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甲型副伤寒沙门菌感染性心内膜炎1例报告被引量：1: 2022年; 患者,女,67岁,因“间断发热1+月”于2021年8月31日收治入院。入院前1+月,患者出现发热,最高体温为38.6℃,伴畏寒、寒战、大汗淋漓、乏力,伴恶心、呕吐,于当地医院就诊,血常规:白细胞计数(WBC):10.06×10^(9)/L,中性粒细胞比率(NEUT%):80.0%,血红蛋白(HGB):111 g/L,C反应蛋白(CRP):68.73 mg/L。胸部CT提示∶主动脉瓣膜换术后,心包少量积液,心脏各房室未见增大。; 欧璋亚伍丽萍黄仁刚徐开菊王蜀强; 关键词：感染性心内膜炎甲型副伤寒沙门菌主动脉瓣膜胸部CT 间断发热寒战

基于全基因组测序的甲型副伤寒沙门菌暴发疫情分离株分子特征研究被引量：3: 2022年; 目的分析一起甲型副伤寒暴发疫情菌株的分子分型特征,为病原菌的确定和暴发疫情的防控提供科学依据。方法利用生化试验、血清学试验对病原菌进行鉴定,并将分离到的病原菌进行微量肉汤稀释法药物敏感性试验、PFGE分子分型分析、全基因组测序,利用全基因组数据与沙门菌MLST标准数据库比对获得序列型别(ST)、cgMLST序列号以及rMLST序列号并进行聚类分析,通过细菌基因组分析平台fIDBA分析病原菌的耐药、毒力相关基因。结果11株沙门菌血清型均为甲型副伤寒沙门菌,具有100%相似性的PFGE带型,MLST、cgMLST、rMLST的型别均分别为ST129型、cgST-2191型、rST3678型,表明此次暴发疫情菌株从分子特征角度可诊断为同一传染源导致。对萘啶酸100%耐药,对链霉素100%中介。发现本次疫情菌株基因组均携带29种耐药基因。通过毒力因子数据库比对,均携带21类250种已知毒力基因,其中以Ⅲ型分泌系统、粘附、鞭毛等最为常见。结论本次暴发疫情是由共同来源的、具有相同分子分型特征的甲型副伤寒沙门菌引起。在病原溯源研究中,应用全基因组数据可更精细分析菌株遗传进化特征、亲缘关系及毒力基因、耐药基因携带情况,可以作为替代PFGE、MLST的技术用于更精准的传染病分子流行病学调查分析研究。; 李毅谢爱蓉谢中必; 关键词：甲型副伤寒沙门菌全基因组测序耐药基因毒力基因分子分型

人类肠道病原菌感染诊断用甲型副伤寒沙门菌特异性基因探针: 本发明公开了一种类肠道病原菌感染诊断用基因芯片甲型副伤寒沙门菌特异性基因探针，其核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示。通过确定候选序列后，设计特异性引物，选用标准和临床分离的野生菌株进行PCR调查和相应的序列分析验证。...; 黄新祥

口服甲型副伤寒沙门菌致病岛2缺失株对小鼠的免疫保护效力评估: 2020年; 目的评估甲型副伤寒沙门菌致病岛2缺失株(SPA017ΔSPI2)对小鼠的免疫保护效力,研制有效的甲型副伤寒沙门菌减毒口服疫苗。方法以1×10~8菌落形成单位(CFU)的SPA017ΔSPI2对6周龄的雌性Balb/c小鼠进行口服免疫,7 d后以相同剂量进行二次免疫,测定小鼠体质量变化、SPA017ΔSPI2体内定植水平、血清抗体水平和脾脏淋巴细胞增殖水平,并对SPA017ΔSPI2亲本株SPA017攻毒后的保护效力进行评价。结果 SPA017ΔSPI2免疫后不影响小鼠的生长性能,该缺失株在小鼠体内具有一定的定植能力,且SPA017ΔSPI2能够诱导小鼠产生显著的体液免疫应答和细胞免疫应答反应,攻毒后免疫组小鼠的发病率和死亡率均显著低于对照组。结论甲型副伤寒沙门菌致病岛2缺失株经口服免疫后可对小鼠提供良好的免疫保护,可以作为甲型副伤寒理想的疫苗候选株。; 张晶晶杨占峰岳丽晓潘鹏涛何群力殷俊磊; 关键词：甲型副伤寒沙门菌口服疫苗免疫应答免疫保护

云贵高原地区甲型副伤寒沙门菌优势克隆群的研究: 2018年; 目的分析2005-2012年我国云贵高原(广西壮族自治区、贵州省、云南省)临床甲型副伤寒沙门菌分离株分子分型和群体结构。方法收集2005-2012年我国三个伤寒副伤寒高发省份分离自临床的甲型副伤寒沙门菌分离株145株。采用两种酶切(XbaI和SpeI)进行脉冲场凝胶电泳(pulsed field gel electrophoresis,PFGE)分型分析。分析描述我国云贵高原近8年来的甲型副伤寒沙门菌优势克隆群及克隆群变迁。结果 145株甲型副伤寒沙门菌采用XbaI酶切可以得到38个PFGE型;采用SpeI酶切可以得到42个PFGE型;利用两种酶切结果联合分析,可以得到71个型别,其中2个型别所含菌数均超过10株。结论有些型别仅分布于某个省份某一年份,有些型别却可以在某一省份长期存在并逐年传播,成为优势型别。不同省份间优势型别有所不同,呈现一定的地域差异。; 李臻鹏杜小莉刁保卫闫梅英阚飙徐嘉良卢昕; 关键词：甲型副伤寒沙门菌云贵高原脉冲场凝胶电泳分子分型

甲型副伤寒沙门菌特异性基因筛选及PCR检测体系建立被引量：4: 2018年; 以甲型副伤寒沙门菌为检测目标,通过比较基因组和聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)验证方法筛选到4个该血清型的特异性基因,其中以gene_3105作为该血清型的检测靶点设计引物PA23;并结合沙门菌属特异性引物139-141,建立一种甲型副伤寒沙门菌的PCR检测方法。优化PCR反应体系,并对该检测体系的特异性、灵敏度、抗干扰能力及人工污染样品检出限等方面进行评价。结果表明,当样品中含有甲型副伤寒沙门菌时,该体系能扩增出2条特异性条带,含有其他血清型的沙门菌仅能扩增出284 bp条带,不含沙门菌无扩增条带产生。灵敏度评价表明,基因组DNA和纯菌菌落检出限分别为32.4 pg/μL和4.3×10~3 CFU/m L;抗干扰能力实验显示,当鸡肉背景菌群和猪肉背景菌群浓度在10~6 CFU/m L和4.87×10~7 CFU/m L时,检出限为6.43×10~4 CFU/m L。当无菌的鸡肉和猪肉样品中添加N CFU/25 g甲型副伤寒沙门菌时,经10 h增菌,检测结果为阳性(0甲型副伤寒沙门菌PCR检测方法具有较好的特异性和灵敏度,有很好的应用价值,可在食品安全领域广泛应用。; 翟立公王俊颖张小雨孟欣崔葆赵婉晴牛萍; 关键词：甲型副伤寒沙门菌比较基因组聚合酶链式反应

杭州地区甲型副伤寒沙门菌基因组流行病学的初步研究被引量：3: 2018年; 目的了解近年来杭州地区甲型副伤寒沙门菌的基因组流行病学特征.方法采用二代测序技术（NGS）对2002—2013年杭州地区分离的60株甲型副伤寒沙门菌代表株进行测序并下载公共数据库中的391株甲型副伤寒沙门菌基因组数据.以ATCC9150基因组为参考序列,鉴定所有基因组的单核苷酸多态性（SNP）位点并去除重组,构建基于SNP位点的系统发育树.用SRST2和多位点序列分型（MLST）工具扫描获得MLST型别,用SISTR扫描获得核心基因组多位点序列分型（cgMLST）型别,用SRST2和BLASTN扫描获得耐药基因.选择7种抗生素对60株杭州菌株进行药物敏感试验.结果 451株甲型副伤寒沙门菌基因组序列去重组后共鉴定得到19258个SNP位点,菌株平均距离为0.0070,距离小于0.05的占96.73%,提示451株甲型副伤寒沙门菌基因组差异较小.58株杭州ST85型分离株基因组序列高度相似,提示2002—2013年杭州地区甲型副伤寒疫情主要由ST85型菌株克隆传播引起.杭州菌株与5株国内5省菌株遗传距离较远（平均距离为0.057）,与15株云南菌株距离较近（平均距离为0.0032）,与柬埔寨菌株的距离最近（平均距离为0.0018）,提示ST85型菌株存在跨国传播的可能性.2株杭州ST129型分离株中,HZ333与分离自江苏的两株菌近源（平均距离为0.0097）,提示ST129型部分菌株存在国内传播的可能性.60株杭州菌株除2株未分型外,其余58株菌被分为9个cgMLST型别;公共数据库中391株菌除57株未分型外,其余334株菌被分为165个cgMLST型别.60株杭州菌株均携带耐药基因,其中56株菌携带aac6-Iy耐药基因,4株菌携带aac6-Iaa耐药基因;公共数据库中的391株甲型副伤寒沙门菌除了13株菌未携带耐药基因,其他378株菌均携带aac6-Iy耐药基因.60株杭州菌株中56株菌对7种抗生素均敏感;3株菌对复方新诺明耐药;1株菌对氨苄西林、四环素耐药.结论 2002—2013年杭州地区甲型副�; 汪皓秋俞骅郑伟郑之北潘劲草; 关键词：甲型副伤寒沙门菌单核苷酸多态性多位点序列分型耐药基因

壳聚糖纳米粒在甲型副伤寒沙门菌外膜蛋白疫苗中的应用被引量：1: 2018年; 目的探讨壳聚糖(chitosan,CS)纳米粒作为甲型副伤寒沙门菌重组外膜蛋白NmpC和PagC的佐剂对小鼠的免疫效果。方法采用离子交联法将甲型副伤寒沙门菌重组外膜蛋白NmpC和PagC与CS结合制成CS纳米粒,扫描电镜观察纳米粒外观,激光粒度分析仪测定纳米粒粒径和多分散系数,BCA法测定其包封率。将CS纳米粒经肌肉注射免疫BALB/c小鼠,ELISA法检测小鼠血清特异性抗体IgG、IgG_1和IgG_(2a)水平。结果载蛋白CS纳米粒粒径约为300 nm,包封率达85%以上。NmpC和PagC的CS免疫组小鼠血清IgG抗体滴度远高于铝佐剂组,产生的IgG_1和IgG_(2a)抗体滴度也均高于相应的铝佐剂免疫组,且差异均有统计学意义(P<0.05);IgG_1和IgG_(2a)之间差异无统计学意义(P>0.05)。结论 CS纳米粒作为新型疫苗佐剂可用于甲型副伤寒蛋白疫苗的研究。; 梁昊宇任慧梅张影董思国王斌曾明; 关键词：壳聚糖纳米粒甲型副伤寒外膜蛋白疫苗铝佐剂

壳聚糖介导甲型副伤寒沙门菌nmpC和pagC DNA疫苗的构建及其免疫效果被引量：1: 2018年; 目的构建壳聚糖(chitosan,CS)介导的甲型副伤寒沙门菌nmpC和pagC的DNA疫苗,并探讨该疫苗的免疫效果。方法按哺乳动物的密码子偏好性对nmpC和pagC的基因序列进行优化,并将优化后的序列克隆至真核表达载体provax中,构建provax-nmpC和provax-pagC DNA疫苗。采用复凝聚法制备载DNA疫苗的CS纳米粒,并对CS/DNA纳米粒的特性进行检测。将provax-nmpC和provax-pagC DNA疫苗及其相应的CS纳米粒体外转染BHK细胞,采用Western blot检测目的蛋白的表达。采用活体电击法分别用不同组分的蛋白免疫小鼠,ELISA法检测血清抗体水平及抗体类型。结果 provax-nmpC和provax-pagC DNA疫苗经双酶切鉴定,构建正确。疫苗可与CS发生有效结合,纳米粒形似球形,粒径均一,包封率均达90%以上,且CS可防止DNA被DNaseⅠ酶降解。provax-nmpC及CS/provax-nmpC均能诱导小鼠产生有效的免疫反应,两组间差异无统计学意义(P>0.05);provax-pagC与CS/provaxpagC均能诱导小鼠产生有效的免疫反应,且provax-pagC组的抗体水平明显高于CS/provax-pagC(P<0.05)。provax-nmpC和provax-pagC组的IgG1及IgG2a抗体水平均高于相应的CS组(P<0.05),且IgG1和IgG2a间差异无统计学意义(P>0.05)。结论 DNA疫苗provax-nmpC和provax-pagC均可诱导有效的免疫反应;载基因CS纳米粒并未增强DNA疫苗的免疫效果;CS未改变DNA疫苗的免疫应答类型,但具有调节Th1和Th2平衡的作用。; 梁昊宇任慧梅张影董思国王斌曾明; 关键词：壳聚糖甲型副伤寒沙门菌 DNA疫苗

2002-2013年杭州地区甲型副伤寒沙门菌分子分型研究被引量：5: 2017年; 目的了解近年来杭州地区甲型副伤寒沙门菌的分子特征。方法采用脉冲场凝胶电泳（PFGE）、多位点串联重复序列分析（MLVA）对2002—2013年杭州地区分离的72株甲型副伤寒沙门菌代表株进行分子分型及流行病学分析。结果72株甲型副伤寒沙门菌分为11个PFGE（XbaⅠ、BlnⅠ）型别，6个MLVA型别。受检的34个可变串联重复序列（VNTR）位点中，1188K、2075K、2201K、4346K这4个位点表现出多态性。PFGE显示出较MLVA更高的分辨力。除X4B5、X7B7、X8B8、X9B9、X10B10这5种型别外，其他6种型别为同一个克隆系（相似度大于95%），该克隆系菌株占受试总菌株数的93.1%。结论2002—2013年杭州地区甲型副伤寒疫情主要由同一克隆系的菌株引起，联合应用PFGE和MLVA有利于甲型副伤寒的流行病学调查。; 汪皓秋郑伟俞骅张蔚潘劲草; 关键词：甲型副伤寒沙门菌脉冲场凝胶电泳

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