搜索到680篇“ 甲基化敏感扩增多态性“的相关文章
- 草间钻头蛛DNA甲基化敏感扩增多态性分析及内共生菌Wolbachia对其DNA甲基化影响研究
- DNA甲基化是一种重要的真核生物表观遗传学修饰方式,被认为是基因型与表型之间的环境响应中介,在生物体基因表达调控和维持基因组稳定性上发挥着重要作用。目前,节肢动物表观遗传学研究水平远落后于脊椎动物和高等植物,蜘蛛基因组D...
- 黄璇
- 关键词:WOLBACHIA草间钻头蛛DNMT1DNA甲基化
- 小麦与黑麦远缘杂交后代DNA甲基化敏感扩增多态性分析被引量:2
- 2018年
- 本研究以小麦(Triticum aestivum L.)品种My15与中国栽培黑麦-白粒黑麦(S.cereale L.cv)自交系Rw远缘杂交,经染色体加倍、两次回交5~7次自交产生的异染色体系07-903-6(BC2F5)、08-903-6(BC2F6)、09-903-6(BC2F7)和一对抗、感分离的姊妹系11-903-6-1(BC2F9)与11-903-6-2(BC2F9)为研究材料,双亲作为对照材料进行基因组DNA甲基化敏感扩增多态性分析。结果表明,黑麦染色质导入小麦背景后会导致基因组DNA甲基化水平改变,形成异染色体系的半甲基化水平极显著高于双亲本的半甲基化水平。在回交自交5~9世代间甲基化模式趋于稳定遗传,世代间DNA甲基化多态率均无显著差异。姊妹系间抗、感白粉病特征的差异可能与基因组半甲基化修饰有关,与全甲基化修饰无关。本研究对黑麦种质导入小麦后,形成姊妹系间抗、感白粉病分离的原因进行了讨论。
- 朱朝阳李桐高玉张怀渝
- 关键词:小麦黑麦远缘杂交DNA甲基化MSAP
- 黄芪甲基化敏感扩增多态性(MSAP)扩增引物筛选及初步应用
- 2017年
- [目的]建立并优化黄芪甲基化敏感扩增多态性(MSAP)技术扩增反应体系,对中药材黄芪甲基化水平进行研究。[方法]磁珠法提取黄芪DNA后,采用Hpa II/Msp I 2种内切酶进行酶切,将酶切产物加上连接接头序列,经预扩增和选择性扩增反应,最终从黄芪MSAP的256对引物中筛选出最佳分辨引物4对。应用筛选到的4对引物,分析12种不同产地黄芪的甲基化模式,并对甲基化水平聚类分析。[结果]经MSAP检测12个黄芪样本半甲基化率在12.5%~26.7%,全甲基化率在25.6%~51.1%,总甲基化率在48.7%~73.5%,总体上黄芪样本的全甲基化率大于半甲基化率。采用NTSYSpc软件对黄芪样品Hpa II和Msp I多态性数据进行分析,获得UPGMA聚类图和主成分分析PCA图。[结论]MSAP技术能够很好地用于黄芪的甲基化分析,结合NTSYSpc软件能对不同产地黄芪之间甲基化水平进行聚类分析,且初步分析结果表明从UPGMA和PCA图上来看,地区相近的单株聚类分析表现出了一定的地域性。
- 宗凯赵营莉周莉质李秀秀宫鹏夏泉
- 关键词:甲基化敏感扩增多态性聚类分析
- 蝴蝶兰花瓣变异基因组DNA甲基化敏感扩增多态性(MSAP)分析
- 研究不同蝴蝶兰花瓣突变基因组DNA甲基化水平变化情况,探索在花瓣不同突变过程中DNA甲基化的作用。实验结果表明,淡色突变体基因组CCGG位点发生甲基化的方式主要是以双链全甲基化(CmCGG)为主,而裂纹和花边突变体因组C...
- 吴超齐振宇郭方其
- 关键词:花色DNA甲基化
- 利用甲基化敏感扩增多态性技术筛选白棉子叶衰老相关基因的方法
- 本发明公开了一种利用甲基化敏感扩增多态性(MSAP)技术筛选白棉子叶衰老相关基因的方法。其步骤如下:待棉花幼苗长至10 d左右,两片子叶完全展开后,选取长势一致的幼苗,分别用300、500和700 mg·L‑1的乙烯利涂...
- 郭宁席晓广林毅蔡永平樊洪泓孙旭
- 绿色棉纤维发育过程中DNA表观遗传变化的甲基化敏感扩增多态性分析被引量:1
- 2017年
- 【目的】分析绿色棉纤维发育过程中DNA甲基化状态差异。【方法】利用2组限制性内切酶Eco RⅠ/HpaⅡ和Eco RⅠ/MspⅠ对绿絮棉1号纤维基因组甲基化位点进行识别和切割,并采用甲基化敏感扩增多态性引物对切割产物进行扩增,分析基因组内5'-CCGG-3'位点的甲基化状态;同时对扩增的差异片段进行测序,分析其生物学功能。【结果】66对甲基化敏感扩增多态性引物共扩增出4112个条带;平均每个样品共扩增出822.4个带型,平均每对引物扩增出12.46个片段。随着绿色棉纤维的发育,甲基化条带总数、甲基化条带比率、全甲基化条带百分比均逐渐升高;其中,开花后10、15、20和25 d时甲基化条带总数分别比开花后5 d时增加11.45%,13.86%,20.10%和33.13%。与开花后5 d相比,开花后10、15、20和25 d时纤维DNA发生甲基化变化位点的比例分别为3.15%,3.43%,3.65%和2.52%;而去甲基化位点的比例分别为12.87%,14.72%,13.31%和48.81%。通过测序和Blast分析表明,17个片段与已知的功能基因同源性较高,包括棉花线粒体基因组、丝氨酸蛋白酶基因和酯酶基因,且这些基因均在开花后25 d发生去甲基化。【结论】绿色棉纤维发育过程中DNA发生了甲基化与去甲基化现象。
- 钱森和洪亮魏明林毅蔡永萍
- 关键词:绿色棉纤维发育表观遗传
- 桃甲基化敏感扩增多态性(MSAP)技术体系的建立
- 2016年
- 为建立适合桃的甲基化敏感扩增多态性(methylation sensitive amplification polymorphism,简称MSAP)反应体系,以桃PCM-1R、PCM-1G为材料,对MSAP技术中的关键因素进行优化。结果表明,500 ng基因组DNA用EcoRⅠ、HapⅡ或MspⅠ各10 U(0.5μL,2 000 U/m L),37℃保温12 h,即可酶切完全;25μL选择性扩增体系中,含有2μL10倍稀释的预扩增产物、各1μL上下游引物、2.5μL 10×Taq buffer、2.5μL d NTP mix(各0.2 mmol/L)、2.5μL25 mmol/L MgCl_2、0.25μL Taq DNA聚合酶。在该体系下选用256对引物对桃叶片进行甲基化模式分析,经筛选获得23对扩增条带清晰、重复性好的引物,PCM-1R、PCM-1G总甲基化率分别为28.0%、25.7%。
- 蔡志翔沈志军严娟马瑞娟俞明亮
- 关键词:DNA甲基化MSAP
- 甲基化敏感扩增多态性技术(MSAP)在生态学中的应用被引量:6
- 2016年
- DNA甲基化是生物体内最为重要的表观遗传修饰形式之一,在生态学上的应用越来越广泛。在收集、整理生态表观遗传学相关文献的基础上,介绍了甲基化敏感扩增多态性技术(MSAP)的原理、优势与局限性及其在生态学上的应用和展望。MSAP因其应用广泛、操作简便等优点成为研究DNA甲基化水平的有力工具,特别是在探究生物体如何快速适应生境变化以及外来入侵生物如何突破遗传瓶颈等问题上。MSAP技术能够很好地揭示生物种群内部或种群之间的表观遗传差异,是对遗传多样性、遗传变异研究的有力补充。
- 龚治张亚楠周世豪符悦冠
- 关键词:生态学种群变异
- 盐胁迫下石斛基因组DNA甲基化敏感扩增多态性(MASP)分析
- 以石斛属植物(Dendrobium)为材料,研究不同NaCl浓度下石斛生理生化指标及基因组DNA的甲基化水平和变化模式.结果表明,在100、150、200mmol/L NaCl处理下石斛叶片的SOD、POD和CAT活性发...
- 吴超林巧琦丁晓瑜林森洪黎侠郭方其
- 关键词:盐胁迫DNA甲基化
- 利用甲基化敏感扩增多态性技术筛选白棉子叶衰老相关基因的方法
- 本发明公开了一种利用甲基化敏感扩增多态性(MSAP)技术筛选白棉子叶衰老相关基因的方法。其步骤如下:待棉花幼苗长至10d左右,两片子叶完全展开后,选取长势一致的幼苗,分别用300、500和700mg·L-1的乙烯利涂抹子...
- 郭宁席晓广林毅蔡永平樊洪泓孙旭