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搜索到30336篇“ 生物信息分析“的相关文章

生物信息分析系统、方法、电子设备及介质: 本申请提供一种生物信息分析系统、方法、电子设备及介质，生物信息分析方法包括：利用生物信息统计方法对生物分子数据集进行映射或转化处理，以获取对应的生物通路数据集；对生物通路数据集构成的生物网络进行拓扑分析，以获取整合后的生...; 产天龙徐祎春韩峻松苏军李倩袁箐丁岩汀何志远赵佳伟

病原微生物宏基因组测序生物信息分析及报告质量控制专家共识: 2025年; 病原微生物宏基因组测序(mNGS)对临床感染性疾病的诊断和治疗具有重要作用。近年,国内外多项关于mNGS技术标准化与临床实施的专家共识从不同的角度对该技术的临床实践起到了规范作用。但复杂的生物信息分析和非标准化的报告审核依然是mNGS在向临床转化过程中面临的重要挑战。为提高测序后生物信息分析方法的规范和质量以及报告的临床可靠性和诊断价值,中华医学会检验医学分会组织相关专家在系统性复习文献的基础上,结合临床实践需求,通过德尔菲专家函询及专家论证会,最终形成《病原微生物宏基因组测序生物信息分析及报告质量控制中国专家共识》(以下简称《共识》)。共识规定了临床疑似感染标本宏基因组测序后病原微生物生物信息分析的内容、方法和结果报告的规则与要求,为临床实验室规范使用该方法检测临床感染性病原微生物提供支持。; 中华医学会检验医学分会李莉王成彬王传新陈崴李少川韩东升; 关键词：病原微生物宏基因组高通量测序生物信息

基于生物信息分析工具模块的生物信息分析方法、装置和电子设备: 公开了一种基于生物信息分析工具模块的生物信息分析方法，装置和电子设备。该方法包括：接收用户请求；解析用户请求以确定用户请求的类型；响应于用户请求是工具调用请求，确定与用户请求相关联的主类别字段和子类别字段，主类别涉及生物...; 苑赞刘涛李志民孙雪光王娟

基于尿液代谢组学结合生物信息分析技术的焦虑症尿液标志物研究: 2025年; 目的基于液质联用技术的尿液代谢组学方法结合生物信息学分析技术探究尿液中与焦虑症相关的生物标志物和作用机制。方法采集在籍大学生尿液样本,以心理问卷调查结果为依据分为正常组和焦虑组,采集尿液样本的液质联用高通量数据,结合多变量统计分析筛选尿液差异代谢物。再利用生物信息学分析技术预测差异代谢物的主要富集通路,探究焦虑症作用机制。结果共鉴定得到162个尿液代谢物,经正交偏最小二乘法判别分析确定正常组和焦虑组间存在23个显著性差异代谢物,并通过KEGG富集分析预测得差异代谢物主要富集于氮代谢、精氨酸生物合成、丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸的生物合成、乙醛酸和二羧酸生物合成等信号通路。结论本研究通过对在籍大学生的尿液样本进行分析研究,预测了焦虑症相关的尿液标志物和作用机制,可为焦虑症临床早期诊断和干预治疗提供理论依据和数据支撑。; 辛红梅高晨阳布仁莲花白文明; 关键词：生物信息学分析焦虑症大学生

生物信息分析与精准医疗的融合应用以及未来的机遇与挑战: 2025年; 本文探讨了生物信息分析在精准医疗领域的应用,包括其背景、作用、创新点、面临的挑战与机遇。生物信息分析通过深度学习、机器学习、数据挖掘等手段分析患者基因组数据,为个性化药物治疗、疾病早期诊断和风险评估提供了强有力的策略。生物信息分析技术可早期诊断疾病,提高治疗效果,降低疾病风险。生物信息分析在癌症治疗中作用最为明显,如通过基因组测序识别药物敏感性,为患者定制治疗方案。随着技术的进步,精准医疗将推动医疗领域向更个性化、高效的方向发展,提升患者的生活质量。; 杜秉岳陶军; 关键词：生物信息分析个性化治疗

骨关节炎软骨细胞中hsa-miR-3202的生物信息分析与功能验证: 2025年; 背景:软骨细胞增殖与凋亡的失衡在骨关节炎发生发展中起着重要作用,已有研究发现hsa-miR-3202参与调节多种细胞的增殖和凋亡过程,然而尚未有研究探讨hsa-miR-3202与骨关节炎的相关性。目的:探讨hsa-miR-3202在骨关节炎软骨细胞中的表达及其对软骨细胞增殖与凋亡能力的影响。方法:①通过生物信息分析筛选骨关节炎软骨细胞中差异表达的microRNA,基于国内外研究现状,选择hsa-miR-3202进行后续研究,采用GO功能富集和KEGG通路富集对其进行靶基因预测。②选择对数生长期的人正常软骨细胞系C28/I2,随机分4组培养:正常组加入普通培养基培养24 h,更换普通培养基培养6 h,更换普通培养基继续培养;脂多糖组加入含脂多糖的培养基培养24 h,更换普通培养基培养6 h,更换普通培养基继续培养;脂多糖+NC组加入含脂多糖的培养基培养24 h,加入has-miR-3202 mimics对照转染6 h,更换普通培养基继续培养;脂多糖+hsa-miR-3202 mimics组加入含脂多糖的培养基培养24 h,加入has-miR-3202 mimics转染6 h,更换普通培养基继续培养。继续培养48 h后,采用RT-qPCR检测细胞hsa-miR-3202表达,流式细胞术检测细胞凋亡;继续培养0-72 h,采用CCK-8检测细胞增殖活力。结果与结论:①生物信息分析结果显示,hsa-miR-3202表达在骨关节炎软骨细胞中显著下调;GO功能富集与KEGG通路富集结果显示,hsa-miR-3202靶基因功能与细胞生长、凋亡密切相关。②体外细胞实验结果显示,与正常组比较,脂多糖组软骨细胞hsa-miR-3202表达与细胞增殖能力下降(P<0.05),细胞凋亡率增加(P<0.05);与脂多糖组比较,脂多糖+hsa-miR-3202 mimics组软骨细胞hsa-miR-3202表达与细胞增殖能力升高(P<0.05),细胞凋亡率减少(P<0.05)。③结果表明,hsa-miR-3202在骨关节炎软骨细胞中表达下调,其表达下调可抑制细胞增殖并促进细胞凋亡,进而影响骨关节炎疾病的发生和发展。; 张佳琪刘艳虹梁慧婷周晶晶王雅雯许憬瑜李煜爽雷立健胡晓琴; 关键词：骨关节炎生物信息学软骨细胞

玉米ZmAAP基因生物信息分析及其亚细胞定位: 2025年; 氨基酸透性酶(Amino acid permeases,AAPs)在植物转运氨基酸过程中发挥重要的调节作用,为进一步探究玉米AAP基因(ZmAPP)相关生物学功能,本研究以玉米‘B73’为材料,克隆AAP基因(ZmAPP)对其序列进行生物信息学分析,构建绿色荧光蛋白EGFP表达载体pCAMBIA1300-ZmAAP-EGFP,通过农杆菌介导法转化洋葱表皮,使用荧光显微镜观察基因表达情况。结果表明,玉米AAP基因c DNA序列全长为1 407 bp,编码468个氨基酸,理论等电点(pI)为8.72,不稳定系数为36.93(<40),总平均亲水性为0.487,属于碱性稳定疏水蛋白。系统进化分析表明,ZmAAP与大麦AAP基因在氨基酸水平序列亲缘关系最近。亚细胞定位结果表明,ZmAAP定位在细胞膜。本研究为后续深入研究玉米AAP基因功能以及氨基酸转运机制提供了一定的研究基础。; 王宇张铭牛晓娜葛均筑赵飞吴疆; 关键词：玉米生物信息分析亚细胞定位

生物信息分析验证基于lncRNA标签预测HPV阴性头颈部鳞状细胞癌患者总生存率: 2025年; 目的:采用生物信息分析方法研究影响HPV阴性头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)患者总生存率的相关因素,为HNSCC患者的预后预测及治疗提供依据。方法:从TCGA数据库获取HPV阴性HNSCC患者的病变组织和癌旁组织的原始RNA测序数据以及相应病人的临床信息,SurvivalR工具包对所有差异表达的长链非编码RNA(lncRNA)进行单变量Cox回归分析,使用JAVA程序,利用MSigDBC2经典通路基因集集合进行基因集富集分析,采用LASSO方法的Cox回归对数据降维和模型构建,计算每个患者的风险评分。结果:研究发现153个lncRNA与HPV阴性HNSCC患者的总生存率显著相关,时间依赖性分析表明,13个lncRNA特征在训练集中具有良好的预测性能,多变量Cox回归和分层分析表明,基于13-lncRNA标签的风险评分可作为HPV阴性HNSCC患者的独立预后因素。结论:13-lncRNA标签可能是HPV阴性HNSCC预后的新型独立生物标志物。; 黄宇杨博李伟忠; 关键词：头颈部鳞状细胞癌生存率生物信息分析

基于植物代谢组学和生物信息分析技术的诃子制草乌药效物质基础研究: 2025年; 目的采用植物代谢组学技术结合生物信息分析和体外活性验证方法,阐明诃子制草乌的药效物质基础。方法首先,基于液质联用分析技术采集诃子制草乌炮制前后水提物的高通量数据,利用多元统计分析结合单变量分析方法筛选炮制前后的差异化学成分。其次,基于所筛选差异化学成分采用生物信息分析和模拟分子对接技术,对诃子制草乌治疗类风湿性关节炎的潜在药效成分、作用靶点和信号通路进行分析。最后,通过体外细胞抗炎活性和抗氧化活性实验进行药效学验证。结果草乌炮制前后共筛选得到包括生物碱类、有机酸类和糖类成分等64个差异化学成分。诃子制草乌可能通过调控肿瘤蛋白P53(tumor protein P53, TP53),雌激素受体1(estrogen receptor 1, ESR1),热休克蛋白90α(heat shock protein 90alpha, HSP90AA1)和磷酸肌醇-3-激酶调节亚基1(phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1,PIK3R1)等蛋白的异常表达,经癌症信号通路,代谢信号通路,磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B(phosphatidylinositol 3-kinase and protein kinase B,PI3K-Akt)信号通路,丝裂原活化蛋白激酶(mitogen activated protein kinase, MAPK)信号通路和肾素-血管紧张素系统(rennin angiotensin system, RAS)信号通路发挥治疗类风湿性关节炎的作用。炮制前后的草乌水提物均能显著抑制脂多糖(lipopolysaccharide, LPS)诱导的NO、肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-alpha, TNF-α)、白细胞介素-6(interleukin-6,IL-6)和白细胞介素-1β(interleukin-1β,IL-1β)等炎症因子的释放量,同时对1,1-二苯基-2-三硝基苯肼(1,1-diphenyl-2-trinitrophenyl hydrazine, DPPH)自由基、羟基自由基以及超氧阴离子具有显著的清除能力。结论明确了诃子制草乌的药效物质基础,为草乌安全有效的临床应用提供了理论依据。; 马广平焦慧平莲花布仁朱晓伟白文明; 关键词：生物信息分析抗炎活性抗氧化活性

FOXP3在卵巢癌肿瘤微环境中表达与生存预后关系的生物信息分析: 2025年; 背景:上皮性卵巢癌的肿瘤微环境中免疫细胞的比例和功能状态直接影响患者的预后及治疗响应。研究表明,CD4^(+)T细胞支持抗肿瘤免疫,在特定条件下可发挥抗肿瘤作用;CD8^(+)T细胞的高浸润被视为积极的预后标志;FOXP3^(+)Tregs则在维持免疫耐受和调节免疫反应中起关键作用。目的:通过生物信息算法对416例上皮性卵巢癌患者的数据信息及21例上皮性卵巢癌患者的临床病理样本进行综合分析,探讨CD4^(+)T细胞、CD8^(+)T细胞、FOXP3^(+)T细胞在卵巢癌肿瘤微环境的表达与生存预后的关系。方法:①通过非负矩阵分解算法对来自美国国家癌症研究所癌症基因组图谱的卵巢癌子数据集的416例上皮性卵巢癌患者进行分组。运用估算RNA转录子相对子集识别细胞类型算法对高生存率组和低生存率组患者的免疫细胞浸润程度进行差异分析。②收集在解放军总医院手术治疗的21例上皮性卵巢癌患者的病理组织,通过多重荧光免疫组织化学检测病理组织中的CD4、CD8、FOXP3因子,并分析其与患者预后的关系。结果与结论:在高生存率组中,CD4^(+)T细胞、CD8^(+)T细胞及FOXP3^(+)调节性T细胞等多种免疫细胞浸润比例显著高于低生存率组(P<0.01)。多重荧光免疫组织化学实验结果显示,FOXP3的高表达与卵巢癌患者更好的预后显著相关(P<0.05)。说明FOXP3在肿瘤微环境中的表达与上皮性卵巢癌患者的生存率相关,提示FOXP3^(+)调节性T细胞在肿瘤微环境中的浸润程度可能与上皮性卵巢癌患者的预后相关。; 林蓉沁潘秀颉卞丽红; 关键词：FOXP3 非负矩阵分解肿瘤微环境疾病预后

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