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基于主成分分析的亲缘系数估计方法: 刘桐炎

用亲缘系数法分析小麦骨干亲本鲁麦14的育种价值被引量：2: 2022年; 鲁麦14是20世纪80年代由烟台市农业科学研究院选育而成的集丰产性、适应性、抗逆性于一体的优良品种。截止2020年以该品种作为亲本共育成213个品种,育成的品种通过了国家及山东、山西等13省、直辖市的审定。本文作者分析了这213个品种,计算了育成品种与鲁麦14的亲缘系数,亲缘系数之和为60.3125,表明鲁麦14为小麦育种工作做出了突出贡献。; 冯烨宏卫杰华则科郑建鹏于经川盖玉辉姜鸿明邱少芬孙晓辉; 关键词：亲缘系数骨干亲本育种价值

用亲缘系数法评价烟农系列小麦种质的育种价值被引量：1: 2021年; 烟农系列小麦是以烟台市农业科学研究院育成的高产品种‘蚰包’为亲本育成的21个优异小麦种质,含有较多的优良性状和优异基因。基于该系列种质育成的审(认)定小麦品种达374个,遍布山东、山西、陕西、四川、江苏、安徽、河南、河北、甘肃、湖北、青海、北京、天津、新疆、宁夏、内蒙古等省(市、自治区),为全国的小麦育种作出了突出贡献。为了明确该系列种质的育种价值,以更加科学地进行亲本选配和研究,提高小麦育种效率,本研究采用亲缘系数法对这21个烟农系列小麦种质的育种贡献值进行了分析。结果表明,有7个种质育成的品种数达到10个及以上,其中,‘鲁麦14’‘鲁麦13’‘烟农19’育成品种数分别为163、67、50个,育种贡献值分别达60.313、25.188、24.750;‘鲁麦21’‘烟农15’育成品种数分别为22、21个,育种贡献值分别为13.375、9.500;‘烟辐188’‘烟1934’育成品种数均为10个,育种贡献值分别为4.000、1.875。本研究结果可为今后合理利用烟农系列小麦种质选育优良小麦品种提供指导。; 郭对田冯烨宏郑建鹏殷岩严美玲李林志辛庆国姜鸿明孙晓辉刘民晓; 关键词：亲缘系数育种价值

亲缘系数分析法在麦类作物遗传多样性分析中的应用: 2021年; 遗传多样性研究是作物育种的基础性工作,对优异亲本选择、优良种质挖掘具有重要的参考价值。而亲缘系数法是评价遗传多样性的简易方法。当研究对象为高度自花授粉作物,其谱系信息也相对完整时,利用亲缘系数分析法得到的遗传多样性分析结果与利用分子标记法所得到的分析结果具有较好的一致性,因此亲缘系数法广泛应用于麦类作物遗传多样性分析。基于此,综述利用亲缘系数法对麦类作物进行遗传多样性分析的研究报道,为相关研究提供有益参考。; 李健; 关键词：亲缘系数麦类作物

基于RAD-seq简化基因组测序估算狼山鸡分子亲缘系数和近交系数被引量：9: 2019年; 为准确度量狼山鸡保种群体的近交统计量,并比较不同算法在近交统计量度量中的可靠性,研究以国家级地方鸡种基因库保存的狼山鸡为研究对象,通过RAD-seq简化基因组测序获得高密度SNP信息,并计算两种分子亲缘系数(kin1和kin2)和四种分子近交系数(FROH、FGRM、FHOM和FUNI)。结果表明:kin1对系谱记录中全同胞、半同胞的检出率较高(93/117);FGRM、FHOM和FUNI三种分子近交系数两两之间极显著相关(P<0.01),FROH(FROH>100、FROH>1 000和FROH>3 000)与FGRM、FHOM和FUNI的相关系数较低,仅FROH>100与FHOM达到极显著正相关(P<0.01)。基于高密度SNPs估算的kin1为较准确的狼山鸡分子亲缘系数,可用于狼山鸡保种群的系谱校正;高密度SNP标记有利于检测到短的ROH,同时提高FROH与FGRM、FHOM和FUNI的正相关性。; 曹愉夏韩威李国辉邹剑敏薛倩张会永殷建玫朱云芬苏一军王克华; 关键词：狼山鸡

青藏高原青稞育成品种的亲缘系数分析被引量：5: 2019年; 【目的】分析青藏高原青稞育成品种的遗传多样性,评估其遗传基础,探索拓宽其遗传基础的对策,推动青稞新品种选育工作。【方法】以1950s后,影响力高、推广面积大的105个藏区青稞育成品种和3个引进品种为研究对象,采用亲缘系数分析法分析参试品种的遗传基础,进而以亲缘系数为基础,采用兰氏距离、类平均法对参试品种进行聚类分析;采用累积直系亲缘系数,筛选藏区主要骨干亲本。【结果】18.01%的品种组合间存在亲缘关系,各组合亲缘系数的变异范围为0.000-0.750,组合平均亲缘系数为0.053,显著高于中国大麦主栽品种以及北美大麦品种。根据参试品种的育成时间,以十年为期,将参试品种划分为7个时期,1970s和1980s 2个时期,参试育成品种的组合平均亲缘系数较高,分别达到0.115和0.107;1990s和最近十年,参试育成品种的组合平均亲缘系数较低,分别为0.040和0.032。西藏自治区、青海省、四川省、甘肃省的参试育成品种数分别为48、27、17和12个;甘肃省的参试育成品种组合平均亲缘系数最高,达到0.220,西藏自治区、青海省、四川省的参试育成品种组合平均亲缘系数较为接近,分别为0.094、0.122和0.138。聚类分析的结果显示,参试品种聚为7类,Ⅱ、Ⅲ类群共包含25个参试品种,各类群的组合平均亲缘系数较低;其他5个类群共包含83个参试品种,各类群的组合平均亲缘系数较高。40个参试品种的累积直系亲缘系数大于0,其中9个育成品种是藏区青稞的重要骨干亲本,其衍生了67个参试品种。9个骨干亲本及其67个衍生种占参试育成品种总量的72.38%。1960s,骨干亲本及其衍生种的数量占该时期参试品种总量的41.76%,之后的4个时期,骨干亲本及其衍生种的数量占各时期参试育成品种总量的比例分别达到80.00%、80.77%、76.47%和72.22%;最近十年,该指标虽有所下降,但仍然高达68.75%。对于西藏; 李健丰先红蔡一林; 关键词：青藏高原青稞育成品种亲缘系数

基于亲缘系数的高油酸花生骨干亲本开选016的育种价值分析被引量：19: 2018年; 为评价高油酸花生骨干亲本开选016的育种价值,在介绍开选016的创制与特点的基础上,利用亲缘系数(COP)与聚类分析的方法,对开选016衍生的23个高油酸花生品种(系)进行遗传多样性分析。结果表明,19个高油酸花生品种(系)与开选016的COP为0. 5; 23个高油酸花生品种(系)共组成253对组合,品种(系)间COP为0. 125~0. 562 5,平均值为0. 276 99,品种间尤其是同一系列品种间的COP较高;基于COP的聚类分析在欧氏距离值1. 0水平上,将开选016衍生的23个高油酸花生品种(系)聚为9个类群,其中开农310、开农301和开农H03-3各自聚为一个类群,其余20个品种(系)聚为6个不同的类群。综合分析,开选016为适应性广、配合力高的优异高油酸花生种质,具有较高的育种价值,加强开选016及其衍生品种(系)与其他优异品种的组配利用,对选育高油酸花生新品种、提高遗传多样性具有重要意义。; 谷建中郭敏杰邓丽任丽苗建利殷君华李阳; 关键词：亲缘系数骨干亲本育种价值

探索母猪基因组DNA甲基化相似性与亲缘系数的关系: 在哺乳动物中，DNA甲基化（DNA methylation）主要发生在胞嘧啶和鸟嘌呤二核苷酸（CpG）上，它作为真核生物调控基因表达的主要方式之一，在基因转录调控、遗传物质稳定、基因组印记、X染色体失活和胚胎发育等方面发...; 李斌; 关键词：母猪单核苷酸多态性亲缘系数表观遗传学

基于Web的肉羊信息管理系统中亲缘系数及近交系数的程序设计与实现: 肉羊计算机辅助育种工作。需建立在系统、规范化的羊场生产管理模式下,大量累积数据基础上。本文在肉羊生产管理实现信息化的前期工作基础上,进一步开展育种分析,从近交系数和亲缘系数入手,采用亲缘协方差法,设计程序,按照获取简明系...; 涂远璐邹建香白云峰冯国兴; 关键词：亲缘系数信息管理系统

基于Web的肉羊信息管理系统中亲缘系数及近交系数的程序设计与实现被引量：2: 2016年; 肉羊计算机辅助育种工作需建立在系统、规范化的羊场生产管理模式下,大量累积数据基础上。本文在肉羊生产管理实现信息化的前期工作基础上,进一步开展育种分析,从近交系数和亲缘系数入手,采用亲缘协方差法,设计程序,按照获取简明系谱、对系谱排序、计算亲缘协方差矩阵三步骤计算。该方法的特点在于无需人工做系谱图,查找共同祖先,绘制通径线,易于计算机编程求解,且与生产管理系统结合可实现全程自动批量运算,简捷、快速,把育种工作者从繁琐的劳动中解放出来,可有效提高育种工作效率。; 涂远璐邹建香白云峰冯国兴; 关键词：近交系数亲缘系数信息管理系统

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