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- 一个大豆非受体酪氨酸激酶结合蛋白基因GmABIL2及其应用
- 本发明公开了一个大豆非受体酪氨酸激酶结合蛋白基因GmABIL2及其应用,涉及基因工程技术领域。本发明以300栽培大豆为实验材料,分别进行萌发期及苗期耐盐碱表型精准鉴定,结合全基因组关联分析方法挖掘并鉴定到大豆萌发期及苗期...
- 高红桃李海燕吴菲菲周永刚李雅忻许克恒张引鹤
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- 抑制高密度脂蛋白结合蛋白基因表达的siRNA、其缀合物和药物组合物及用途
- 本发明涉及抑制HDLBP基因表达的siRNA、siRNA缀合物、包含其的药物组合物、及其用途。所述siRNA中的每个核苷酸各自独立地为修饰或未修饰的核苷酸,该siRNA含有正义链和反义链。所述siRNA及其缀合物和药物组...
- 王书成王岩黄河汪小君牛丽姣林国良产运霞耿玉先
- 桉树枝瘿姬小蜂气味结合蛋白基因OBPs的克隆及表达分析
- 2025年
- 为明确桉树枝瘿姬小蜂Leptocybe invasa的嗅觉感受机制,本研究利用克隆技术从桉树枝瘿姬小蜂中成功克隆7个LinvOBPs基因:LinvOBP2、LinvOBP5、LinvOBP7、LinvOBP9、LinvOBP11、LinvOBP18、LinvOBP23。利用生物信息学软件分析7个基因序列编码蛋白的理化特性和结构特征;构建进化树分析桉树枝瘿姬小蜂OBPs及其它昆虫OBPs的进化关系;通过实时荧光定量PCR技术分析在不同挥发物处理下OBPs基因表达情况。结果表明,7个LinvOBPs基因长度约400 bp,含有6个保守的半胱氨酸,序列N端具有信号肽切割位点,在二级结构预测中均含有大量的α-螺旋结构,有利于疏水结合腔的形成,能够促进其与气味分子的结合。桉树枝瘿姬小蜂的LinvOBPs与白蛾周氏啮小蜂Chouioia cunea的CcOBPs聚在同一分支,亲缘性很高,推测二者可能具有相似的功能。不同LinvOBPs对于不同挥发物的响应存在显著差异,特定挥发物对LinvOBPs表达的调控作用,尤其是对伞花烃、桉叶油醇、右旋萜二烯能够上调多个LinvOBPs的表达量。7个LinvOBPs基因均在识别寄主桉树过程中发挥重要作用,其中,LinvOBPs对对伞花烃、桉叶油醇、右旋萜二烯的识别有利于揭示桉树枝瘿姬小蜂特异性识别寄主桉树的分子机制。
- 谢金婷李俊珏周乐明刘雅宾贵辉杨振德周静
- 关键词:桉树枝瘿姬小蜂气味结合蛋白植物挥发物基因克隆寄主识别
- 黄芪种子小蜂气味结合蛋白基因的鉴定及表达分析
- 2025年
- 气味结合蛋白(odorant-binding proteins,OBPs)在黄芪种子小蜂Bruchophagus huonchili Liao et Fan识别并为害中药材黄芪种子的过程中发挥着重要作用。为探明黄芪种子小蜂的嗅觉识别机理,本研究建立了黄芪种子小蜂成虫触角转录组数据库,挖掘和鉴定嗅觉识别相关的气味结合蛋白基因。采用Illumina HiSeq平台对黄芪种子小蜂成虫触角转录组进行分析,在COG、GO、KEGG、KOG、Pfam、Swissprot、TrEMBL、eggNOG、Nr等公共数据库进行基因功能注释,根据注释信息筛选黄芪种子小蜂OBP基因;利用DNAMAN和MEGA 11.0软件分析OBP基因结构特点及进化关系;通过RT-qPCR技术检测黄芪种子小蜂雌、雄成虫触角中OBP基因的表达量及被不同挥发物诱导后的表达量。结果显示,从黄芪种子小蜂成虫触角转录组中共获得98655条unigenes,其中54670条unigenes在公共数据库被注释到,从注释结果中筛选到25个BhuoOBPs,序列比对结果显示,除BhuoOBP14、BhuoOBP19外,其余23个BhuoOBPs均包含6个保守的半胱氨酸残基,属于classic OBPs。系统进化树分析表明,大部分BhuoOBPs与丽蝇蛹集金小蜂Nasonia vitripennis、白蛾周氏啮小蜂Chouioia cunea、丽蚜小蜂Encarsia formosa、松毛虫赤眼蜂Trichogramma dendrolimi等小蜂总科昆虫的OBPs氨基酸序列聚到一起,表明它们之间亲缘关系较近。RT-qPCR结果显示,在10μg/μL的引诱剂罗勒烯诱导下,雌虫触角中BhuoOBP18和雄虫触角中BhuoOBP21表达上调最显著,分别为对照的147.4倍和615.6倍;在100μg/μL的驱避剂4-萜烯醇诱导下,雌虫触角中BhuoOBP22和雄虫触角中BhuoOBP10上调最显著,分别为对照的742.4倍和1684.4倍。本研究建立了黄芪种子小蜂成虫触角转录组数据库,鉴定并分析了BhuoOBPs基因在不同挥发物诱导下触角中的表达量,为进一步研究黄芪种子小蜂嗅觉识别机制提供了理论基础。
- 康婕薛赵卓师文丽郑海霞牛颜冰张仙红
- 关键词:转录组测序气味结合蛋白触角RT-QPCR
- 一个调控梨果实木质素合成的胞间连丝胼胝质结合蛋白基因
- 本发明公开了一个调控梨果实木质素合成的胞间连丝胼胝质结合蛋白基因PbPDCB16,该基因CDS序列为SEQ ID NO.1所示。将该基因构建超表达载体注入‘砀山酥梨’果实中,较未注射部分和注射空载对照GFP,木质素含量降...
- 陶书田李文袁凯莉娄婧婧任梅张绍铃谢智华齐开杰
- 钙周期素结合蛋白基因StCacyBP/SIP增强马铃薯抗旱性的用途及应用
- 本发明公开了钙周期素结合蛋白基因StCacyBP/SIP增强马铃薯抗旱性的用途及应用。其中,所述钙周期素结合蛋白基因StCacyBP/SIP的CDS序列如SEQ ID No.1所示,编码蛋白的氨基酸序列如SEQ ID N...
- 荐红举贾利君吕典秋尚丽娜周永洪胡柏耿李燕
- 大麦钙调蛋白结合蛋白基因HvCBP60b及其在调控大麦抗盐性中的应用
- 本发明公开了一种大麦钙调蛋白结合蛋白基因HvCBP60b及其在调控大麦抗盐性中的应用。该基因的核苷酸序列为SEQ ID NO.1所示。本发明首次克隆和分析了大麦中响应盐胁迫的钙调蛋白结合蛋白基因HvCBP60b,公布了该...
- 沈秋芳徐云峰傅良波张国平
- 溶质结合蛋白基因AgSBP6在促进蜜环菌生长中的应用
- 本发明公开了一种溶质结合蛋白基因AgSBP6,其来源于高卢蜜环菌,所述溶质结合蛋白基因AgSBP6的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示;本发明构建了AgSBP6基因抑制表达载体和AgSBP6基因过表达载体,并转化到高...
- 李昆志 李文超 胥鹏 赵星 周泽仪 黄元冲年洪娟
- 冠状动脉粥样硬化患者单个核细胞关键RNA结合蛋白基因的筛选及验证
- 2024年
- 目的筛选冠状动脉粥样硬化患者外周血单个核细胞关键RNA结合蛋白基因,并对其进行验证。方法①冠状动脉粥样硬化患者单个核细胞关键RNA结合蛋白基因筛选选择冠状动脉粥样硬化患者5例(观察组)、健康志愿者5例(对照组),采用转录组测序技术检测外周血单个核细胞RNA转录组,运用R软件“edgeR”包筛选P<0.05、|logFC|>1、错误发现率<0.05的单个核细胞差异表达基因。从RNA结合蛋白数据库中下载人单个核细胞的RNA结合蛋白相关基因资料,与外周血单个核细胞差异表达基因取交集后获得冠状动脉粥样硬化单个核细胞RNA结合蛋白相关差异表达基因。运用TopHat2、ABLas软件筛选冠状动脉粥样硬化患者单个核细胞差异表达RNA结合蛋白相关基因的可变剪接事件。筛选相对表达量最高的单个核细胞RNA结合蛋白相关差异表达基因为关键RNA结合蛋白基因。②冠状动脉粥样硬化患者单个核细胞关键RNA结合蛋白基因验证另选取冠状动脉粥样硬化患者10例(一组)、健康志愿者10例(二组),抽取外周静脉血后分离外周血单个核细胞,采用qRT-PCR法检测2组RNA结合蛋白关键基因。从GEO数据库(GSE40231、GSE43292、GSE100927、GSE27034)数据集中,检索冠状动脉粥样硬化患者、健康志愿者外周血单个核细胞RNA结合蛋白关键基因表达资料。结果冠状动脉粥样硬化患者单个核细胞的差异RNA结合蛋白相关基因有:过氧化物酶体增殖物激活受体γ共激活因子1α、锌指RNA结合蛋白2、SAM域、SH3域和核定位信号1(SAMSN1)、肝配蛋白A型受体2、RNA结合基序蛋白24、多种剪接形式的RNA结合蛋白2、SH3和多个锚蛋白重复结构域1。与对照组相比,观察组患者单个核细胞RNA结合蛋白相关基因的可变剪接事件多(P<0.05)。关键RNA结合蛋白基因为SAMSN1。与二组相比,一组患者外周血单个核细胞SAMSN1相对表达量升高(P<0.05)。GEO数据库数据�
- 多力昆·木台力甫阿布都乃比·麦麦提艾力伊加提·司马义
- 关键词:RNA结合蛋白可变剪接
相关作者
- 成军

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- 王琳

- 作品数:1,109被引量:5,098H指数:31
- 供职机构:郑州大学第一附属医院
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- 魏星

- 作品数:54被引量:0H指数:0
- 供职机构:暨南大学
- 研究主题:结合蛋白 氨基酸序列 免疫原性 EGFR 工程化
- 张锦前

- 作品数:78被引量:223H指数:9
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- 刘敏

- 作品数:224被引量:889H指数:15
- 供职机构:首都医科大学附属北京朝阳医院
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