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云南大理白族聚集区居民贾第虫分子 流行病学 调查 2025年 学 意义(P=0.938、0.380、0.327、0.113)。序列对比显示有B型和E型2种贾第虫基因型。结论:云南省大理地区白族聚集区居民贾第虫感染率较低,基因型包括B型和E型。关键词：贾第虫 分子流行病学 2022~2023年福建省三明地区A型轮状病 毒分子 流行病学 调查 分析 2025年 病 毒的流行 情况及分子 特征,对2022~2023年福建省三明地区55家规模化猪场的4 356份粪便样品进行检测,用荧光定量PCR的方法调查 RVA流行 率,并对RVA阳性样本进行VP7基因扩增、测序使用Meg Align软件进行同源性分析,利用MEGA11.0构建系统进化树。关键词：流行病学 江苏省、山东省和安徽省禽致病 性大肠杆菌的分子 流行病学 调查 2025年 病 性大肠杆菌(APEC)的分子 流行病学 特征,本试验于2023年从三省部分规模化鸡养殖场采集鸡粪便、鸡毛蛋、鸡卵黄以及病 死鸡的鸡腿、骨髓、关节、心脏、脾脏、肺脏和肠道内容物样品共918份,使用选择性培养基分离APEC;利用微量肉汤稀释法测定分离菌株对常用抗菌药物的敏感性;基于全基因组测序分析分离菌株的耐药基因和毒力基因携带情况;通过多位点序列分型(MLST分型)、菌体(O)抗原分型和系统发育树分析分离菌株的主要流行 特征。结果显示,共分离获得390株APEC,分离率为42.48%;分离菌株对氨苄西林(91.03%,355/390)、头孢噻呋(82.82%,323/390)、庆大霉素(81.03%,316/390)和四环素(77.95%,304/390)的耐药率较高,对美罗培南(0.51%,2/390)和黏菌素(3.08%,12/390)比较敏感,耐药基因以blaEC(98.97%,386/390)、blaTEM(80.00%,312/390)、aph(6)-Id(54.10%,211/390)、erm(D)(98.46%,384/390)、tet(A)(81.79%,319/390)和floR(63.33%,247/390)为主;毒力基因分析发现,所有分离菌株至少含有4种毒力基因。共鉴定出68种血清型,其中优势血清型为O78(11.03%,43/390)、O180(7.95%,31/390)和O15(7.18%,28/390),MLST共鉴定出71种ST型,主要的ST型为ST117(15.90%,62/390)、ST155(8.46%,33/390)和ST162(8.21%,32/390);系统发育树结果显示,分离菌株共分为4个进化分支,不同省份鸡养殖场分离菌株之间的遗传进化关系相距较远。结果表明,江苏省、山东省和安徽省鸡源APEC的流行 血清型为O78、O180和O15,主要流行 ST型为ST117,携带的耐药基因和毒力基因较多,鸡养殖场应当继续加强APEC的流行病学 监测。关键词：耐药基因 毒力基因 血清型 流行病学调查 耐药肺结核合并咽炎患者多重耐药α-溶血性链球菌分子 流行病学 调查 及风险模型构建 2025年 分子 流行病学 调查 并构建风险模型。方法选择2019年3月-2022年1月在我院接受治疗的耐药肺结核合并咽炎患者150例为研究对象。采用PhoenixTM-100全自动细菌检测分析系统进行药敏试验。依据脉冲场凝胶电泳(Pulsed field gel electrophoresis,PFGE)和多点位序列分析(Multilocus sequence type,MLST)技术对其中92例多重耐药草绿色链球菌(Viridans Group Streptococcus,VGS)感染患者进行分子 流行病学 调查 。根据是否发生多重耐药感染将患者分为感染组(n=92)和非感染组(n=58),多因素Logistic分析多重耐药VGS感染的独立影响因素并构建简易评分模型划分感染风险等级并进行验证。结果药敏结果显示,VGS对亚胺培南、厄他培南的敏感性高,敏感率为100%;PFGE分型和MLST分型结果显示,92株多重耐药VGS菌株可分为5种PFGE克隆型和15种ST型;多因素Logistic分析结果表明,年龄、呕吐、腹泻、降钙素原、中性粒细胞、白细胞是导致耐药肺结核合并咽炎患者感染多重耐药VGS菌株的独立危险因素(P<0.05);年龄、白细胞、中性粒细胞和降钙素原与多重耐药VGS感染风险关联密切;简易评分模型结果显示其预测效能较好。结论年龄、降钙素原、中性粒细胞、白细胞是感染多重耐药VGS菌株关联最大的独立危险因素,为临床筛查和预防有多重耐药VGS感染风险的耐药肺结核合并咽炎患者提供了理论基础。关键词：耐药肺结核 咽炎 河北地区羊泰勒虫的分子 流行病学 调查 2025年 流行 性,并分析饲养草场环境及羊携带的蜱虫对羊泰勒虫感染的影响,本研究基于羊泰勒虫18S rRNA基因,采用套式PCR法对河北省7个地级市的羊群采集的626份血液样品感染虫种进行种类鉴别;选取4份代表性泰勒虫阳性样品进行18S rRNA基因序列的同源性分析,构建系统进化树分析其遗传进化特征。结果显示,我国河北省羊群泰勒虫感染率为38.8%(243/626),其中张家口地区羊泰勒虫感染率最高,为56%(56/100),显著高于其他地区(P<0.05);感染羊泰勒虫的虫种主要为吕氏泰勒虫,未检测到尤氏泰勒虫和绵羊泰勒虫。基因序列同源性分析和遗传进化树分析结果显示,该虫株与GenBank中登录的羊泰勒虫18S rRNA基因序列的同源性达100%,且该吕氏泰勒虫可能来自北京和浙江,呈地区性聚集。对不同地区及不同月份羊泰勒虫感染情况调查 分析结果显示,8月羊泰勒虫感染率最高,显著高于其他月份(P<0.05),这可能与夏季高温高湿的气候条件有利于蜱虫活动和繁殖有关。上述结果表明,河北省存在羊泰勒虫感染,且张家口地区尤为严重,建议各地区应在夏季,特别是8月份加强对羊泰勒虫感染的重点防控,改善饲养草场环境,减少蜱虫滋生,以降低羊群感染风险。本研究揭示了河北地区羊泰勒虫感染现状及流行 株的遗传变异特征,提示蜱虫作为传播媒介在羊泰勒虫感染中发挥重要作用,为该羊泰勒虫病 的区域防控提供基础数据和科学 参考依据。关键词：泰勒虫 遗传进化分析 BALB/c小鼠肠道主要原虫感染情况的分子 流行病学 调查 2025年 学 依据。兰州地区献血者人细小病 毒B19分子 流行病学 调查 2025年 病 毒B19(human parvovirus B19,简称B19)的分子 流行 率和基因型,为监测本地献血人群的B19 DNA阳性率提供数据支持。方法运用实时荧光PCR技术随机批次筛查2022年1—9月献血者标本7644份,筛查B19 DNA阳性标本23份,采用SPSS 22.0对B19 DNA阳性献血者从性别、年龄、献血动员方式、献血次数等特征进行分析,将B19 DNA反应性标本的VP1基因片段进行测序,并运用N-J法构建进化树。结果兰州地区献血者B19 DNA阳性率为0.30%,以女性、18~30岁、个人献血、初次献血为阳性人群特征,其基因型为基因亚型1a。结论兰州地区献血者B19 DNA阳性率较低,以基因亚型1a为主。建议不定期监测献血人群B19流行 率,加强监控,提升血液质量和安全水平。关键词：人细小病毒B19 献血者 基因型 青海部分地区藏羊感染人兽共患无浆体的分子 流行病学 调查 2025年 病 的防控提供科学 依据,本研究在青海门源、海晏、天峻、刚察和贵南5个地区共采集204份藏羊血液样本,提取基因组DNA,采用巢氏PCR方法检测藏羊血液样本中蜱传无浆体的感染情况。利用DNASP v.6、PopArt和MEGA 7.0软件进行无浆体病 原单倍型分析和系统发育树构建,以确定该地区藏羊感染无浆体的遗传进化特征。结果表明:(1)上述5个地区藏羊血液无浆体的平均感染率为38.24%(78/204),其中绵羊无浆体的感染率为29.41%(60/204),牛无浆体的感染率为8.33%(17/204),山羊无浆体的感染率为0.49%(1/204)。(2)根据单倍型和核苷酸多态性分析可知,绵羊无浆体的19个单倍型以Hap1为主,占比为40.00%(24/60),Hap2占比为31.67%(19/60),其他17个单倍型(Hap3~Hap19)均各占1.67%(1/60);而牛无浆体的6个单倍型以Hap2为主(7/17),Hap1占比为23.53%(4/17),Hap3和Hap6各为2个(2/17),Hap4和Hap5各为1个(1/17)。(3)系统发育树表明,青海部分地区藏羊携带的绵羊无浆体、牛无浆体和山羊无浆体分别均与不同宿主的绵羊无浆体、牛无浆体和山羊无浆体处于一支。青海部分地区藏羊感染的无浆体病 原在不同地区的感染率各有差异,且其病 原呈现多样性特征。关键词：藏羊 感染率 单倍型 遗传进化 2020-2023年福建省猪繁殖与呼吸综合征病 毒分子 流行病学 调查 及ORF5基因变异分析 2025年 病 毒(PRRSV)的流行 和变异规律,采用荧光定量RT-PCR方法,对福建不同地区收集的240份疑似PRRSV的组织样品和血清进行PRRSV-1和PRRSV-2检测,对阳性样品采用RT-PCR方法扩增PRRSV ORF5基因,应用分子 生物学 软件进行同源性和遗传变异分析。结果显示,福建省PRRSV总体阳性率为18.8%(45/240),其中PRRSV-2的阳性率为16.3%(39/240),PRRSV-1的阳性率为2.5%(6/240)。经RT-PCR成功扩增35个PRRSV-2 ORF5基因和3个PRRSV-1 ORF5基因。序列比对分析表明,35个PRRSV-2 ORF5基因核苷酸同源性为81.3%~99.8%,与代表毒株VR2332、NADC30、NADC34、QYYZ和JXA1的核苷酸同源性为80.9%~99.3%。3个PRRSV-1 ORF5基因核苷酸同源性为82.8%~98.5%,与代表毒株LV、Amervac PRRS、FJQEU14、FJEU13等的核苷酸序列同源性为81.5%~99.7%。遗传进化分析表明,福建省PRRSV-2可分为Lineage1、Lineage3和Lineage8,其中Lineage1占比最高,为68.6%(24/35,18株为NADC30-like毒株,6株为NADC34-like毒株),PRRSV-1均属于SubtypeⅠ。氨基酸分析表明,PRRSV-1 GP5蛋白氨基酸变异主要集中于信号肽区域(aa 1-33)和2个胞外域(aa 33-67和aa 89-109);PRRSV-2 GP5蛋白氨基酸变异主要集中于信号肽区域(aa 1-25)、aa 27-36区域和抗原表位C(aa 52-62)。综上表明,PRRSV-1和PRRSV-2同时在福建省流行 ,NADC30-like PRRSV-2为优势流行 毒株且呈现遗传多样性,NADC34-like PRRSV-2和PRRSV-1可能已在福建省潜在流行 。关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒 ORF5基因 遗传进化分析 2021-2022年我国部分地区猪轮状病 毒分子 流行病学 调查 被引量：5 2024年 病 毒(porcine rotavirus, PoRV)的流行 情况及分子 特征,对2021-2022年我国部分省份的86个规模化猪场的6 472份腹泻样品进行检测,用RT-PCR方法调查 PoRV的流行 率,并对PoRV阳性样本进行VP7和VP4基因扩增、测序,使用MegAlign软件进行同源性分析,利用MEGA11.0构建系统进化树。结果显示,PoRV的样品阳性率为27.89%(1 805/6 472),猪场阳性率为65.12%(56/86);从98份阳性PoRV样本中扩增出76个VP7片段,G9为优势基因型(42.11%),基因型G5、G26、G3、G4、G1、G2和G11各占26.32%、9.21%、6.58%、6.58%、3.95%、2.63%和2.63%。扩增出的35个VP4基因片段,以P[13]型为主,占57.14%;其次为P[7]、P[23]、P[3]和P[6]型,分别占20%、14.29%、5.71%和2.86%。35个毒株成功鉴定出G/P基因型,G9P[13](28.57%)为优势组合基因型,其他基因型为G5P[13](11.43%)、G4P[13](8.57%)、G9P[23](8.57%)、 G26P[13](5.71%)、G1P[7](5.71%)、G26P[3](5.71%)、G5P[7](5.71%)、G3P[7](2.86%)、G11P[23](2.86%)、G5P[23](2.86%)、G11P[7](2.86%)、G3P[13](2.86%)、G5P[6](2.86%)和G4P[7](2.86%),其中G11P[7]为国内首次鉴定到的基因型。综上,目前PoRV的流行 率高且基因型复杂,优势组合基因型为G9P[13]。该结果丰富了PoRV的分子 流行病学 资料,对我国猪PoRV感染的防控具有重要意义,也为新型疫苗研发提供了参考依据。关键词：猪轮状病毒 VP4基因 VP7基因 分子流行病学
