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一种干细胞实验数据分析方法及系统
本发明涉及细胞数据处理与分析技术领域,尤其涉及一种干细胞实验数据分析方法及系统。所述方法包括以下步骤:获取干细胞原始实验数据集;对干细胞原始实验数据集进行标准化处理,得到干细胞实验数据;对干细胞实验数据进行多维特征识别,...
曹仕文王廷丽
基于网络药理学和细胞实验探究姜黄素治疗非小细胞肺癌的机制
2025年
目的利用网络药理学、分子对接技术探究姜黄素在非小细胞肺癌治疗中的潜在作用机制,并进行体外实验验证。方法利用PubChem和Swiss Target Prediction数据库筛选姜黄素的药物靶点;在GeneCards数据库中获得非小细胞肺癌的疾病靶点。利用韦恩在线分析软件获得药物和疾病的交集基因,通过STRING网站和Cytoscape软件将交集基因进行蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI)分析,根据节点的度值筛选核心靶点。运用DAVID数据库对潜在作用靶点进行了基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。通过AutoDock等软件将姜黄素和核心靶点进行分子对接,并通过Pymol软件对结果进行可视化分析。体外培养非小细胞肺癌A549细胞,将不同浓度(0、20、40μmol·L^(-1))的姜黄素作用于A549细胞,通过MTT实验、克隆形成实验、划痕、Transwell实验和DAPI染色实验检测姜黄素对非小细胞肺癌A549细胞增殖、迁移和凋亡的影响,通过Western blotting法检测姜黄素对核心靶点丝氨酸和苏氨酸激酶1(AKT1)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)、热休克蛋白(HSP90AA1)、非受体酪氨酸蛋白激酶(SRC)、信号传导及转录激活蛋白3(STAT3)以及酪氨酸蛋白激酶/STAT3(JAK/STAT3)信号通路相关蛋白表达水平的影响。结果基于网络药理学,筛选获得姜黄素治疗非小细胞肺癌的潜在作用靶点159个。按照节点的度值筛选出前5位的核心靶点为:AKT1、MAPK1、Hsp90AA1、SRC和STAT3。GO富集结果显示,姜黄素治疗非小细胞肺癌涉及多个生物过程,如信号转导、启动子转录、蛋白质磷酸化、JAKSTAT级联反应信号转导途径和细胞凋亡。并通过KEGG富集筛出多个信号通路,如癌症信号通路、趋化因子信号通路、催乳素信号通路、AGE-RAGE信号通路和JAK-STAT信号通路等。分子对接显示:姜黄素与核心靶点AKT1、Hsp90AA1、SRC和STAT3的结合能均小于-20.9 kJ·mol^(-1),说明姜黄�
刘玉玲高俊萍李宏斌
关键词:网络药理学姜黄素非小细胞肺癌分子对接
一种细胞实验用恒温膜片钳细胞观测记录系统
本发明公开了一种细胞实验用恒温膜片钳细胞观测记录系统,涉及细胞观测技术领域,包括:显微镜;恒温浴槽,其放置于所述显微镜上,用于提供恒温环境;细胞浴槽,其放置于所述恒温浴槽的中部,用于承载待检测的细胞;微电极控制仪,其设置...
李展林红军王欣齐乃松张婷婷
一种细胞实验可视化细胞培养容器及装置
本发明提供一种细胞实验可视化细胞培养容器及装置,涉及细胞培养领域。该细胞实验可视化细胞培养装置,包括观察装置、培养装置、密封装置和若干容器主体,所述培养装置设置在观察装置的顶端,所述密封装置设置在培养装置的顶端,若干所述...
郭英惠刘文哲王永琴高鹏远孔宇涵谢合日扎提·吐尔洪艾克代·麦麦提
槲皮素治疗非小细胞肺癌的网络药理学分析及细胞实验验证
2025年
目的:探究槲皮素治疗非小细胞肺癌(NSCLC)的潜在机制,并结合分子生物学实验验证。方法:通过SwisTargetPrediction和DrugBank数据库筛选槲皮素的靶点,通过GeneCards、TTD数据库收集NSCLC的疾病靶点,进行靶点映射获得槲皮素治疗NSCLC的靶点,应用STRING数据库获取蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络并进行分析,使用Cytoscape 3.7.2进行可视化;利用DAVID数据库进行靶点富集,进行基因本体论分析(GO)和京都基因与基因组百科全书分析(KEGG)。采用分子对接对核心靶点进行验证,并使用PLIP平台分析结合位点力学数据。通过细胞实验评估槲皮素对A549细胞增殖的影响,并利用qRT-PCR和Western blot对核心靶点进行验证。结果:网络药理学研究显示,槲皮素能够调控126个靶点,潜在治疗NSCLC的靶点有49个,核心通路为PI3K-Akt信号通路,核心靶点为PI3K、Akt、GSK-3β。分子对接实验初步发现,槲皮素与3个核心靶点均能产生强烈结合力。细胞实验结果显示,槲皮素低、中、高剂量组干预72 h后均能够显著抑制A549细胞的增殖活力(P<0.01),并下调PI3K、Akt、GSK-3β的mRNA表达水平(P<0.05)以及蛋白表达趋势。结论:本研究分析预测了槲皮素治疗NSCLC的潜在活性机制,通过实验验证发现槲皮素可能通过抑制PI3K/Akt/GSK-3β信号通路发挥抗癌作用。
王翊蒲晓芳
关键词:槲皮素非小细胞肺癌网络药理学分子对接
一种用于细胞实验的微流控装置及方法
本发明公开用于细胞实验的微流控装置及方法,装置包括封装层、液流层和培养层,培养层上设有多组培养槽;液流层的底面设有多组注液凹槽,注液凹槽设置于培养槽的上方,且注液凹槽和培养槽连通,注液凹槽的两端垂直设有多组中层加样孔和中...
王红阳陈磊王溢贤党源胡继
一种用于肿瘤细胞实验培养装置
本发明公开了一种用于肿瘤细胞实验培养装置,属于细胞培养技术领域,该用于肿瘤细胞实验培养装置,包括支撑块,多个所述支撑块顶部之间固定连接有培养箱,所述培养箱内部安装有第一调节组件和第二调节组件,所述培养箱内壁顶部安装有湿度...
王利利李嘉妍范璟王华利
一种用于细胞实验细胞提取装置
一种用于细胞实验细胞提取装置,包括箱体,箱体的一侧外壁上安装有第一电机,第一电机的输出轴端延伸至箱体内并固定连接有主动粉碎辊,主动粉碎辊的另一端与箱体的另一侧内壁转动连接,箱体的两侧内壁之间还转动连接有从动粉碎辊,主动...
葛洪涛吴浩查宇婷王志鹏陈忻羽高慧元叶海峰周锐
一种低压低氧生物细胞实验装置
本发明公开了一种低压低氧生物细胞实验装置,包括:培养箱、抽真空设备、气体控制设备、气压联动腔体;气压联动腔体的一侧开口且与气压管道连通;气压联动腔体内同轴设有活动盘,活动盘的环侧通过气密膜与气压联动腔体的内壁密封连接,活...
王楠高伟陈晞刘沙王强刘力吕晓燕王乐怡
基于细胞实验及网络药理学分析桂枝改善非小细胞肺癌耐药的分子机制
2025年
目的研究中药桂枝对非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)耐药细胞株H1650增殖、转移、凋亡的影响,揭示桂枝改善H1650吉非替尼耐药性的功能及潜在分子机制。方法在H1650中,使用桂枝、吉非替尼单药以及桂枝与吉非替尼联合用药,利用MTT法、细胞划痕法、流式细胞术分别检测H1650细胞的增殖、迁移、凋亡情况。随后,利用网络药理学预测桂枝的有效活性成分及其影响NSCLC细胞功能的可能分子靶点,构建“桂枝-活性成分-靶点-疾病”的关系网络,并对桂枝潜在作用分子靶点进行GO功能分析和KEGG信号通路富集分析,预测与桂枝活性成分密切相关的核心分子及信号通路。最后,利用Western blotting检测预测得到的核心分子蛋白质表达及蛋白质磷酸化修饰水平在桂枝、吉非替尼作用后的变化情况。结果桂枝单药可抑制H1650细胞增殖、迁移,促进细胞凋亡;与吉非替尼单药组相比,桂枝联合吉非替尼可降低吉非替尼抑制H1650细胞增殖的IC_(50)。网络药理学预测得到7个桂枝活性成分、252个NSCLC疾病相关分子靶点及多条与肿瘤发生发展密切相关的信号通路。其中,Src、PI3K、MAPK1及其相关信号通路可能是桂枝影响NCSLC细胞功能及耐药性的核心分子靶点。分子水平上,桂枝降低了H1650细胞Src蛋白质表达水平以及Src信号通路下游分子——Akt和mTOR的磷酸化水平。结论桂枝可通过抑制Src/Akt/mTOR信号通路,改善H1650细胞对吉非替尼的耐药现象。
徐佳禛吴加元王涛张慧姜宁华
关键词:桂枝SRC

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王振中
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