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搜索到25295篇“ 全基因“的相关文章

绵羊全基因组分子探针组合、基因芯片及其应用: 本发明涉及动物分子育种技术领域，具体涉及绵羊全基因组分子探针组合、基因芯片及其应用。本发明提供的SNP分子标记组合、分子探针组合和基因芯片同时覆盖了具有代表性的中国绵羊品种和其他国家绵羊品种；与已有绵羊全基因组芯片相比，...; 赵倩君黄畅马月辉陈倩浦亚斌张嘉良

银杏全基因组SNP位点组合、液相芯片及应用: 本发明公开了一种银杏全基因组SNP位点组合、液相芯片及应用，属于基因组学技术领域，所述银杏全基因组SNP位点组合包括45776个SNP位点，45776个SNP位点的物理位置是基于银杏male_Ginkgo_v3参考基因组...; 赵云鹏茹雅璐范欣怡

一种检测SARS-CoV-2病毒全基因组的方法: 本申请提供一种基于纳米孔测序检测SARS‑CoV‑2病毒全基因组的方法，方法中使用的引物组合和包含所述引物组合的试剂盒。本发明提供的方法在引物设计上使用的引物数少，大大节约了成本，经济可靠，利用多重PCR具有高通量和低成...; 纪小敏太欣李东旭

唾液乳杆菌的分离鉴定及其全基因组分析: 2025年; 旨在更好地研究贵州威宁黄牛源唾液乳杆菌的特征和益生特性,开发益生菌产品。采用传统微生物学方法,对该菌株的生物学特性和益生性能进行深入分析后,通过纳米孔测序技术完成了对其全基因组测序和比较基因组分析。结果:分离得到5株唾液乳杆菌(T1~T5),与OR430873.1的同源性高达99.86%~100%;T1~T5菌株均有良好的耐酸和耐胆盐能力,T4株对大肠杆菌和沙门菌有良好的抑制效果;T4株的基因组序列总长度为1918675 bp,GC含量为33.01%;唾液乳杆菌基因组中预测到1861个编码基因,22个rRNA操纵子和79个tRNA;通过基因本体论(GO)、直系同源簇(COG)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)数据库对编码基因进行对比分析,发现参与细胞翻译、核糖体结构、生物合成、新陈代谢和细胞过程的基因数较多。结论:获得了有良好耐酸和耐胆盐能力的唾液乳杆菌,具有良好的抗菌效果,有望进一步开发为益生菌产品。; 吴道义马金萍王明进姬亚茹王霞曾继晶周礼扬罗耀李坤; 关键词：全基因组测序

一种线粒体全基因组基因型检测方法及其应用: 本发明提供了一种基于多重PCR扩增测序的线粒体全基因组基因型检测方法及其应用。具体的，包括：构建参考序列集，该参考序列集包括进行了延伸处理的线粒体基因组参考序列以及核线粒体序列；将测序结果与该参考序列集进行比对，根据比对...; 黄飞李博文程莹莹肖彩云李海成高升杰郭小森

一种玉米全基因组选择的液相育种芯片及应用: 本发明涉及生物信息学和基因组育种领域，涉及一种玉米全基因组选择的液相育种芯片及应用，所述玉米全基因组选择的液相育种芯片用于玉米品种选育，所述SNP位点包括SNP0001～SNP5851，芯片中包含经GWAS鉴定的多个性状...; 徐扬于广宁朱彩倩张宇翔周恺杨文艳徐辰武杨泽峰鲁月陈茹佳陶天云

墨脱新光唇鱼线粒体全基因组测序与系统发育分析: 2025年; 墨脱新光唇鱼(Neolissochilus hexagonolepis)属于雅鲁藏布江下游特有土著鱼类,具备良好的产业化开发前景。本研究测定了墨脱新光唇鱼的线粒体基因组全序列,并对其进行系统发育分析。结果表明:墨脱新光唇鱼线粒体基因组的大小为16562 bp,包含13个蛋白编码基因(protein-coding genes,PCGs)、22个转运RNA(transfer RNAs,tRNAs)基因、2个核糖体RNA(ribosomal RNAs,rRNAs)基因和1个控制区(displacement-loopregion,D-loop);碱基组成表现出明显的AT偏好性;13个PCGs仅nad6基因位于L链上,含量最高的氨基酸是亮氨酸(16.58%);除tRNASer(GCT)缺少DHU臂以外,其他21个tRNA基因都能形成典型的三叶草结构;D-loop区识别出3个结构域:终止序列区(termination associated sequence,TAS)、中央保守区(central conserved domain,CD)和保守序列区(conserved sequence block,CSB);基于线粒体全基因组序列和线粒体细胞色素c氧化酶第1亚基(cytochrome c oxidase subunit 1,cox1)基因序列构建系统发育树,验证了墨脱新光唇鱼的系统发育地位及其分类符合新光唇鱼属(Neolissochilus)的特征。研究结果发现,雅鲁藏布江下游的墨脱新光唇鱼与印度的墨脱新光唇鱼遗传距离大于2.00%,分子水平差异较大,对两个种群是否为同一物种提出疑问。该研究为雅鲁藏布江下游流域墨脱新光唇鱼的分类鉴定、系统进化及资源保护等提供了参考依据。; 杨培灿韩学凯张驰; 关键词：线粒体基因组系统进化

花生开花时间的全基因组关联分析及候选基因筛选: 2025年; 开花时间是评价花生早熟品种的重要指标之一,对产量亦有重要影响。挖掘花生开花时间相关遗传位点并筛选候选基因,对于花生早熟育种至关重要。本文以390份花生栽培种自然群体为材料,统计了在5种环境下的开花时间。表型统计结果显示,5种环境下,花生开花时间的变异系数介于3.21%~8.54%之间,存在较丰富的表型变异。花生的开花时间基本呈现正态分布,且受环境影响较大。通过全基因组关联分析,共得到259个与开花时间显著关联的SNP位点,其中有29个位点在2个以上环境中重复出现,分别位于A01、A02、A03、A04、A05、A07、A10、B01、B02、B03、B04、B06、B07、B09染色体上,可解释3.47%~8.58%的表型变异。在29个重复出现位点上下游100kb的置信区间寻找候选基因,共发现159个有功能注释的基因。在重复检测的位点的候选区间中预测到7个与花生开花时间相关的候选基因,分别编码R2R3-MYB转录因子、叶绿素a-b结合蛋白、bHLH转录因子、WRKY转录因子、FAR1转录因子。研究结果可为解析花生开花调控遗传机制及花生早熟育种奠定基础。; 李文佳廖泳俊黄璐鲁清李少雄陈小平金晶炜王润风; 关键词：花生开花时间全基因组关联分析候选基因

一株多重耐药性单增李斯特菌全基因组分析: 2025年; 目的从甘肃省市售冷冻鸡肉中分离到一株单增李斯特菌,分析其血清型、耐药表型及其基因组特征。方法玻片凝集法进行血清学鉴定,微量肉汤法分析菌株对8种抗生素敏感性,测序分析其基因组特征。结果该菌株经过16srDNA种属鉴定为单增李斯特菌,为1/2a血清型,系统发育谱系Ⅱ、亚系SL 155、克隆群CC 155、MLST 705、cgMLST 13240。对氨苄西林、青霉素、万古霉素、美罗培南4种抗生素敏感,对红霉素、环丙沙星、四环素和复方新诺明4种抗生素多重耐药。同时携带aph(3')-Ⅲ、ant(6)-Ia、dfrG、fosX、lnu(B)、lsa(E)、erm(B)、tet(S)和tet(M)9种耐药基因,携带LIPI-1的5个毒力基因,prfA基因缺失,携带12种内化素基因,未检测到inlA基因携带提前终止密码子,不携带LIPI-3和LIPI-4。结论该菌携带丰富的毒力基因和耐药基因,其耐药表型与耐药基因基本一致,表现出多重耐药,为李斯特菌病的防治提供参考依据。; 方小丽张璟; 关键词：单增李斯特菌毒力基因耐药表型耐药基因

一种水稻全基因组选择辅助育种的决策支持系统、方法: 本发明涉及生物信息学领域，尤其涉及一种水稻全基因组选择辅助育种的决策支持系统、方法。内容包括：采集水稻样本的基因组数据、环境数据和时间序列数据，构建多维特征关联矩阵，推导基因组数据随时间的变化情况，并更新基因组数据，基于...; 张静孙明茂孙洪江

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