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非变性质谱评估乳铁蛋白的构象稳定性和糖基化异质性
乳铁蛋白(lactoferrin,LTF)作为一种多功能糖蛋白,营养价值丰富,具有多种生物活性,被广泛应用于功能食品和食品添加剂中。然而,在生产和储存过程中,对LTF的质量控制仍然存在不足。应用非变性质谱(native ...
慕宇
关键词:乳铁蛋白构象稳定性
辨析基础有机化学教材中的争议问题:乙烷构象稳定性的来源被引量:1
2024年
烷烃的构象及其稳定性是基础有机化学中重要的知识点,其中乙烷的交叉式与重叠式构象是其中最基础的部分。现行的国内外本科基础有机化学教材中关于乙烷的交叉式构象比重叠式构象稳定的原因给出了不同的解释,比较混乱,不易于本科教学。本文调研了文献,梳理出乙烷交叉式构象稳定性来源的不同论点和论据,并指出先前文献分析与计算方法的不足。通过文献调研,我们认为超共轭效应和空间位阻效应两种因素都需要写入教材中。
凌皓博赵佩鈜俞寿云
关键词:库仑力位阻效应超共轭效应
多元醇对全人源抗VEGF_(165)单克隆抗体构象稳定性及胶体稳定性的影响被引量:1
2016年
通过研究4种多元醇(海藻糖、甘露醇、山梨糖和蔗糖)对全人源抗VEGF165单克隆抗体(HVAB)构象及胶体稳定性的影响,筛选出最优的HVAB稳定剂并探讨多元醇稳定抗体的作用机制。该研究运用差示荧光扫描法(Differential scanning fluorimetry,DSF)判断多元醇对抗体热稳定性的影响;采用圆二色光谱(Circular dichroism,CD)和二阶导数色氨酸荧光光谱探讨多元醇对抗体构象稳定性的影响;聚乙二醇诱导抗体发生液-液相分离现象判断多元醇对抗体胶体稳定性的影响。结果表明4种多元醇均能提高抗体的热稳定性及胶体稳定性;多元醇作为辅料添加到溶液中会引起抗体构象发生变化,圆二色谱结果显示HVAB二级结构发生变化,但仍然以β-折叠为主;海藻糖和甘露醇引起HVAB发生去折叠,并未引起抗体发生聚集或片段化,同时提高了抗体的胶体稳定性;山梨糖提高抗体Tm值效果最明显,在稳定抗体胶体结构方面也表现突出,且作为添加剂对抗体二级结构影响最小。说明抗体的构象稳定性和胶体稳定性相互影响;山梨糖可作为HVAB的最优稳定剂。
高飞刘煜
关键词:多元醇单克隆抗体构象稳定性胶体稳定性圆二色谱
单取代乙硅烷交叉式构象稳定性本质的DFT研究被引量:1
2016年
探讨8种常见单取代乙硅烷交叉式(R-Si_2H_5)和重叠式稳定性差异的物理作用本质。尝试采用密度泛函理论(DFT/B3LYP)优化分子骨架结构,结合Aug-cc-p VDZ基组计算了8种单取代乙硅烷分子交叉式与重叠式的电子能量。结果发现,相关能差值(ΔE_c)与总能量差值(ΔE)的相关回归系数最高(R^2=0.95),交换能差值(ΔE_x)与ΔE相关回归系数次之(R^2=0.93)。选择ΔE_c与ΔE_x对ΔE进行多元线性拟合,得到其相关回归系数(R^2=0.95),再用拟合公式计算ΔE实际,并与计算得到的ΔE理论进行线性拟合,得到其相关回归系数R^2=0.95。由此认为,8种代表性单取代交叉式乙硅烷的构象稳定性主要起源于其分子内的相关能(E_c)和交换能(E_x)的分别而独立的作用,它们不同于乙烷旋转位垒的C-H西格玛键电子受-授超共轭相互作用。自然键轨道(NBO)分析图及其电子云密度相关图(LOL)也支持了上述观点。
熊艳
关键词:重叠式密度泛函理论
Fos-Jun连接的AFP/HLA-A2二聚体的制备及其构象稳定性的分析
HLA-A2是一种经典的MHC I类分子,含两条多肽链:重链(H链或α链,包括α1、α2和α3结构域)与轻链(L链或β2m链),其中β2m非共价结合于α3结构域。抗原肽结合于由α1、α2形成的抗原结合槽,当抗原肽与MHC...
王珂
关键词:反应性T细胞
尼克酰胺核苷构象稳定性的理论研究
2015年
采用从头算(HF与MP2)和密度泛函理论(DFT)方法,在3-21G 和6-31+G?水平上研究了尼克酰胺核苷(NR)的构象.分别探讨了在气相及液相(水和氯仿)中 NR 分子和一水合物异构体的相对稳定性,分析了溶剂分子的参与对NR异构体的相对稳定性和几何结构参数的影响.结果表明:孤立的NR分子在气相中存在36种稳定构象,其中最稳定的为南式构象NR-S,而最稳定的北式构象为NR-K’,能量比前者高出10.6 kJ/mol (ΔG298K).NR 分子中酰胺基团优势构象为反式,ω,P 或γ参数的改变可以为 NR 分子提供大约8.4~23.7 kJ/mol(ΔG298K )稳定化能.不管是南式还是北式褶皱,最稳定 NR 分子构象中都存在多根分子内氢键,且5’-OH 基团都为顺式构象(γ≈-63°).溶剂效应使一部分NR分子构象相对稳定性降低,而一部分则升高,改变了NR分子各构象的相对稳定性顺序.水分子的加入与酰胺基团结合形成氢键,对NR分子的构型影响较大,而与糖环上羟基结合形成氢键,则影响较小.
李强根薛英
关键词:构象稳定性密度泛函理论溶剂效应
hCD1d二聚体的制备及其在纯化过程的构象稳定性分析
CD1d是一种MHCI类分子类似物,与MHCI类分子主要提呈抗原肽不同,CD1d主要提呈脂类、糖脂类抗原给自然杀伤性T细胞(NKT)。作为NKT细胞的配体,CD1d多聚体为NKT细胞的相关研究提供了鉴定与功能调控的手段。...
吕燕霞
关键词:纤维蛋白D-二聚体构象稳定性
β2整合素Ⅰdomain构象稳定性的微观结构基础
<正>整合素分子是由α、β两亚基构成的异源二聚体细胞黏附分子,其中表达在白细胞表面的β2整合素家族成员LFA-1、Mac-1与αxβ2在炎症反应过程中参与介导白细胞在血管内皮细胞的滚动、黏附与爬行。该3种分子β亚基相同,...
张潇; 毛德斌; 吕守芹; 李宁; 章燕; 龙勉;
关键词:DOMAIN整合素微观结构
DSS1对蛋白质PCID2构象稳定性影响的分子动力学研究
2014年
PCID2和DSS1是TREX2复合体中的成分,DSS1作为子复合体之间的粘合剂在复合体中主要与PCID2结合.研究发现,DSS1在复合体中起稳定PCID2的作用.利用分子动力学模拟研究无序蛋白DSS1与PCID2的相互作用,结果表明:未结合DSS1的单体PCID2蛋白构象稳定,与DSS1结合后的PCID2蛋白构象明显变得更稳定,特别是与DSS1结合处的构象,与实验得出的结论一致.研究DSS1对PCID2的作用,不仅可以为了解PCI蛋白提供分子基础,也为深入了解TREX复合体在核酸输出中的功能提供帮助.
刘倩君扈国栋王吉华
关键词:分子动力学模拟构象变化
水团簇构象稳定性起源和本质的密度泛函理论与量子分子动力学研究(英文)被引量:3
2013年
寻找确定分子体系构象稳定性的关键因素是至关重要的,但即使对最简单的分子,其稳定性的起源和本质仍存在很大的争议.本文以水团簇为例,采用量子分子动力学产生185个八聚水分子团簇模型,并运用基于密度泛函理论的两个能量分解方法寻找其稳定性的决定因素.我们发现不同水团簇的稳定性与其立体排斥能和交换相关能成良好的线性关系.本文还采用双变量模型模拟水团簇的稳定性,取得了更好的结果(相关系数大于0.99).本工作对揭示包括水分子团簇在内的通过弱相互作用组成的分子络合物的稳定性起源和本质提供了有益启示.
王友娟赵东波荣春英刘述斌
关键词:水分子团簇量子分子动力学密度泛函理论

相关作者

王长生
作品数:93被引量:133H指数:7
供职机构:辽宁师范大学化学化工学院
研究主题:氢键 密度泛函理论 氢键复合物 取代基 氢键作用
王嘉
作品数:5被引量:9H指数:3
供职机构:辽宁师范大学化学化工学院
研究主题:构象稳定性 丙氨酸 B3LYP 二肽 氢键
丁建祖
作品数:91被引量:214H指数:8
供职机构:浙江省医学科学院
研究主题:日本血吸虫 抗体 金标免疫渗滤法 DIGFA 幽门螺杆菌
杨忠志
作品数:272被引量:348H指数:11
供职机构:辽宁师范大学化学化工学院
研究主题:ABEEM 电荷分布 ABEEM/MM ABEEMΣΠ/MM Π
楼涤
作品数:77被引量:124H指数:5
供职机构:浙江省医学科学院
研究主题:日本血吸虫 弓形虫 血吸虫 ELISA 血吸虫病