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搜索到94篇“ 前噬菌体“的相关文章

前噬菌体被引量：8: 2009年; 随着微生物基因组测序工作的广泛展开,前噬菌体在宿主菌基因组中普遍存在的事实已逐渐为人们所接受。相关研究工作的深入揭示前噬菌体并不只是细菌体内一个简单的寄生体,相反是细菌生理活动相当活跃的参与者,在宿主菌生命活动中发挥着重要的作用。对前噬菌体的深入了解将丰富人们对多种生命现象的认识。本文即是关于前噬菌体的分类、分布、鉴定、进化及其与宿主菌相互作用等知识点的一个简单综述。; 黎庶胡福泉; 关键词：前噬菌体相互作用

一种链球菌前噬菌体裂解酶lys1459及应用: 本发明公开了一种链球菌前噬菌体裂解酶lys1459及应用，属于链球菌相关疾病防治技术领域，裂解酶lys1459的氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示，该裂解酶的编码基因可以制备成重组载体或工程菌，为裂解酶lys1459...; 张兴林马俊飞牛建蕊李兴帅王培坤徐立楠杨祥朋

金黄色葡萄球菌前噬菌体内溶素的筛选及应用: 本发明公开了抗金黄色葡萄球菌的三种内溶素及其应用。本发明确定了金黄色葡萄球菌前噬菌体来源的内溶素L1、L2和L3。将三种内溶素基因分别无缝克隆到pSumo‑mut载体中，利用大肠杆菌BL21（DE3）原核表达内溶素L1、...; 倪伟胡圣伟胡瑞瑞马忠臣

铜绿假单胞菌前噬菌体的生物信息学分析: 2024年; 目的预测分析83株铜绿假单胞菌中前噬菌体携带情况和分布特征,以及鉴定前噬菌体编码的抗生素耐药基因和毒力因子。方法采用Phaster在线工具对菌株基因组序列进行前噬菌体预测,采用Cadr数据库和Vfdb数据库进行耐药基因和毒力基因注释分析。结果83株铜绿假单胞菌中共检测出601条前噬菌体序列,其中完整型304条,不完整型161条,可疑型136条,平均每株铜绿假单胞菌中至少存在3条完整的前噬菌体。平均每株铜绿假单胞菌中携带的所有前噬菌体占其基因组长度比例约为2%~4%。61条前噬菌体预测到125个耐药基因,分别来自23个不同家族,产生7种耐药机制。356条前噬菌体共编码545个毒力基因,归类为119种毒力基因,编码78种相关毒力因子,平均每个前噬菌体携带1~2个毒力因子编码基因,少数前噬菌体携带3条及以上。毒力因子的宿主来源除了铜绿假单胞菌外,百日咳杆菌、微黄分枝杆菌、鸟分枝杆菌及其亚种、肺炎克雷伯菌及其亚种也占有较高来源比例。结论前噬菌体在铜绿假单胞菌中分布广泛且携带多种耐药和毒力基因,对铜绿假单胞菌耐药性获得、传播和致病性演变具有重要影响。; 杨舒郭宸汐苏昊辰牛涵王楷翔王丽丽徐永平王珩谭德猛谢琼李晓宇; 关键词：铜绿假单胞菌前噬菌体基因组学耐药基因毒力基因

牛源肺炎克雷伯菌前噬菌体内溶素的表达与抗菌活性研究: 2024年; 【目的】预测并分析牛源肺炎克雷伯菌携带的前噬菌体以及其携带内溶素基因的情况,探究肺炎克雷伯菌前噬菌体内溶素的体外抗菌活性,为肺炎克雷伯菌感染提供新的治疗手段。【方法】以134株牛源肺炎克雷伯菌为研究对象,通过PhiSpy软件预测牛源肺炎克雷伯菌前噬菌体,并对前噬菌体进行功能注释鉴定得到内溶素。通过构建内溶素原核表达载体,对重组蛋白进行诱导表达与纯化,并验证其在体外对肺炎克雷伯菌NMG10、GS4和ATCC 13883的裂解活性。【结果】134株牛源肺炎克雷伯菌基因组的前噬菌体序列携带率为98.5%,共预测到414个前噬菌体序列,其中肺炎克雷伯菌噬菌体共112个,其余均为其他细菌的噬菌体或者噬菌体元件。每株牛源肺炎克雷伯菌所携带的全部前噬菌体占其基因组比例约为1.4%。112个肺炎克雷伯菌噬菌体的前噬菌中共有44个前噬菌体基因组中存在编码内溶素的基因,将其命名为LyKb。内溶素LyKb对肺炎克雷伯菌NMG10、GS4和ATCC 13883均具有裂解和抑菌活性,其中对肺炎克雷伯菌NMG10的裂解及抑菌活性最强,其次是肺炎克雷伯菌GS4、ATCC 13883。【结论】134株牛源肺炎克雷伯菌普遍携带前噬菌体,且部分前噬菌体基因组中含有编码内溶素的基因。肺炎克雷伯菌前噬菌体内溶素对多种肺炎克雷伯菌具有抗菌活性。; 刘初阳胡瑞瑞李福林崔超文胡圣伟; 关键词：肺炎克雷伯菌前噬菌体裂解

碳青霉烯耐药高黏液肺炎克雷伯菌K2-ST375中前噬菌体的诱导及环化结构分析: 2024年; 【目的】分析和研究临床碳青霉烯耐药高黏液肺炎克雷伯菌(Carbapenem-resistant hypermucoviscous Klebsiella pneumoniae,CR-HMKP)K2-ST375中前噬菌体的分布、可诱导前噬菌体的遗传结构及其编码基因特征,为深入研究CR-HMKP中前噬菌体的生物学功能奠定重要基础。【方法】利用Prophage Hunter预测CR-HMKP K2-ST375中前噬菌体的分布,使用丝裂霉素C对前噬菌体进行诱导并通过环化引物进行验证。综合运用RAST等生物信息学软件对可诱导前噬菌体Prophage-4进行基因注释并对其编码的内溶素理化性质、结构特征及遗传信息进行分析。【结果】Prophage Hunter预测结果表明,CR-HMKP K2-ST375染色体上携带Prophage-1-Prophage-4共4个前噬菌体。经丝裂霉素C诱导,Prophage-4可从宿主染色体上剪切下来形成环化结构。序列分析结果表明,Prophage-4与宿主染色体存在40 bp同源重复序列。基因注释结果表明,Prophage-4的编码基因主要参与噬菌体结构和组装、DNA复制和调控、溶源周期以及裂解等生物学功能。Prophage-4编码的内溶素与肠杆菌科噬菌体P21的内溶素蛋白具有相同的保守结构域;在遗传进化上,二者具有较近的亲缘关系。系统发育树分析结果显示,Prophage-4与克雷伯菌烈性噬菌体BUCT541位于同一进化分支,表明Prophage-4具有潜在的裂解能力。【结论】临床CR-HMKP K2-ST375中携带的Prophage-4经丝裂霉素C诱导,在40 bp同源重复序列介导下从宿主菌染色体上剪切下来形成环化结构;其编码的内溶素与噬菌体P21编码的内溶素蛋白密切相关。; 刘和兰陈泽慧李明哲周永雯黎瑞王勇祥; 关键词：前噬菌体

一种链球菌前噬菌体裂解酶lys1644及应用: 本发明公开了一种链球菌前噬菌体裂解酶lys1644及应用，属于链球菌相关疾病防治技术领域，裂解酶lys1644的氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示，该裂解酶的编码基因可以制备成重组载体或工程菌，为裂解酶lys1644...; 牛建蕊张兴林马俊飞李兴帅于鲁敏赵玉仲杨祥朋

一种链球菌前噬菌体裂解酶lys733及其应用: 本发明公开了一种链球菌前噬菌体裂解酶lys733及其应用。属于生物工程技术领域。本发明从乳房链球菌HB‑4基因组中克隆得到链球菌前噬菌体裂解酶lys733，采用原核表达方式，诱导表达出可溶的裂解酶。链球菌前噬菌体裂解酶l...; 张兴林李兴帅马俊飞牛建蕊徐立楠赵玉仲杨祥朋

A族链球菌基因组数据库建设及前噬菌体分布分析: 2024年; 目的通过对已报道的A族链球菌(GAS)全基因组数据进行梳理和生物信息学分析, 从基因组大数据中提取前噬菌体信息, 并对其在基因组中的存在状态及部分前噬菌体的基因组成进行分析, 了解GAS种群内前噬菌体分布特点。方法回顾性研究。收集下载GenBank数据库中截至2020年5月发布的GAS基因组组装序列, 整理菌株重要背景信息建立本地化基因组数据库。利用生物信息学软件构建GAS全基因组系统发生树, 进行核心基因组分析, 并对基因组中潜在的前噬菌体及其完整性进行预测, 获得前噬菌体分布特征。统计数据库中基因型种类、核心基因数量及前噬菌体的数量、长度和携带率。结果建立了包含2 529株GAS基因组序列的数据库, 涵盖140种血清型(emm基因型)。分离地点主要包括东亚、欧洲、美洲、大洋洲19个国家和地区。分离菌株疾病背景主要分为侵袭性感染、非侵袭性感染和免疫继发症3类;共鉴定出1 005个核心基因, 这些基因在95%以上菌株中均存在;对其中1 798条序列分析发现, 有1 366条序列存在1个或以上完整的前噬菌体, 携带率为76.0%。每株菌携带完整前噬菌体的数量范围为0~6个, 长度范围为32.8~62.6 kb, 主要分布在30~40 kb。中国菌株近些年优势克隆中存在的前噬菌体主要为phiHKUssa、phiHKUvir和phiHKU488, 主要携带speC、spd1和ssa 3种毒力基因。结论前噬菌体在GAS基因组中分布广泛, 可能在其种群优势克隆演变和扩张过程中发挥重要作用, 进而重塑特定emm基因型内部种群结构。GAS基因组数据库的建立为GAS病原监测提供了重要数据支撑。; 孟凡亮向才鑫张建中尤元海; 关键词：基因组 A族链球菌种群结构噬菌体

鲎素对产气荚膜梭菌前噬菌体的激活及其与噬菌体的联合作用: 产气荚膜梭菌(Clostridium perfringens,Cp)是一种厌氧的革兰阳性条件致病菌,广泛分布于土壤、食物、粪便及人畜肠道中。根据产气荚膜梭菌产生毒素的不同可分为七种类型(A-G),在临床上可引起多种动物的...; 李梦娇; 关键词：产气荚膜梭菌噬菌体

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