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自主运动对小鼠海马分子 表达 特征影响:基于GEO数据库基因表达 谱分析 2025年 背景:海马体对认知功能至关重要,运动有望提升认知并缓解认知衰退,然而其分子 机制尚不明了。生物信息学通过分析运动对海马体分子 表达 的影响,从而揭示关键机制,为理解运动如何促进认知及制定干预策略提供新的视角。目的:采用生物信息学方法深入分析自主运动干预对小鼠海马组织基因表达 谱的影响,通过研究差异表达 基因的生物学功能及其潜在的调控网络,揭示运动对海马体神经功能调控的分子 机制。方法:通过美国国立生物技术信息中心NCBI创建并维护的基因表达 综合数据库(GEO)获取自主运动干预小鼠海马组织的基因表达 微阵列数据集(GSE42904和GSE29075),随后采用R语言中的Limma和DESeq2包进行严格的差异基因分析,并借助ggplot2包绘制火山图直观展示分析结果;通过FunRich软件识别共同的差异表达 基因;利用R语言中的clusterProfiler包进行基因本体论和京都基因与基因组百科全书通路富集分析;通过在线分析工具STRING对差异表达 基因进行蛋白-蛋白相互作用网络分析;应用Cytoscape软件进一步筛选核心靶点。结果与结论:(1)在GSE42904数据集中,自主运动干预导致小鼠海马体123个基因存在差异,它们主要参与节律过程、糖基化等基因本体论生物过程,并涉白细胞介素17、钙、乙醇等多条京都基因与基因组百科全书信号通路,蛋白-蛋白相互作用网络确定的关键枢纽基因包括Npy、Mapk3、Mapk11和Chgb等;(2)GSE29075数据集中,自主运动引起小鼠海马455个差异基因表达 ,它们主要参与细胞投射组织的正调控、凋亡负调控信号等基因本体论生物过程,并在神经退行性疾病相关通路显著富集,蛋白-蛋白相互作用网络确定的关键枢纽基因包括Eed、Bptf和Nedd8等;(3)提示自主运动可以显著调节小鼠海马中Chrm1、Eed、Npy、Mapk3、Mapk11和Map2k1等关键基因表达 ,这些基因可能在神经退行性疾病、钙� 叶星 刘仁仪关键词:小鼠 差异表达基因 信号通路 生物信息学 单核细胞和淋巴细胞CD45分子 表达 相对变化在诊断感染和炎症中的应用 本发明公开了单核细胞和淋巴细胞CD45分子 表达 相对变化在诊断感染和炎症中的应用,本发明首次创造性地发现单核细胞和淋巴细胞CD45分子 表达 相对变化这一指标能够用于快速准确判断患者是否伴有感染,以及有效区分是病毒感染还是细菌... 马义磊 柳慧星 王小粉 张钧舒意宁肠汤对IBS-D大鼠CRF-Mast cell相关分子 表达 的影响 2025年 目的 观察舒意宁肠汤对腹泻型肠易激综合征(IBS-D)大鼠内脏敏感性、粪便含水率、焦虑抑郁样行为和CRF-Mast cell相关分子 表达 的影响。方法 采用母子分离+乙酸灌肠+夹尾束缚应激法建立IBS-D大鼠模型,将大鼠分为正常组、模型组、匹维溴铵组、舒意宁肠汤低剂量组(6.825 g/kg)、舒意宁肠汤中剂量组(13.65 g/kg)、舒意宁肠汤高剂量组(27.3 g/kg),灌胃2周。观察大鼠一般情况、粪便含水率、腹壁撤退反射实验、糖水偏嗜实验、旷场实验,并进行药效学评价。采用Western blotting检测大鼠下丘脑组织促肾上腺皮质激素释放因子(CRF)、促肾上腺皮质激素释放因子受体1(CRFR1)、促肾上腺皮质激素释放因子受体2(CRFR2)表达 情况和结肠CRFR1、CRFR2表达 ,对结肠组织进行HE染色观察病理改变、甲苯胺蓝染色观察肥大细胞数目,免疫组化法检测大鼠结肠组织肥大细胞类胰蛋白酶。结果 与模型组相比,舒意宁肠汤各剂量组内脏敏感性降低、粪便含水率降低、焦虑抑郁样行为改善(P <0.001);下丘脑组织CRF、CRFR1和结肠组织CRFR1表达 降低,下丘脑组织和结肠组织CRFR2表达 升高(P <0.001);肥大细胞数量减少、肥大细胞类胰蛋白酶平均光密度降低(P <0.05)。结论 舒意宁肠汤可以降低IBS-D大鼠的内脏敏感性、粪便含水率,改善焦虑、抑郁样行为。舒意宁肠汤可能是通过降低下丘脑CRF的释放、抑制结肠肥大细胞的激活发挥作用。 段敏 邱红 何毓玺 秦百君 郭雅婧 何圆君 吴鑫 刘女萍 任超 杨小军关键词:促肾上腺皮质激素释放因子 肥大细胞 基于分子 表达 预测进行细胞检测和分析的两阶段图像生成学习方法 本发明涉及一种基于分子 表达 预测进行细胞检测和分析的两阶段图像生成学习方法,包括:获取H&E数据集和配对的mIHC数据集组成数据集并进行预处理;构建细胞分割模型并训练;获得细胞二值分割结果进行可视化展示;构建分子 表... 邵立智 荀天旺 陈鹏 尚文婷 王立俊共同性外斜视中眼外肌分子 表达 与病理组织形态变化的研究 2025年 斜视是指各种原因引起的眼外肌肌力失衡,视轴偏斜的一种眼科常见疾病。共同性外斜视是斜视的主要类型,疾病的形成被认为与遗传、眼调节功能异常、双眼解剖异常等因素有关。患者通常需要接受手术治疗,以使双眼视轴保持平行,促进立体视功能的恢复与建立。目前共同性外斜视的发病机制尚未有明确的病因学研究。文章对近年来共同性外斜视眼外肌中异常分子 表达 和病理学形态变化的研究情况做一总结,从分子 及病理层面对共同性外斜视形成的病因进行分析,以期为疾病预防与临床治疗提供理论基础。文章围绕电镜下病理组织学变化,重链蛋白、卫星细胞、钙黏蛋白、生长因子等对眼外肌蛋白表达 的影响进行讨论。 周小瑞 王志斌 底煜关键词:共同性外斜视 蛋白表达 视觉功能 体外培养人胸腺组织切片残余细胞类型、分子 表达 谱与质量评估的研究 2025年 目的拟通过单细胞转录组测序技术(single-cell RNA sequencing,scRNA-seq)解析移植前体外培养人胸腺组织切片的残余细胞类型和功能,并利用培养上清液分子 标志物的水平特征建立胸腺组织切片质量评估方法。方法收集2023年5月至2024年1月在重庆医科大学附属儿童医院心胸外科接受心脏外科手术的18例先天心脏病患者废弃的胸腺制备成胸腺组织切片。体外培养14 d后,通过scRNA-seq鉴定残余的细胞类型,联合基因本体论(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析残余细胞的功能,并查阅胸腺组织切片培养的相关文献筛选出指示胸腺细胞功能的分子 标志物。采用ELISA检测上清液分子 标志物的蛋白水平变化,绘制受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve,ROC),以曲线下面积(area under the curve,AUC)判定上清液分子 标志物对胸腺组织切片质量的评估价值。将分子 标志物判定为质量检测合格与质量检测不合格的胸腺组织切片移植至6~8周龄Balb/c-nude雄性小鼠(体质量14~17 g)皮下(对照组不移植胸腺组织切片),通过流式细胞术和组织学检测分析移植后免疫重建效果。结果(1)scRNA-seq数据显示,胸腺组织切片中含有11种细胞,主要细胞为上皮细胞、成纤维细胞和T细胞。GO和KEGG富集分析显示,上皮细胞与趋化作用、上皮细胞发育、细胞基质粘附、紧密连接等条目相关;成纤维细胞主要与细胞外基质组织、上皮细胞增殖、负向调控细胞迁移、肌动蛋白细胞骨架调节等条目相关;T细胞主要与T细胞分化、T细胞活化的调控、T细胞凋亡、T细胞受体信号等条目相关。(2)筛选出CCL19、CCL21、CXCL12、CXCL16、IL16、SELL作为指示胸腺细胞功能的分子 标志物,与第1天相比,CCL19、CCL21、CXCL12和CXCL16蛋白分泌量伴随体外培养显著增加(P<0.05),IL16和L-selectin(SELL表达 分� 关万青 罗贵华 撖菁萱 向群 安云飞 赵录 糜建红 冯泽清 吴玉章关键词:分子标志物 化瘀散水煎剂对肝癌Wnt/β-catenin信号通路相关信号分子 表达 的影响 2025年 目的研究化瘀散水煎剂对肝癌Wnt/β-连环蛋白(catenin)信号通路相关信号分子 表达 的影响。方法通过裸鼠移植瘤成瘤实验建立小鼠肝癌细胞系(HepG2)移植性裸鼠肝癌模型,随机分为对照组,模型组,化瘀散水煎剂高、中、低剂量组,连续给药4 w。制备含药血清,分为对照组、化瘀散水煎剂高、中、低剂量组。检测各组含药血清对HepG2细胞增殖、侵袭和迁移能力、凋亡及对β-catenin、T-Box转录因子(Tbx3)和结肠腺瘤性息肉病蛋白(APC)表达 量的影响。检测成瘤小鼠血清肿瘤标志物甲胎蛋白(AFP)和恶性肿瘤相关物质群(TSGF)水平。取出成瘤小鼠瘤块,称量实体瘤质量,计算抑瘤率。并检测Wnt/β-catenin信号通路相关信号分子 β-catenin、Tbx3和APC表达 情况。结果成功建立小鼠HepG2移植性裸鼠肝癌模型。体外实验表明化瘀散水煎剂的含药血清可以显著抑制HepG2细胞的增殖、侵袭、迁移能力(P<0.01),同时也可以诱导HepG2细胞凋亡。与对照组相比,化瘀散水煎剂组Wnt/β-catenin信号通路相关信号分子 β-catenin和Tbx3表达 量随着药物剂量增加显著降低,而APC表达 量随着药物剂量增加显著升高(P<0.01)。体内实验表明成瘤小鼠血清肿瘤标志物AFP和TSGF水平随着药物剂量增加显著降低(P<0.01)。化瘀散水煎剂具有显著抑瘤率(P<0.01),并随着药物剂量增加而升高。与模型组相比,化瘀散水煎剂组Wnt/β-catenin信号通路相关信号分子 β-catenin和Tbx3表达 量随着药物剂量增加显著降低,而APC表达 量随着药物剂量增加显著升高(P<0.01)。结论化瘀散水煎剂可以降低血清肿瘤标志物AFP和TSGF表达 水平,抑制肝癌细胞生学学行为,并促进细胞凋亡。这种抑癌作用与化瘀散调节Wnt/β-catenin信号通路相关信号分子 β-catenin、Tbx3和APC有关。 许丹 郑超 黄超群 余首德 常城关键词:化瘀散 WNT/Β-CATENIN信号通路 肝癌 癫痫发作期神经胶质细胞炎性反应情况及与Wnt3a信号分子 表达 的关系 2025年 目的探究癫痫发作期神经胶质细胞的炎性反应及与髓系细胞触发受体2(TREM2)和Wnt3a表达 的关系。方法利用腹腔注射氯化锂-匹鲁卡品成功制备SD大鼠癫痫模型(Se1d、Se2d、Se3d、Se7d和Se14组)和建立体外Astrocytes/Microglia细胞共培养体系。应用免疫荧光染色测定TREM2和Wnt3a的阳性表达 情况。应用Western blot蛋白分析法测定TREM2和Wnt3a的表达 量变化情况。结果蛋白电泳结果显示,在癫痫发作的较早期,与Con组(注射相同剂量的生理盐水)相比,GFAP(Se1d、Se2d和Se3d组)和IBA1(Se1d和Se2d组)蛋白表达 量上调(P均<0.05);免疫荧光结果显示,TREM2只在小胶质细胞的细胞膜上表达 ,Wnt3a在星形胶质细胞和小胶质细胞的细胞核上均有表达 ,且癫痫发作后TREM2和Wnt3a阳性细胞数明显增加;蛋白电泳结果显示,与Con组相比,癫痫各组TREM2的蛋白表达 量上调(P均<0.01);与Con组相比,癫痫各组Wnt3a的蛋白表达 量增加(P<0.001)。结论SD大鼠癫痫发作后诱发神经炎性反应,神经胶质细胞活化,小胶质细胞TREM2被二次激活,Wnt3a信号可能参与癫痫神经炎性的调控。 蔡海燕 闫雨 李艳茹 谷新梅 丁银秀关键词:癫痫发作 手术标本中生物活性分子 表达 对结直肠癌腹腔镜术后早期复发转移的预警价值 2025年 目的探讨联合检测手术标本中磷酸甘油酸变位酶1(PGAM1)、微小核糖核酸-433-3p(miR-433-3p)、细胞周期蛋白依赖性激酶1(CDK1)表达 对结直肠癌(CRC)腹腔镜术后早期复发转移的预警价值。方法回顾性分析120例CRC腹腔镜手术患者的临床资料,根据术后1年复发转移发生情况分为发生组31例和未发生组89例。比较2组临床资料及手术标本中PGAM1、miR-433-3p、CDK1表达 ;采用Logistic回归分析探讨PGAM1、miR-433-3p、CDK1对CRC腹腔镜术后复发转移的影响;采用受试者工作特征(ROC)曲线分析PGAM1、miR-433-3p、CDK1单独及联合预测腹腔镜术后复发转移的价值,并进行外部验证。结果发生组PGAM1 mRNA、CDK1 mRNA水平高于未发生组,miR-433-3p水平低于未发生组,差异有统计学意义(P<0.05)。Logistic回归分析显示,PGAM1 mRNA(OR=1.387,95%CI:1.025~1.877)、miR-433-3p(OR=0.543,95%CI:0.319~0.924)、CDK1 mRNA(OR=1.353,95%CI:1.108~1.651)均是CRC腹腔镜术后复发转移的独立影响因素(P<0.05)。ROC曲线分析显示,PGAM1 mRNA、miR-433-3p、CDK1 mRNA联合预测CRC腹腔镜术后复发转移的曲线下面积(AUC)为0.904(95%CI:0.836~0.950),优于各指标单独预测效能。个体值预测结果显示,诊断准确率为84.17%的条件下,CRC患者在腹腔镜术后会发生早期复发转移;外部验证显示,联合预测结果与临床实际结果的Kappa值为0.864(95%CI:0.611~0.984),一致性较好。结论手术标本中PGAM1、miR-433-3p、CDK1表达 均是CRC患者腹腔镜术后早期复发转移的独立影响因素,联合检测对术后复发转移具有较高预测价值。 郭俊宇 廖驰林 郭厚基关键词:结直肠癌 复发 桥本甲状腺炎患者ILC2相关分子 表达 情况及其与血清ATG和ATPO水平的相关性 2025年 目的分析桥本甲状腺炎(HT)患者2型固有淋巴细胞(ILC2)相关分子 表达 情况及其与血清甲状腺球蛋白抗体(ATG)和甲状腺过氧化物酶抗体(ATPO)水平的相关性。方法回顾性纳入接受甲状腺检查患者120例,根据病理结果,将60例单纯甲状腺肿(NTG)患者纳入NTG组,将60例HT患者纳入HT组,并将同期健康体检者60例纳入对照组。对比三组患者ILC2相关分子 及ATG、ATPO水平,并采用Spearman相关性分析HT患者ILC2相关分子 表达 与ATG、ATPO水平的相关性。结果三组白细胞介素-25(IL-25)、白细胞介素-33(IL-33)、胸腺基质淋巴细胞生成素(TSLP)、白细胞介素-13(IL-13)、白细胞介素1受体样蛋白2(ST2)、ATG、ATPO水平对比,差异有统计学意义(P<0.05);HT组IL-25、IL-33、TSLP、ST2、IL-13、ATG、ATPO高于NTG组和对照组各项指标,差异有统计学意义(P<0.05);NTG组与对照组各项指标对比,差异无统计学意义(P>0.05);经Spearman相关分析结果显示,HT患者ILC2相关分子 IL-25、IL-33、TSLP、ST2、IL-13水平与血清ATG和ATPO表达 呈显著正相关(P<0.05)。结论HT患者ILC2相关分子 表达 的异常与其血清ATG、ATPO水平呈显著正相关,有助于进一步理解HT的免疫机制,为疾病的早期诊断及治疗提供新思路。 陈德花关键词:桥本甲状腺炎 甲状腺球蛋白抗体 甲状腺过氧化物酶抗体
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