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江苏省2016-2023年A族链球菌耐药特征和全基因组多态性分析
2025年
目的研究2016-2023年江苏省A族链球菌耐药表型及全基因组特征。方法收集了2016-2023年江苏省149株A族链球菌,采用微量肉汤稀释法测定13种抗生素的最低抑菌波度值,采用emm分型和全基因组测序技术,获得GAS耐药基因的携带情况和进化关系。结果149株GAS对红霉素、四环素和克林霉素耐药率超过90%,对青霉素等8种抗生素敏感。且红霉素、四环素和克林霉素的耐药率呈逐年上升的趋势。所有菌株共分为9个emm型别,emm 12型占比最高(77/149,51.68%),不同emm型别在耐药率、耐药种数、耐药基因携带率等方面存在统计学差异。通过SNP进化树分析发现,GAS菌株根据emm分型被分为3个簇,分别是emm12型、emm1型和其他emm型。结论江苏省的GAS以emm12型和emm1型为主,对红霉素、四环素和克林霉素表现出较高的耐药率,且不同emm型别的菌株在表型和全基因组特征等方面存在差异。
洪捷黄昊頔许可谈忠鸣钱慧敏彭杰夫孔筱筱
关键词:A族链球菌全基因组序列
一种基于叶绿体基因组多态性片段制备的丁香属植物分类条形码及其应用
本发明公开了一种丁香属植物分类的条形码,涉及植物分子生物学技术领域,所述条形码以登录号为OL414766.1的二倍体红丁香叶绿体基因组序列第84‑581位和第29085‑29869位为参考序列,其信息如说明书表4‑表7所...
史宝胜周晓慧刘煜光姚瑞红
蜜蜂线粒体基因组多态性应用研究进展被引量:2
2024年
线粒体基因组(Mitochondrial genome)能够自我复制且遵循严格的母系遗传,是哺乳动物、昆虫等物种进化生物学、保护遗传学研究的重要分子标记之一。利用线粒体DNA作为遗传标记有助于探究蜜蜂群体遗传多样、母系起源及不同种群间的系统发育关系,相关研究主要集中于COI、COII、tRNA^(Leu)-COII、Cytb等单个线粒体基因序列片段,线粒体基因组全序列的应用较少。蜜蜂属现有9个种的线粒体基因组全序列测序工作均已完成,为蜜蜂遗传学研究提供了基础数据。本文综述了线粒体基因组在蜜蜂中的研究进展,阐述蜜蜂线粒体基因组结构特征及其在蜜蜂遗传多样、起源进化、分类鉴定等研究的应用进展,同时分析蜜蜂线粒体基因组的应用意义并展望其未来发展方向,以期为我国蜜蜂遗传资源保护与利用提供信息参考。
何金明徐凯杜亚丽蒋海宾牛庆生王志刘玉玲
关键词:蜜蜂线粒体基因组起源进化
LTR逆转座子对竹亚科基因组进化、DNA甲基化模式、毛竹群体基因组多态性的影响
长末端重复序列(Long terminal repeat,LTR)逆转座子是植物基因组中不可或缺的一部分。在多数情况下,LTR逆转座子处于沉默状态,但在逆境胁迫下会被激活并进行转座。然而,长期以来,由于缺乏高质量的竹亚科...
朱佰良
关键词:竹亚科毛竹基因组多态性
一种用于检测药物基因组多态性的引物、分子信标及应用
本发明公开了一种用于检测药物基因组多态性的引物、分子信标及应用。所述药物基因组包括PEAR1、PTGS1、GP1BA、ITGB3或LTC4S中的任意一种或至少两种的合;所述引物的核酸序列包括SEQ ID NO.1‑SE...
胡蓉晖何影章晟林灵楼敬伟黄亚茹王博伟何顺清
基于全基因组重测序对虹鳟(Oncorhynchus mykiss)“水科1号”基因组选择特征的研究及全基因组多态性简单序列重复(SSR)标记开发
马海兵
一种基于大黄叶绿体基因组多态性区域制备的条形码及其应用
本发明提供一叶绿体基因组多态性区域以及利用该多态性区域制备的DNA条形码,所述多态性区域可用于鉴别大黄种质资源,所述DNA条形码可用于植物种子批次防伪,通过本发明提供的技术方案,可实现为优质植物品种及其种子的双重防伪,...
魏胜利王晓晖满金辉刘凤波石玥张靖晗尹光耀
一种基于丹参叶绿体基因组多态性基因片段制备的条形码及其应用
本发明提供一丹参叶绿体基因组多态性基因片段以及利用该多态性基因片段制备的DNA条形码,所述多态性基因片段可用于鉴别丹参种质资源,所述DNA条形码可用于植物种子批次防伪,通过本发明提供的技术方案,可实现为优质丹参品种及其...
魏胜利王晓晖满金辉刘凤波石玥王馨刘珊瑚
一种全基因组多态性SSR分子标记的筛选方法
本发明涉及一种全基因组多态性SSR分子标记的筛选方法,包括:1)基于物种基因组挖掘潜在SSR标记;2)基于待选样本二代测序数据计算每个潜在SSR标记指标;3)随机挑取若干个潜在SSR标记并分别针对每个SSR标记设计引物;...
刘海平牟振波肖世俊
儿童猩红热A族链球菌emm基因型及基因组多态性分析
目的:明确导致猩红热A族链球菌(Group A Streptococcus,GAS)的流行型别,比较不同emm型别GAS基因结构及基因变异,阐明猩红热病原学的流行规律。研究方法:回顾临床研究。选择深圳市儿童医院生物样...
高外外
关键词:猩红热A族链球菌基因组多态性儿童

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刘文忠
作品数:230被引量:6,293H指数:39
供职机构:上海交通大学医学院附属仁济医院
研究主题:幽门螺杆菌 幽门螺杆菌感染 慢性胃炎 根除幽门螺杆菌 消化性溃疡
韩跃华
作品数:20被引量:43H指数:4
供职机构:浙江大学医学院附属第二医院
研究主题:幽门螺杆菌 幽门螺 基因组 基因组多态性 AGS
李斌
作品数:7被引量:5H指数:1
供职机构:河北农业大学
研究主题:引物设计 水利工程 SSR位点 基因组多态性 多态性
崔玉军
作品数:26被引量:112H指数:7
供职机构:军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室
研究主题:鼠疫耶尔森菌 中国鼠疫 鼠疫自然疫源地 基因组学 基因组
史耀舟
作品数:4被引量:7H指数:1
供职机构:国家工程研究中心
研究主题:幽门螺杆菌 基因组 DNA 基因组多态性 幽门螺