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一种影响产仔数的SNP标记
本发明提供了一种影响产仔数的SNP标记。所述SNP标记的核酸的序列如SEQ ID No.1所示,所述SNP标记的位点位于如SEQ ID No.1所示的核酸上的从5’端起的第301位,对应于11.1版本国际基因组的4号染...
黄路生辛文水孙迎春肖石军吴钟紫
一种与产仔数性状相关的SNP标记引物对及其应用
本发明涉及一种与产仔数性状相关的SNP标记引物对及其应用。所述SNP标记位于3号染色体上的核苷酸序列上,所述SNP标记的位点为国际基因组11.1版本参考序列3号染色体含rs335892787核苷酸位点的分子标记,...
李平华马金凤黄瑞华蒋能静刘倩刘晨曦赵清波周五朵蔡文武陈健梅
一种SNP分子标记及其在产仔数性状筛选和/或育种中的应用
本发明公开了一种SNP分子标记及其在产仔数性状筛选和/或育种中的应用,涉及分子标记技术领域。所述母产仔数性状为总产仔数、产活仔和健仔;所述分子标记位于SRRM3基因第三内含子序列中,该序列长度为447bp...
冯越张宇梅书棋彭先文吴俊静乔木 周佳伟 李梓芃 徐忠孙华李良华刘贵生董斌科宋忠旭赵海忠
一个与产仔数性状相关的lncRNA及其变异位点与应用
本发明公开了一个与产仔数性状相关的lncRNA及其变异位点与应用,该变异位点位于如SEQ ID NO.1所示的lncRNA的第128位核苷酸处,该位点为G>A单核苷酸突变,该位点在母群体中存在GG、GA和AA...
李齐发王苗苗杜星吴望军
一种与青海八眉产仔数性状相关的SNP分子标记及其应用
本发明公开了一种与青海八眉产仔数性状相关的SNP分子标记,属于分子育种技术领域。所述SNP分子标记的SNP位点位于<I>DRD1</I>基因第1159位,且该处碱基是C、T或G中的一种,其中,所述DRD1基因的核苷酸序...
吴国芳王磊吴森马玉红
MMP2基因多态性作为产仔数性状的遗传标记及应用
本发明属于遗传标记筛选领域,具体涉及MMP2基因多态性作为产仔数性状的遗传标记及应用。从MMP2基因内含子13上克隆得到遗传标记,序列如SEQ ID NO:1或SEQ ID NO:2所示。公开了MMP2基因内含子1...
李凤娥徐文宁李珍珠陈亚茹陈大可陈高贵
一种SNP分子标记及其在产仔数性状筛选和/或育种中的应用
本发明公开了一种SNP分子标记及其在产仔数性状筛选和/或育种中的应用,涉及分子标记技术领域。所述母产仔数性状为总产仔数、产活仔和健仔;所述分子标记位于SRRM3基因第三内含子序列中,该序列长度为447bp...
冯越张宇梅书棋彭先文吴俊静乔木 周佳伟 李梓芃 徐忠孙华李良华刘贵生董斌科宋忠旭赵海忠
产仔数的全基因组关联分析被引量:1
2022年
为筛选产仔数和产活仔性状关键SNP分子标记或候选基因,采用Illumina porcine 50K芯片对同一场186头加系大白能繁母开展了全基因组SNP扫描,后又对扫描结果进行了质量控制、Beagle填充和SNP基因型分型,结合这些试验的表型性状测定和群体结构分析结果,进行全基因组关联分析(GWAS)。群体结构分析结果表明,试验所用的加系大白样本未出现群体分层现象;在18对(36条)常染色体上一共得到36867个有效SNP标记,用于试验的GWAS分析。GWAS结果表明,这些加系大白所有胎次总产仔数共显著关联到2个SNP,分别为seq-rs323899658和seq-rs329781338,其中seq-rs329781338 SNP又注释到3个基因,分别为SSBP1、WEE2和KIAA1147。产活仔共显著关联到7个SNP,分别为seq-rs81238474、seq-rs321377412、seq-rs340736313、seq-rs80782154、seq-rs81244816、seq-rs81467772和seq-rs329781338,这7个SNP中有5个SNP有基因注释,共注释到22个基因,分别为EphA1、TAS2R60、FAM131B、CLCN1、CASP2、TMEM139、TRBV21OR9-2、PRSS2、TRBV19、TRBV24-1、U6、SSBP1、WEE2、KIAA1147、NKX2-8、ALKBH3、HSD17B12、U6、HOMER2、WHAMM、FSD2和SCARNA15。候选基因GO功能和KEGG通路分析结果表明,这些基因GO功能中最显著的生物学过程为多生物过程的调控、分子功能为非跨膜/跨膜蛋白酪氨酸激酶活性,KEGG通路为错配修复。结合GWAS和基因功能注释结果,WEE2和EphA1基因可作为提高加系大白产仔数和产活仔的关键候选基因。
付言峰赵为民李辉李碧侠程金花徐小波任守文
关键词:全基因组关联分析产仔数SNP芯片
CLSTN2基因调控产仔数的关键位点鉴别及其功能分析
产仔数是养生产中最重要经济性状之一,提高产仔数是生养殖的重要目标。二花脸作为世界最高产仔记录保持者,是研究产仔数性状的优质资源。团队前期研究发现二花脸群体内产仔数变异较大,高、低产母排卵和子宫角长度差异显著...
张萍
关键词:二花脸猪产仔数遗传位点
MMP2基因多态性作为产仔数性状的遗传标记及应用
本发明属于遗传标记筛选领域,具体涉及MMP2基因多态性作为产仔数性状的遗传标记及应用。从MMP2基因内含子13上克隆得到遗传标记,序列如SEQ ID NO:1或SEQ ID NO:2所示。公开了MMP2基因内含子1...
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黄路生
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张亚平
作品数:473被引量:3,630H指数:36
供职机构:中国科学院昆明动物研究所
研究主题:线粒体DNA 引物 猪产仔数 MTDNA 性状
李凤娥
作品数:97被引量:208H指数:8
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研究主题:猪精液 性状 基因 产仔数 猪产仔数
熊远著
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供职机构:华中农业大学
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梅书棋
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研究主题:分子标记 引物 湖北白猪 肌内脂肪 基因