肠杆菌 菌株 益生菌 H7 血清型
刘军
作品数:499被引量:1,185H指数:16
供职机构:吉林大学
研究主题:猪链球菌2型 关节成形术 骨性关节炎 RA 大肠杆菌
王庆旭
作品数:53被引量:127H指数:6
供职机构:成都军区总医院
研究主题:肠出血性大肠杆菌O157:H7 分泌蛋白 肠出血性大肠杆菌 EHEC 融合蛋白